Retrovirüslerin, özellikle de HIV-1'in replikasyon döngüsünde ve gen ekspresyonunda merkez… — TUS - Tıpta Uzmanlık Sınavı

Retrovirüslerin, özellikle de $HIV-1$ 'in replikasyon döngüsünde ve gen ekspresyonunda merkezi rol oynayan LTR (Long Terminal Repeat) bölgelerinin yapısal ve fonksiyonel organizasyonu ile ilgili aşağıdakilerden hangisi yanlıştır?

A
Transkripsiyon, $5'$ LTR bölgesindeki $U3$ ve $R$ segmentlerinin birleşme noktasından başlar.
B
Transkripsiyonun sonlanmasını ve mRNA'nın işlenmesini sağlayan polyadenilasyon sinyali ( $AAUAAA$ ), $R$ bölgesinde yer alır.
C
Konak hücreye ait transkripsiyon faktörleri (örneğin $NF-\kappa B$ ve $Sp1$ ) için bağlanma bölgeleri $U3$ segmentinde bulunur.
D
Tat proteininin bağlandığı "TAR" (Tat-response element) dizisi, transkripsiyon başlangıcının hemen aşağısında ( $R$ bölgesi) sentezlenen RNA üzerindedir.
Viral genomun kapsid içerisine paketlenmesini sağlayan "Psi" ( $\psi$ ) sinyali, $5'$ LTR içerisindeki $U5$ bölgesinin nükleotit dizileri tarafından oluşturulur.Cevap

Cevap

Viral genomun paketlenmesini sağlayan Psi (

\psi

) sinyali, LTR bölgesinin içinde değil,

5'

LTR'den sonra gelen lider dizide yer almaktadır.

Retrovirüslerde (özellikle

HIV-1

) paketleme sinyali olan "Psi" (

\psi

), viral RNA'nın kapsid içine seçici olarak alınmasını sağlar. Bu sinyal,

5'

LTR'nin hemen aşağısında (downstream), lider dizi (5' UTR) içinde, genellikle

U5

ile

gag

geni başlangıç kodonu arasında bulunur. Dolayısıyla bu sinyalin LTR'nin (

U5

bölgesi) içinde yer aldığı ifadesi yanlıştır.

Adım Adım Çözüm

LTR yapısını analiz et

Retroviral LTR;

U3

(Unique 3'),

R

(Repeat) ve

U5

(Unique 5') olmak üzere üç alt birimden oluşur.

LTR'nin fonksiyonel haritasını çıkarmak için alt birimlerin yerini bilmek gerekir.

Transkripsiyon kontrol noktalarını belirle

Transkripsiyon

5'

LTR'deki

U3/R

sınırında başlar ve mRNA'nın başına

R

dizisi gelir. Enhancer ve promotör dizileri

U3

içerisindedir.

Viral RNA sentezinin nasıl başladığını anlamak seçenekleri değerlendirmeyi sağlar.

Paketleme sinyalinin (Psi) konumunu doğrula

Psi (

\psi

) sinyali,

5'

LTR'nin bitiminden (

U5

'in sonu) hemen sonra,

gag

geni başlamadan önceki nükleotit dizilerindedir.

Lider dizinin (leader sequence) LTR'den ayrı bir fonksiyonel birim olduğunu saptamak hatalı seçeneği buldurur.

Anahtar Kavram

Retroviral LTR Organizasyonu ve Fonksiyonel Segmentleri

Tahmini Süre:2m 0s

Soru

Cevap

Adım Adım Çözüm

Anahtar Kavram

Sık Yapılan Hatalar

Konular

Bu konudan daha fazla soru