Soru

Zorluk: ZorPeptid Bağı ve Biyolojik Aktif Peptidler

Polipeptid zincirlerinin yapısal organizasyonunu belirleyen peptid birimlerinin (CONHCONH) fizikokimyasal karakteristikleri ve biyolojik sistemlerde sinyal iletimi veya antioksidan savunma gibi kritik görevler üstlenen aktif peptidler ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi yanlıştır?

  1. A
    Peptid bağındaki C−NC-N bağı, rezonans hibrit yapısı nedeniyle serbest rotasyona izin vermeyen kısmi çift bağ karakterine sahiptir.
  2. B
    Peptid birimi, karbonil oksijeninin kısmi negatif (δ−\delta^-) ve amid azotunun kısmi pozitif (δ+\delta^+) yüklenmesiyle kalıcı bir elektrik dipol momenti oluşturur.
  3. C
    Glutatyon (γ\gamma-L-glutamil-L-sisteinil-glisin), yapısındaki glutamatın γ\gamma-karboksil grubu ile sistein arasındaki atipik bağ sayesinde çoğu hücre içi peptidaz tarafından tanınmaz.
  4. Arka hipofiz hormonları olan vazopressin ve oksitosin, yapılarında sistin (disülfid) köprüsü bulundurmayan, dokuz amino asitli lineer polipeptidlerdir.Cevap
  5. E
    Peptid bağları sterik engeller nedeniyle genellikle 'trans' konfigürasyonundadır; prolin içeren bağlarda 'cis' izomerinin görülme sıklığı diğer amino asitlere göre daha yüksektir.

Cevap

Arka hipofiz hormonları olan vazopressin ve oksitosin, yapılarında sistin (disülfid) köprüsü içeren halkasal (siklik) nonapeptidlerdir.
Vazopressin (ADH) ve oksitosin hormonları, 9 amino asit içeren nonapeptidlerdir. Bu peptidlerin yapısal özelliği, 1. ve 6. pozisyondaki sistein kalıntıları arasında bir disülfid (sistin) köprüsü barındırmalarıdır. Bu köprü molekülün bir kısmını halkasal hale getirir, dolayısıyla bu hormonlar lineer değil, halkasal (siklik) peptid sınıfına girer.

Adım Adım Çözüm

1
Peptid bağının rezonans ve bağ uzunluğu özelliklerini analiz et.
Peptid bağı kısmi çift bağ karakterindedir, düzlemseldir ve rotasyon engellenmiştir.
Elektronların O−C−NO-C-N sistemi üzerinde delokalize olması bağa rijitlik kazandırır.
2
Peptid birimindeki yük dağılımını ve dipol oluşumunu değerlendir.
Karbonil oksijeni ve amid azotu arasında kalıcı bir dipol momenti oluşur.
Elektronegatiflik farkı nedeniyle yüklerin asimetrik dağılması kalıcı polarite yaratır.
3
Biyolojik aktif peptidlerin (glutatyon, vazopressin) spesifik yapısal detaylarını kontrol et.
Glutatyon γ\gamma-bağı içerir; vazopressin ve oksitosin ise disülfid köprüsü ile halkasallaşmış nonapeptidlerdir.
Vazopressin ve oksitosin moleküllerinin lineer olduğunu varsaymak hatalıdır; sistin köprüsü yapısal stabilite ve reseptör bağlanması için kritiktir.

Anahtar Kavram

Peptid bağının rezonans kaynaklı rijitliği/dipolü ve biyoaktif peptidlerdeki (sistin köprüsü, γ\gamma-bağlanma) yapısal modifikasyonlar.
Bu soruyu puanla