Soru

Zorluk: Çok zorRibozomlar ve Proteazomlar

Ökaryotik hücrelerde protein homeostazının (proteostaz) sürdürülmesinde görev alan ribozomların yapısal organizasyonu ve ubiquitin-proteazom sisteminin (UPS) işleyiş mekanizması ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. 26S26S proteazom kompleksinin 19S19S düzenleyici ünitesi, polibubikitin zinciriyle işaretlenmiş substratları tanır ve ATP-bağımlı bir mekanizmayla proteinin üçüncül yapısını çözerek 20S20S çekirdek ünitesine translokasyonunu sağlar.Cevap
  2. B
    Ökaryotik 80S80S ribozomun büyük alt birimi (60S60S) sadece 18S18S rRNA molekülünü içerirken; küçük alt birim (40S40S) 5S5S, 5.8S5.8S ve 28S28S rRNA moleküllerinden oluşan bir komplekstir.
  3. C
    Granüllü endoplazmik retikulum (GER) zarına bağlı ribozomlar, protein sentezine doğrudan GER zarı üzerindeki reseptörlere tutunarak başlar ve sentezlenen tüm proteinleri translasyon tamamlandıktan sonra (post-translasyonel) GER lümenine aktarır.
  4. D
    Proteazomal sistemde hedef proteinlerin ubikitin ile işaretlenmesi (E1, E2, E3 enzimatik kaskadı) enerji gerektirmeyen pasif bir süreçtir; ATP harcanan tek aşama 20S20S çekirdek ünitesindeki peptit bağı hidrolizidir.
  5. E
    Ribozomların 40S40S ve 60S60S alt birimleri nükleolus içerisinde mRNA ile birleşerek fonksiyonel 80S80S kompleksi halini alır ve nükleer porlar aracılığıyla sitoplazmaya bu bütün halde transfer edilir.

Cevap

Proteazomun 19S düzenleyici ünitesinin ubikitinlenmiş proteinleri tanıması, ATP kullanarak yapılarını çözmesi ve 20S çekirdek ünitesine aktarması doğrudur.
Proteazomal sistemde 26S26S kompleksinin 19S19S ünitesi bir 'kapı bekçisi' gibi davranır. Polibubikitin zincirlerini tanır, proteini ubikitinden ayırır (deubiquitination) ve ATP enerjisi kullanarak proteinin üçüncül yapısını çözerek onu 20S20S çekirdek ünitesindeki proteolitik bölgeye iteler. Bu süreç protein homeostazı için temel bir enerji harcama noktasıdır.

Adım Adım Çözüm

1
Proteazom yapısını analiz et.
26S26S proteazom, bir 20S20S çekirdek ve iki 19S19S düzenleyici parçadan oluşur.
Yıkım sürecinin hangi parçada nasıl gerçekleştiğini anlamak için yapısal ayrım şarttır.
2
19S ünitesinin fonksiyonunu değerlendir.
19S ünitesindeki ATPazlar, proteinin katlanmış yapısını (unfolding) açmak için enerji harcar.
Hatalı proteinlerin dar olan 20S kanalına girebilmesi için lineer hale getirilmesi gerekir.
3
Ribozomal alt birim içeriklerini doğrula.
Ökaryotik 40S40S alt birimi 18S18S rRNA; 60S60S alt birimi ise 5S5S, 5.8S5.8S ve 28S28S rRNA içerir.
Yanlış seçeneklerdeki yapısal hataları elemek için moleküler kompozisyon bilinmelidir.
4
Protein sentezi ve taşıma mekanizmasını kontrol et.
GER'e bağlı sentez ko-translasyoneldir ve her zaman sitoplazmada başlar.
Sentezin başlangıç yeri ve zamanlaması hücre biyolojisinin temel bir ayrımıdır.

Anahtar Kavram

Ökaryotik hücrede proteinlerin kalitesi, ribozomların özelleşmiş sentez bölgeleri ve UPS sisteminin ATP bağımlı denetleyici (19S) ve yürütücü (20S) birimlerinin koordinasyonu ile korunur.
Bu soruyu puanla