Examkin

Soru

Zorluk: ZorPeptid Bağı ve Biyolojik Aktif Peptidler

Proteinlerin primer yapısını oluşturan peptid bağının atomik organizasyonu ve fizyolojik önemi olan spesifik peptidler değerlendirildiğinde, aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

  1. Peptid birimini oluşturan altı atom (CαC_\alpha, CC, OO, NN, HH ve komşu CαC_\alpha) koplanardır ve rezonans nedeniyle C−NC-N bağı etrafında serbest dönüş kısıtlanmıştır.Cevap
  2. B
    Hücrenin en önemli antioksidanlarından biri olan glutatyon tripeptidi, glutamatın α\alpha-karboksil grubu ile sisteinin amino grubu arasındaki standart peptid bağı aracılığıyla sentezlenir.
  3. C
    Peptid bağındaki C−NC-N mesafesi, rezonans etkisiyle tipik bir C−NC-N tekli bağından (1.45 A˚1.45 \text{ \AA}) daha uzun bir değer kazanarak bağın kararlılığını artırır.
  4. D
    Fizyolojik proteinlerde peptid bağları, yan zincirler (R grupları) arasındaki sterik etkileşimleri minimize etmek amacıyla hemen hemen her zaman 'cis' konfigürasyonunda bulunur.
  5. E
    Birer nöropeptid olan oksitosin ve vazopressin, hipofiz arka lobunda sentezlenen ve C-terminalinde serbest karboksil grubu bulunduran lineer peptidledir.

Cevap

Peptid birimini oluşturan altı atomun (CαC_\alpha, CC, OO, NN, HH ve komşu CαC_\alpha) aynı düzlemde yer alması ve C−NC-N bağının rezonans nedeniyle serbestçe dönememesi doğrudur.
Doğru olan ifade, peptid bağının rezonans hibrit yapısı nedeniyle C−NC-N bağı etrafında dönüşün kısıtlı olması ve bu bağ çevresindeki altı atomun (iki CαC_\alpha ve aradaki peptid grubu atomları) aynı düzlemde yer almasıdır. Bu rijit yapı protein katlanması için temel kısıtlayıcı faktördür.

Adım Adım Çözüm

1
Peptid bağının rezonans yapısını incele.
Azot üzerindeki ortaklanmamış elektron çifti karbonil grubu ile rezonansa girerek C−NC-N bağına %40 oranında çift bağ karakteri kazandırır.
Bu durum C−NC-N bağının dönmesini engeller ve bağı rijit bir düzleme hapseder.
2
Düzlemdeki atomları belirle.
İki ardışık CαC_\alpha atomu ile aradaki C,O,N,HC, O, N, H atomları (toplam 6 atom) aynı düzlemde (koplanar) dizilir.
Peptid grubunun geometrisi bu altı atomun konumu ile tanımlanır.
3
Diğer biyolojik aktif peptidlerin yapısal özelliklerini kontrol et.
Glutatyonun atipik γ\gamma-bağına, hormonların sentez yerlerine ve C-terminal amidasyonuna dikkat et.
Bu detaylar standart protein yapısından sapmaları belirlemek için gereklidir.

Anahtar Kavram

Peptid bağının rezonans hibrit karakteri ve koplanar atomik dizilimi

Daha Fazla Pratik

Peptid bağı düzlemleri arasındaki ϕ\phi (phi) ve ψ\psi (psi) açılarını ve Ramachandran grafiğini inceleyerek sekonder yapı oluşumunu pekiştirebilirsiniz.
Tahmini Süre:1m 40s
Bu soruyu puanla

Konular

Peptid Bağı ve Biyolojik Aktif Peptidler

Bu konudan daha fazla soru