Soru

Zorluk: ZorRetrovirüsler

İnsan immün yetmezlik virüsü tip-1 (HIV1HIV-1) enfeksiyonu sırasında, viral genlerin transkripsiyonel elongasyon (uzama) verimliliğini yaklaşık bin kat artıran ve diğer birçok transkripsiyon faktörünün aksine doğrudan DNADNA'ya değil, sentezlenen öncül viral RNARNA üzerindeki spesifik bir yapıya bağlanan viral protein aşağıdakilerden hangisidir?

  1. TatCevap
  2. B
    Rev
  3. C
    Nef
  4. D
    Vif
  5. E
    Vpu

Cevap

Viral transkripsiyonel elongasyonu artıran ve RNA üzerindeki TAR yapısına bağlanan protein Tat proteinidir.
Tat proteini, HIV-1 genomunun en güçlü trans-aktivatörüdür. En özgün özelliği, DNA şablonuna değil, yeni sentezlenmiş viral RNA'nın 5' ucunda oluşan TAR (trans-activation response) adı verilen ikincil yapıya (stem-loop) bağlanmasıdır. Bu bağlanma sayesinde transkripsiyonel elongasyon kompleksi stabilize edilir ve viral genlerin ifadesi dramatik şekilde artar.

Adım Adım Çözüm

1
Viral replikasyon döngüsünde transkripsiyonun kontrol basamağını analiz etme.
HIV-1 transkripsiyonunun başlangıçta (inisiasyon) verimli olduğu ancak elongasyonun zayıf olduğu belirlenir.
Tat proteini yokluğunda RNA polimeraz II genellikle kısa RNA parçaları sentezleyip duraklamaktadır.
2
Tat proteininin hedef bölgesini ve bağlanma özelliğini belirleme.
Tat proteininin, viral DNA'daki promotör dizisine değil, sentezlenmekte olan RNA'nın 5' ucunda oluşan TAR halkasına (stem-loop) bağlandığı saptanır.
Bu özellik, Tat'ı klasik DNA bağlayıcı transkripsiyon faktörlerinden ayıran kritik bir farktır.
3
Tat-TAR etkileşiminin sonucunu değerlendirme.
Bağlanma sonrası P-TEFb kompleksinin (CDK9 ve Siklin T1) bölgeye çekilmesiyle RNA polimeraz II'nin C-terminal ucu fosforillenir.
Fosforillenme, RNA polimerazın duraksamasını engeller ve tam boy viral RNA sentezini (elongasyon) sağlar.

Anahtar Kavram

Tat proteininin RNA tabanlı (TAR) trans-aktivasyon mekanizması.
Tahmini Süre:1m 30s
Bu soruyu puanla