Hücre zarı proteinlerinin izolasyonunda kullanılan yöntemler, proteinlerin zarla olan etkileşim tipine göre farklılık gösterir. Yapılan bir deneysel çalışmada; izole edilen bir proteinin yüksek iyonik şiddetli çözeltilerle () veya ekstrem değişimleriyle () zardan ayrılmadığı, ancak deterjan kullanımıyla zardan sökülebildiği saptanmıştır. Ayrıca bu proteinin sadece hücre dışı ortamla temas halinde olduğu ve fosfolipaz C muamelesiyle hücre yüzeyinden serbest kaldığı gözlenmiştir.
Buna göre, bu proteinin yapısal özellikleri ve zarla olan ilişkisiyle ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?
- APolipeptit zinciri lipid çift katmanını boydan boya geçen bir transmembran proteindir.
- BZarın sitoplazmik yüzeyinde bulunan ve hücre iskeletine kovalent olmayan bağlarla tutunan bir periferal proteindir.
- Bir lipid çapası (glikozilfosfatidilinozitol) aracılığıyla zara tutunmuş bir integral proteindir.Cevap
- DSadece zayıf elektrostatik etkileşimlerle zarın dış yüzeyine tutunmuş bir periferal proteindir.
- EAmino asit zinciri üzerinden palmitoilasyon yoluyla iç yaprağa sabitlenmiş bir proteindir.
Cevap
İncelenen protein, bir glikozilfosfatidilinozitol (GPI) çapası aracılığıyla zara tutunmuş bir integral proteindir.
Deterjan kullanımı gerektirmesi bu proteinin bir 'integral protein' olduğunu gösterir; çünkü sadece iyonik şiddet veya pH değişimiyle (periferal proteinler gibi) zardan ayrılamamaktadır. Hücre zarının dış yüzeyinde bulunması ve fosfolipaz C (PLC) enzimi ile serbest bırakılabilmesi, bu proteinin spesifik olarak bir glikozilfosfatidilinozitol (GPI) çapası ile zara tutunduğunu kanıtlar. PLC enzimi, bu çapayı oluşturan fosfatidilinozitol halkasını parçalayarak proteini yüzeyden ayırır.
Adım Adım Çözüm
Anahtar Kavram
Membran proteinlerinin zara tutunma mekanizmaları ve izolasyon karakteristikleri