Soru

Zorluk: OrtaRibozomlar ve Proteazomlar

Ökaryotik hücrelerdeki sitozolik proteinlerin kalitesini kontrol eden ve poliubikitinlenmiş proteinlerin yıkımından sorumlu olan 26S proteazom kompleksiyle ilgili aşağıdakilerden hangisi yanlıştır?

  1. A
    19S düzenleyici partikülü, substrat proteinin katlanmış yapısını ATP hidrolizi ile açarak (unfolding) 20S çekirdeğinin içine doğru ilerlemesini sağlar
  2. B
    20S çekirdek partikülünün iç yüzeyindeki beta halkaları, treonin, serin veya sistein kalıntıları üzerinden proteolitik aktivite gösterir
  3. C
    Proteazom kompleksi, lizozomal enzimler gibi asidik pH ortamında değil, nötral sitozolik pH değerlerinde optimum çalışır
  4. D
    Poliubikitin zinciri, protein yıkıldıktan sonra olduğu gibi korunarak sitozole salınır ve yeniden kullanılmak üzere serbest kalır
  5. Protein yıkımı sırasında peptit bağlarının hidrolizi için ATP enerjisi doğrudan kullanılır ve her kesim basamağında ATP harcanırCevap

Cevap

Protein yıkımı sırasında peptit bağlarının hidrolizi için ATP enerjisi doğrudan kullanılır ve her kesim basamağında ATP harcanır ifadesi yanlıştır.
Proteazom kompleksinde ATP enerjisi, substratın 19S kapağı tarafından tanınması, katlanmış yapısının açılması (unfolding) ve dar 20S kanalına itilmesi (translokasyon) için gereklidir. Ancak 20S çekirdeğinin beta halkalarında gerçekleşen proteolitik aktivite (peptit bağlarının hidrolizi) ATP'den bağımsızdır.

Adım Adım Çözüm

1
Proteazomun yapısını hatırla
26S Proteazom = 20S Çekirdek (Katalitik) + 19S Düzenleyici (Kapak/Giriş)
Fonksiyonel ayrımı yapmak için yapısal bileşenleri bilmek gerekir.
2
Enerji gerektiren basamakları belirle
ATP, sadece proteinin 'unfolding' (açılma) ve 20S içine 'translokasyon' (ilerletilme) aşamasında 19S kapağı tarafından harcanır.
19S kapağındaki AAA-ATPaz aktivitesi bu mekanik işi yapar.
3
Katalitik işlemi analiz et
20S içindeki beta halkalarında gerçekleşen peptit bağı kırılması (hidroliz), ek ATP gerektirmeyen ekzergonik bir reaksiyondur.
Enzimatik kesim işlemi, ortamdaki suyun kullanıldığı hidroliz reaksiyonudur, ATP bağ enerjisi kullanılmaz.

Anahtar Kavram

Proteazom Fonksiyonunda ATP Kullanımı
Tahmini Süre:1m 0s
Bu soruyu puanla