Soru

Zorluk: Çok zorRetrovirüsler

HIV1HIV-1 replikasyon döngüsünde, proviral DNADNA'dan viral RNARNA sentezi sırasında RNARNA polimeraz II'nin promotör bölgesinde duraksamasını (pausingpausing) engelleyerek transkripsiyonel elongasyonun (uzama) verimliliğini yaklaşık 1000 kat artıran temel mekanizma aşağıdakilerden hangisidir?

  1. TatTat proteininin yeni sentezlenen mRNAmRNA'nın 5' ucundaki TARTAR (transtrans-activation response) dizisine bağlanarak PTEFbP-TEFb kompleksini bölgeye çekmesiCevap
  2. B
    TatTat proteininin proviral DNADNA üzerindeki LTRLTR bölgesinde yer alan hızlandırıcı (enhancerenhancer) dizilere doğrudan bağlanarak transkripsiyonu başlatması
  3. C
    RevRev proteininin viral mRNAmRNA üzerindeki RRERRE (RevRev response element) dizisine bağlanarak splays edilmemiş transkriptlerin çekirdek dışına çıkışını sağlaması
  4. D
    NefNef proteininin konak hücreye ait CD4CD4 ve MHCIMHC-I moleküllerini internalize ederek viral replikasyon için gereken hücresel ortamı hazırlaması
  5. E
    VprVpr proteininin pre-integrasyon kompleksine (PICPIC) eşlik ederek viral genomun çekirdek porlarından içeri girmesini kolaylaştırması

Cevap

TatTat proteininin sentezlenen viral mRNAmRNA'nın 5' ucundaki TARTAR dizisine bağlanarak PTEFbP-TEFb kompleksini (Siklin T1 ve CDK9) aktive etmesi ve RNARNA polimeraz II'yi fosforillemesi
Doğru cevapta belirtilen mekanizma HIV1HIV-1 replikasyonunun en kritik kontrol noktalarından biridir. TatTat proteini sentezlendiğinde, çekirdeğe geri döner ve viral mRNAmRNA'nın 5' ucundaki TARTAR yapısına bağlanır. Bu bağlanma, PTEFbP-TEFb kompleksinin (Siklin T1 ve CDK9CDK9) bölgeye mobilize olmasını sağlar. CDK9CDK9 kinazı, RNARNA polimeraz II'nin büyük alt biriminin karboksil terminal ucunu (CTDCTD) fosforilleyerek polimerazın DNADNA üzerinde takılmadan (duraksamadan) ilerlemesini sağlar. Bu süreç, viral gen ekspresyonunu bin katına kadar artırarak 'viral fırtına' veya hızlı replikasyon fazını başlatır.

Adım Adım Çözüm

1
HIV1HIV-1 transkripsiyonunun başlangıcını analiz et
LTRLTR promotöründen başlayan transkripsiyon, TatTat yokluğunda kısa süre sonra (yaklaşık 60 nükleotid sonra) duraksar.
RNARNA polimeraz II, TatTat proteini yardımı olmadan etkin bir elongasyon yapamaz.
2
TatTat proteininin hedef yapısını belirle
TatTat, sentezlenen nâsent RNARNA'nın 5' ucunda oluşan kararlı bir gövde-ilmek (stemloopstem-loop) yapısı olan TARTAR dizisine bağlanır.
TatTat, klasik transkripsiyon faktörlerinin aksine DNADNA'ya değil, RNARNA'ya bağlanarak etki gösterir.
3
TatTat-TARTAR etkileşiminin sonucunu değerlendir
TatTat, bölgeye PTEFbP-TEFb (Positive Transcription Elongation Factor bPositive \ Transcription \ Elongation \ Factor \ b) kompleksini (Siklin T1 ve CDK9) toplar.
CDK9CDK9, RNARNA polimeraz II'nin CC-terminal domainini (CTDCTD) fosforilleyerek enzimi duraksama fazından çıkarır.

Anahtar Kavram

TatTat (Trans-activator of transcription) proteini, RNARNA bağlayıcı bir regülatördür ve RNARNA polimeraz II'nin elongasyon verimliliğini artırarak üretken enfeksiyonu sağlar.
Bu soruyu puanla