Soru

Zorluk: Çok zorRNA Virüsleri

42 yaşında bir erkek hasta, halsizlik ve hafif sarılık şikayetiyle başvuruyor. Laboratuvar incelemelerinde anti-HCV pozitif ve HCV-RNA pozitif (2×1062 \times 10^6 kopya/mL) saptanıyor. Karaciğer biyopsisinde orta derecede nekroinflamatuar aktivite izlenen hastanın moleküler analizlerinde, virüsün zarf glikoproteini 2 (E2E2) üzerindeki hipervaryabl bölge 1 (HVR1HVR1) dizilerinin kısa süreler içerisinde bile büyük çeşitlilik gösterdiği (quasi-tür oluşumu) ve bu durumun nötralizan antikorların etkisini ortadan kaldırdığı belirleniyor. Virüsün konak bağışıklığından kaçmasına ve enfeksiyonun kronikleşmesine neden olan bu aşırı genetik varyasyonun temel moleküler mekanizması aşağıdakilerden hangisidir?

  1. RNA-bağımlı RNA polimeraz enziminin 353'-5' ekzonükleaz (hata düzeltme) aktivitesinden yoksun olmasıCevap
  2. B
    Viral genomun konak hücre çekirdeğinde episomal formda kalması ve latent enfeksiyon oluşturması
  3. C
    Viral genomun segmentli yapısı nedeniyle farklı suşlar arasında genetik reasortman gerçekleşmesi
  4. D
    Revers transkriptaz enziminin nükleotit dizilimini DNA'ya aktarırken yüksek oranda hata yapması
  5. E
    Virüsün zarfsız (çıplak) yapısı sayesinde konak hücre nükleazlarına karşı direnç geliştirmesi

Cevap

Hepatit C virüsünün yüksek genetik varyasyonu ve quasi-tür oluşturma yeteneği, RNA-bağımlı RNA polimeraz enziminin (NS5B) 353'-5' ekzonükleaz (hata düzeltme) aktivitesine sahip olmamasından kaynaklanır.
Hepatit C virüsü (HCVHCV), Flaviviridae ailesinde yer alan zarflı, pozitif polariteli, tek iplikli bir RNA virüsüdür. Virüsün replikasyonunda görev alan RNA-bağımlı RNA polimeraz (NS5BNS5B), birçok DNA polimerazın aksine 353'-5' ekzonükleaz (hata düzeltme/proofreading) aktivitesine sahip değildir. Bu durum, genom kopyalanırken her nükleotit eklenmesinde yüksek oranda hata yapılmasına yol açar. Özellikle zarf glikoproteini 2 (E2E2) üzerindeki hipervaryabl bölge 1 (HVR1HVR1) bu mutasyonların en yoğun görüldüğü yerdir. Sonuçta konak içerisinde birbirine çok benzeyen ama antijenik olarak farklı 'quasi-türler' (quasi-species) oluşur. Bu mekanizma, virüsün konak bağışıklık sisteminden ve nötralizan antikorlardan sürekli kaçmasını sağlayarak enfeksiyonun %80'e varan oranlarda kronikleşmesine neden olur.

Adım Adım Çözüm

1
Vakanın analizi
Anti-HCV ve HCV-RNA pozitifliği ile kronik Hepatit C tanısı konur.
Yüksek viral yük ve biyopsi bulguları aktif replikasyonu doğrular.
2
Moleküler bulgunun değerlendirilmesi
E2E2 proteini üzerindeki HVR1HVR1 bölgesindeki yüksek değişkenlik (quasi-tür) tespit edilir.
Quasi-tür kavramı, tek bir konakta birbiriyle yakından ilişkili ancak genetik olarak farklı viral varyantların bulunmasını ifade eder.
3
Etiyolojik mekanizmanın belirlenmesi
HCV polimerazının (NS5B) hata düzeltme yeteneğinin olmaması bu varyasyonun temelidir.
DNA polimerazların aksine, çoğu RNA polimerazda hata düzeltme fonksiyonu yoktur, bu da her replikasyon döngüsünde çok sayıda nokta mutasyonuna neden olur.

Anahtar Kavram

Hepatit C virüsü (Flaviviridae), proofreading aktivitesi olmayan RNA-bağımlı RNA polimerazı sayesinde quasi-türler oluşturarak nötralizan antikorlardan kaçar ve kronikleşir.
Tahmini Süre:1m 30s
Bu soruyu puanla