Soru

Zorluk: ZorGen İfadesinin Düzenlenmesi

Ökaryotik hücrelerde gen ifadesinin kontrolünde histon modifikasyonları merkezi bir rol oynar. Histon H3H3 ve H4H4 kuyruklarındaki lizin kalıntılarının asetillenmesi, genellikle gevşek kromatin yapısı (ökromatin) ve aktif transkripsiyon ile ilişkilidir. Bu asetillenmiş bölgeler, belirli proteinlerin kromatini tanıması ve bağlanması için "bağlanma bölgeleri" (dockingdocking sitessites) işlevi görür. Buna göre; asetillenmiş lizin kalıntılarını spesifik olarak tanıyan ve transkripsiyonel koaktivatörler ile kromatin yeniden düzenleme komplekslerinde sıklıkla bulunan protein domaini aşağıdakilerden hangisidir?

  1. BromodomainCevap
  2. B
    Chromodomain
  3. C
    PHD finger
  4. D
    Tudor domain
  5. E
    SH2 domain

Cevap

Bromodomain, asetillenmiş lizin kalıntılarını spesifik olarak tanıyan protein domainidir.
Bromodomain, yaklaşık 110 amino asitlik bir motif olup asetillenmiş lizin kalıntılarını tanıyan tek ana protein domainidir. Histon asetilasyonu (HAT enzimlerince yapılır) gen ifadesini artırırken, bu asetil gruplarına bromodomain içeren proteinlerin bağlanması transkripsiyon mekanizmasının o bölgeye toplanmasını sağlar.

Adım Adım Çözüm

1
Histon asetilasyonunun biyokimyasal sonucunu değerlendir.
Histon asetiltransferazlar (HAT) tarafından eklenen asetil grupları, lizinlerin pozitif yükünü nötralize ederek kromatini gevşetir.
Gevşek kromatin yapısı transkripsiyon faktörlerinin DNA'ya erişimini kolaylaştırır.
2
Asetillenmiş bu bölgeleri tanıyan 'okuyucu' (reader) proteinleri tanımla.
Asetil-lizin kalıplarını tanıyan spesifik motif 'Bromodomain'dir.
Bromodomain içeren proteinler (örneğin TAFII250 veya SWI/SNF bileşenleri) bu bölgelere bağlanarak transkripsiyonu başlatır.
3
Diğer 'okuyucu' domainler ile karşılaştırma yap.
Chromodomain, PHD finger ve Tudor domainleri metillenmiş kalıntıları tanırken; SH2 domaini fosfotirozini tanır.
Post-translasyonel modifikasyonların her biri farklı ve spesifik protein domainleri tarafından tanınır.

Anahtar Kavram

Histon Kodu ve Okuyucu Domainler

Daha Fazla Pratik

Histon Deasetilaz (HDAC) inhibitörlerinin kanser tedavisindeki mekanizmasını ve gen ifadesi üzerindeki etkilerini inceleyebilirsiniz.
Tahmini Süre:1m 30s
Bu soruyu puanla