Soru

Zorluk: OrtaRNA Virüsleri

Bir kış tatil beldesindeki otelde konaklayan çok sayıda tatilcide ani başlayan şiddetli bulantı, kusma ve sulu diyare şikayetleri gelişmiştir. Yapılan laboratuvar incelemeleri sonucunda etkenin Caliciviridae ailesinden, zarfsız ve tek iplikli RNA genomuna sahip bir virüs (Norovirüs) olduğu saptanmıştır. Bu virüsün genomik özellikleri ve replikasyon stratejisi ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. A
    Virion yapısında, enfeksiyonun başlangıcında kullanılmak üzere hazır RNA-bağımlı RNA polimeraz enzimi bulundurması zorunludur.
  2. Viral genom pozitif polariteli olduğu için hücreye girdikten sonra doğrudan mRNA gibi davranarak konak hücre ribozomlarında translasyona uğrayabilir.Cevap
  3. C
    Replikasyon döngüsünün temel basamakları konak hücresinin çekirdeğinde gerçekleşir.
  4. D
    Zarflı bir virüs olduğu için deterjan, eter ve kuruluk gibi dış ortam koşullarına oldukça duyarlıdır.
  5. E
    Genomu segmentli yapıda olduğu için genetik reassortment (yeniden düzenlenme) yoluyla antijenik değişim sergiler.

Cevap

Viral genomun pozitif polariteli olması sayesinde doğrudan bir mRNA gibi davranarak konak hücre ribozomlarında translasyona uğrayabilmesi doğrudur.
Pozitif polariteli RNA virüslerinin (Picornaviridae, Caliciviridae, Flaviviridae, Togaviridae, Coronaviridae vb.) genomu, konak hücresinin mRNA'sı ile aynı polaritededir. Bu sayede virüs hücreye girdikten sonra genomu doğrudan ribozomlara tutunur ve viral proteinlerin (ve RdRp enziminin) sentezi için kalıp görevi görür.

Adım Adım Çözüm

1
Etkeni ve temel sınıflandırmasını tanımla.
Etken Norovirüs'tür (Caliciviridae ailesi); pozitif polariteli, tek iplikli, zarfsız bir RNA virüsüdür.
Soru kökündeki klinik tablo ve verilen bilgiler bu sınıflandırmaya işaret eder.
2
Pozitif polariteli RNA virüslerinin replikasyon mekanizmasını analiz et.
Pozitif polariteli (+)ssRNA genomu, 5' ucunda şapka (cap) veya Vpg proteini taşır ve konak hücresinin mRNA'sı ile aynı yöndedir.
Bu yapı, genomun bir ara basamağa ihtiyaç duymadan doğrudan ribozomlara bağlanmasını sağlar.
3
Enzim ihtiyacını değerlendir.
Virion içinde RNA-bağımlı RNA polimeraz (RdRp) taşımasına gerek yoktur çünkü bu enzim virüs hücreye girdikten sonra ilk sentezlenen proteinler arasındadır.
Genom mRNA gibi çalıştığı için polimeraz sentezi translasyonla hemen gerçekleşebilir.

Anahtar Kavram

RNA Virüslerinde Polarite ve Replikasyon Stratejisi

İpuçları

1
Virüsün genomunun mRNA ile aynı yönde (polaritede) olup olmadığını düşünün.
Tahmini Süre:1m 15s
Bu soruyu puanla