Soru

Zorluk: ZorRetrovirüsler

HIV-1 ve HIV-2 arasındaki biyolojik farkları inceleyen bir moleküler viroloji çalışmasında; HIV-2'nin, dendritik hücreler ve makrofajlar gibi miyeloid seri hücrelerinde bulunan ve hücresel dNTPdNTP (deoksinükleozid trifosfat) havuzunu tüketerek viral DNA sentezini (revers transkripsiyonu) kısıtlayan SAMHD1 proteinini proteozomal yıkıma uğrattığı saptanmıştır.

Bu fonksiyonu yerine getiren ve HIV-1 genomunda karşılığı bulunmayan HIV-2 aksesuar proteini aşağıdakilerden hangisidir?

  1. A
    Vpu
  2. B
    Vif
  3. VpxCevap
  4. D
    Nef
  5. E
    Vpr

Cevap

HIV-2'ye özgü olan ve SAMHD1 proteinini proteozomal yıkıma uğratarak miyeloid hücrelerde replikasyonu sağlayan aksesuar protein Vpx'tir.
Vpx proteini, HIV-2'ye özgü bir aksesuar proteindir ve dendritik hücreler ile makrofajlarda bulunan SAMHD1 kısıtlayıcı faktörünü proteozomal yıkıma uğratarak virüsün bu hücrelerde revers transkripsiyon yapabilmesini sağlar.

Adım Adım Çözüm

1
HIV-1 ve HIV-2 genomik farklarının belirlenmesi
HIV-1'de vpuvpu geni bulunurken, HIV-2'de bu genin yerine vpxvpx geni bulunur.
Vpx, HIV-2'nin hücre tipine özgü kısıtlamaları aşmasını sağlayan temel farklardan biridir.
2
SAMHD1 kısıtlayıcı faktörünün mekanizmasının analizi
SAMHD1, bir fosfohidrolaz olarak dNTPdNTP havuzunu boşaltır ve revers transkripsiyonu engeller.
Miyeloid hücrelerin (makrofaj/DC) virüse dirençli olmasının temel nedenini anlamak.
3
Vpx proteininin etkisinin tanımlanması
Vpx, CRL4CRL4 ubiquitin ligaz kompleksi üzerinden SAMHD1'i işaretleyerek yıkılmasını sağlar.
Viral DNA sentezi için gerekli dNTPdNTP düzeylerini normale döndürmek.

Anahtar Kavram

HIV-2'ye özgü Vpx proteini, SAMHD1 kısıtlayıcı faktörünü (restriction factor) antagonize ederek miyeloid hücrelerde viral replikasyonu sağlar.
Tahmini Süre:1m 30s
Bu soruyu puanla