Examkin

Soru

Zorluk: Çok zorRNA Virüsleri

Filoviridae ailesinde yer alan Ebola virüsünün genomik yapısı incelendiğinde; virion yüzeyinde bulunan ana glikoproteinin (GPGP), salgılanan glikoproteinden (sGPsGP) farklı olarak, transkripsiyon sırasında viral RNA polimerazın belirli bir poli-A dizisinde 'kekelemesi' (stutteringstuttering) sonucu oluşan bir nükleotidlik çerçeve kaymasıyla üretildiği saptanmıştır.

Sitoplazmada gerçekleşen bu özgün transkripsiyonel modifikasyon aşağıdakilerden hangisidir?

  1. A
    RNA splaysing (splicing)
  2. RNA editleme (editing)Cevap
  3. C
    Ribozomal çerçeve kayması (ribosomal frameshift)
  4. D
    RNA 'Cap-snatching'
  5. E
    Antijenik shift

Cevap

Doğru cevap, viral RNA polimerazın transkripsiyon sırasında nükleotid eklemesiyle oluşan RNA editleme (editing) mekanizmasıdır.
Filovirüsler sitoplazmada replike olan negatif polariteli RNA virüsleridir. Ebola virüsünün GPGP geninden hem salınan (sGPsGP) hem de yapısal glikoproteinin (GPGP) üretilmesi, viral RNA bağımlı RNA polimerazın transkripsiyon sırasında fazladan bir adenin nükleotidi ekleyerek çerçeve kayması (frameshiftframeshift) yapmasıyla gerçekleşir. Bu sürece 'RNA editleme' (editing) adı verilir.

Adım Adım Çözüm

1
Virüsün replikasyon bölgesini ve genom tipini belirle.
Filovirüsler (Ebola, Marburg) negatif polariteli, tek iplikli RNA virüsleridir ve sitoplazmada replike olurlar.
Replike olma yeri, nükleusta gerçekleşen splaysing gibi mekanizmaların elenmesini sağlar.
2
GP geninin ifade edilme stratejisini analiz et.
GP geni birincil olarak salgılanan glikoproteini (sGPsGP) kodlar. Yapısal glikoproteini (GPGP) üretmek için okuma çerçevesinin değişmesi gerekir.
Tek bir genden iki farklı fonksiyonel proteinin nasıl üretildiğini anlamak için moleküler mekanizmayı sorgulamak gerekir.
3
Transkripsiyonel seviyedeki nükleotid ekleme olayını tanımla.
RNA polimeraz yedi adet adenin nükleotidinin bulunduğu bölgede 'kekeler' ve sekizinci bir adenini ekleyerek +1+1 çerçeve kaymasına neden olur.
Transkripsiyon sırasında meydana gelen bu 'ko-transkripsiyonel insersiyon' işlemi literatürde 'RNA editleme' (editing) olarak adlandırılır.

Anahtar Kavram

Filovirüslerde (Ebola) ve Paramyxovirüslerde (örn. P geni), viral RNA bağımlı RNA polimerazın transkripsiyon sırasında nükleotid eklemesi veya silmesi yoluyla protein çeşitliliği sağlamasına 'RNA editleme' denir.
Tahmini Süre:1m 30s
Bu soruyu puanla

Konular

RNA Virüsleri

Bu konudan daha fazla soru