Soru

Zorluk: OrtaGen İfadesinin Düzenlenmesi

Ökaryotik hücrelerde gen ifadesinin düzenlenmesinde görev alan transkripsiyon faktörlerinin DNA üzerindeki spesifik dizilere bağlanmasını sağlayan bölgeleri (DNA-bağlayıcı domainler), karakteristik yapısal motifler içerir. Özellikle steroid hormon reseptörleri, tiroid hormon reseptörü ve kalsitriol (DD vitamini) reseptörü gibi nükleer reseptör ailesi üyelerinde bulunan; bir çinko iyonunun (Zn2+Zn^{2+}) sistein ve histidin kalıntıları ile koordinasyonu sonucu oluşan yapısal motif aşağıdakilerden hangisidir?

  1. Çinko parmak (Zinc finger)Cevap
  2. B
    Lösin fermuar (Leucine zipper)
  3. C
    Heliks-dönüş-heliks (Helix-turn-helix)
  4. D
    Bazik heliks-ilmek-heliks (bHLH)
  5. E
    Homeodomain (Homeokutu)

Cevap

Çinko parmak (Zinc finger) motifi, nükleer reseptörlerde bir metal iyonunun koordinasyonu ile oluşan temel DNA bağlama motifidir.
Çinko parmak (Zinc finger) motifi, transkripsiyon faktörlerinin DNA'nın büyük oluğuna (majorgroovemajor\,groove) bağlanmasını sağlayan, çinko atomunun sistein ve histidin kalıntıları ile koordinasyonu sayesinde stabilize olan karakteristik bir ökaryotik motiftir. Steroid hormon reseptörleri bu yapıyı kullanan en klasik örneklerdir.

Adım Adım Çözüm

1
Soruda tanımlanan reseptör grubunu tanımla.
Steroid ve tiroid hormon reseptörleri nükleer reseptör ailesine aittir.
Bu reseptörler DNA'ya bağlanan transkripsiyon faktörleri olarak işlev görür.
2
Yapısal stabilitenin nasıl sağlandığını analiz et.
Stabilitenin bir çinko iyonu (Zn2+Zn^{2+}) ve sistein/histidin kalıntıları ile sağlandığı belirtilmiştir.
Çinko parmak motifi, çinkonun 4 sistein veya 2 sistein-2 histidin ile koordinasyonu ile oluşur.
3
Diğer yapısal motiflerle karşılaştır.
Lösin fermuar hidrofobik bağlar, bHLH ise amino asit ilmekleri kullanır.
Yalnızca çinko parmak motifi bu spesifik metal iyonu bağımlı yapıya sahiptir.

Anahtar Kavram

Transkripsiyon faktörlerinin DNA bağlama motifleri ve nükleer reseptör yapısı.

Daha Fazla Pratik

Nükleer reseptörlerin 'çinko parmak' motifini kullanarak bağlandıkları spesifik DNA dizilerine ne ad verildiğini (HRE - Hormon Yanıt Elemanı) incelemek bu konuyu pekiştirecektir.
Tahmini Süre:50s
Bu soruyu puanla