Soru

Zorluk: ZorKoenzimler ve Kofaktörler

Enzimlerin tam fonksiyonel yapısı olan holoenzimler; apoenzim olarak adlandırılan protein kısmı ile protein yapısında olmayan kofaktör kısmından oluşur. Organik yapıdaki kofaktörler olan koenzimler, enzime bağlanma stratejilerine göre iki sınıfa ayrılır: Enzime çok sıkı (bazı durumlarda kovalent) bağlanan ve reaksiyon boyunca enzimden ayrılmayan 'prostetik gruplar' ile reaksiyon sırasında enzimle etkileşip daha sonra enzimden ayrılan 'kosubstratlar' (geçici koenzimler).

Buna göre, aşağıdaki enzim-yardımcı molekül eşleşmelerinden hangisinde yardımcı molekül bir kosubstrat (geçici koenzim) olarak görev yapmaktadır?

  1. A
    Süksinat dehidrogenaz — FADFAD
  2. B
    Alanin aminotransferaz — Piridoksal fosfat (PLPPLP)
  3. Alkol dehidrogenaz — NAD+NAD^+Cevap
  4. D
    Piruvat dehidrogenaz — Tiamin pirofosfat (TPPTPP)
  5. E
    Karbonik anhidraz — Zn2+Zn^{2+}

Cevap

Alkol dehidrogenaz reaksiyonunda kullanılan NAD+NAD^+, bir kosubstrat (geçici koenzim) olarak işlev görür.
Alkol dehidrogenaz reaksiyonunda NAD+NAD^+ (veya NADP+NADP^+), enzime bir substrat gibi bağlanır, kimyasal değişikliğe uğrar (indirgenir) ve ardından enzimden ayrılır. Bu tür geçici etkileşim kuran koenzimlere 'kosubstrat' denir. Diğer seçeneklerdeki moleküller enzimin kalıcı bir parçası gibi davranan prostetik gruplardır.

Adım Adım Çözüm

1
Koenzimlerin bağlanma türlerini belirle.
Prostetik gruplar enzime kalıcı/sıkı bağlanırken, kosubstratlar reaksiyon sırasında bağlanıp ayrılır.
Soru, hangi eşleşmenin 'kosubstrat' tanımına uyduğunu sorgulamaktadır.
2
Seçeneklerdeki enzim-koenzim ilişkilerini analiz et.
FADFAD (Süksinat dehidrogenazda kovalent), PLPPLP (Schiff bazı), TPPTPP ve Zn2+Zn^{2+} (metalloenzim) enzime sıkıca bağlıdır.
Bu moleküllerin enzimden ayrılmadan kataliz döngüsünü tamamlaması, onları prostetik grup yapar.
3
Nikotinamid koenzimlerinin (NAD+/NADHNAD^+/NADH) karakterini değerlendir.
Alkol dehidrogenaz gibi enzimlerde NAD+NAD^+, substratla birlikte enzime bağlanır ve reaksiyon sonunda NADHNADH olarak ayrılır.
Bu geçici etkileşim, NAD+NAD^+'nın bir kosubstrat olduğunu doğrular.

Anahtar Kavram

Koenzimler, bağlanma sıkılıklarına göre prostetik gruplar (sıkı/kalıcı) ve kosubstratlar (geçici/ayrılabilir) olarak sınıflandırılır.
Bu soruyu puanla