Soru

Zorluk: ZorRNA Virüsleri

RNA virüslerinin replikasyon stratejileri, genom yapılarına ve polaritelerine göre belirgin farklılıklar gösterir. Pozitif polariteli, tek iplikli, zarflı ve yaklaşık 3030 kb'lık büyük genomuyla karakterize bir virüsün replikasyon döngüsü incelendiğinde; genomun sadece 5′5' ucundaki genlerin doğrudan translasyonu ile RNA bağımlı RNA polimeraz gibi non-strüktürel proteinlerin sentezlendiği, strüktürel proteinlerin ise replikasyon sırasında oluşan "nested set" (iç içe geçmiş set) şeklindeki subgenomik mRNA'lar aracılığıyla üretildiği saptanmıştır.

Bu replikasyon stratejisine sahip olan virüs ailesi aşağıdakilerden hangisidir?

  1. CoronaviridaeCevap
  2. B
    Picornaviridae
  3. C
    Flaviviridae
  4. D
    Togaviridae
  5. E
    Retroviridae

Cevap

Coronaviridae ailesi, büyük genomu ve "nested set" subgenomik mRNA sentezleme mekanizması ile diğer pozitif polariteli RNA virüslerinden ayrılır.
Coronaviridae ailesi, RNA virüsleri arasında en geniş genomik yapıya (2727-3232 kb) sahip olan gruptur. Replikasyon stratejileri oldukça kendine hastır; nükleokapsid (NN), membran (MM) ve spike (SS) gibi strüktürel proteinlerini sentezlemek için replikasyon sırasında tam boy negatif polariteli kalıp üzerinden "nested set" (iç içe geçmiş set) adı verilen subgenomik mRNA'lar sentezlerler. Bu mRNA'ların hepsinin 3′3' uçları ortaktır ve aynı poly-A kuyruğuna sahiptirler, ancak 5′5' uçları farklı genleri kodlayacak şekilde farklılık gösterir.

Adım Adım Çözüm

1
Virüsün genom özelliklerini değerlendir.
Pozitif polariteli, tek iplikli RNA ve yaklaşık 3030 kb büyüklük.
Bu büyüklükteki bir genomun replikasyon hatasızlığı için özel enzimlere ihtiyacı vardır; bu büyüklük Coronaviridae için karakteristiktir.
2
Protein sentez stratejisini analiz et.
5′5' ucundan non-strüktürel protein sentezi ve subgenomik mRNA'lar üzerinden strüktürel protein sentezi.
Pozitif polariteli RNA virüsleri genomlarını doğrudan mRNA olarak kullanabilirler ancak Coronavirüsler strüktürel proteinlerin ifadesi için subgenomik dizileri tercih ederler.
3
"Nested set" kavramını tanımla.
Aynı 3′3' ucuna sahip ancak farklı uzunluklarda olan mRNA dizisi.
Bu yapı, virüsün farklı gen bölgelerini ayrı birimler halinde ifade etmesine olanak tanır.
4
Verilen özellikleri virüs aileleri ile eşleştir.
Coronaviridae en uygun seçenektir.
Picornaviridae ve Flaviviridae poliprotein kullanır, Togaviridae tek bir subgenomik RNA kullanır, Retroviridae ise revers transkripsiyon yapar.

Anahtar Kavram

Coronaviridae replikasyonunda subgenomik mRNA (nested set) sentezi

Daha Fazla Pratik

Coronaviridae ailesinin genomunda bulunan proofreading (hata düzeltme) özelliğine sahip ekzonükleaz aktivitesini inceleyiniz.
Tahmini Süre:2m 0s
Bu soruyu puanla