Examkin

Soru

Zorluk: Çok zorRNA Virüsleri

Arenaviridae ailesi (Lassa ateşi virüsü, Lenfositik Koryomenenjit Virüsü - LCMV), elektron mikroskobunda partikül yapısında konak hücre kökenli ribozomları barındırmasıyla karakterize 'kumlu' (sandy) bir görünüme sahiptir. Genomları iki segmentli (L ve S), halkasal görünümlü RNA'dan oluşur ve 'ambisens' (iki yönlü) kodlama stratejisi kullanırlar. Buna göre, Arenavirüslerin S segmentindeki gen ekspresyon stratejisi ile ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

  1. Nükleokapsid (N) proteini için mRNA sentezinde genomik RNA, glikoprotein (G) öncülü için mRNA sentezinde ise antijenomik RNA kalıp olarak kullanılır.Cevap
  2. B
    Virion içinde bulunan konak hücre kaynaklı ribozomlar, negatif polariteli genomik RNA'yı doğrudan transle ederek protein sentezini başlatır.
  3. C
    S segmenti tamamen pozitif polariteli bir yapıya sahiptir ve replikasyon sırasında 'cap' bağımlı translasyon mekanizmasıyla doğrudan proteine dönüşür.
  4. D
    Hem N hem de G proteinlerine ait mRNA'lar, genomun konak hücre çekirdeğine taşınması ve burada alternatif splicing yapılması sonucunda sentezlenir.
  5. E
    Genomik RNA'nın 5' ucu doğrudan mRNA olarak işlev görür ve virion içerisinde taşınan RNA bağımlı RNA polimerazı (L protein) kodlar.

Cevap

Nükleokapsid (N) proteinine ait mRNA'nın sentezinde negatif polariteli genomik RNA kalıp olarak kullanılırken, glikoprotein (G) öncülüne ait mRNA'nın sentezinde pozitif polariteli antijenomik RNA kalıp olarak kullanılır.
Arenavirüslerin S segmenti ambisens yapıdadır. Nükleokapsid (N) geni segmentin 3' yarısında yer alır ve negatif polariteli olduğu için genomik RNA üzerinden doğrudan mRNA olarak transkribe edilir. Glikoprotein (G) geni ise segmentin 5' yarısında yer alır ve pozitif polaritelidir; bu nedenle ancak replikasyonun ilerleyen aşamalarında sentezlenen antijenomik RNA (pozitif) üzerinden zıt polaritede bir kalıp kullanılarak transkribe edilebilir. Bu özellik Arenavirüslerin en karakteristik ve 'hard' düzeydeki virolojik bilgisidir.

Adım Adım Çözüm

1
Virüs ailesini ve genomik yapısını tanımlama
Soruda tanımlanan 'kumlu' görünüm ve iki segmentli RNA yapısı Arenaviridae ailesine (örn. Lassa, LCMV) aittir.
Karakteristik morfoloji ve genom yapısı ayırıcı tanıda temeldir.
2
Ambisens kodlama mekanizmasını analiz etme
Ambisens segmentlerde 3' ucu negatif polaritedir (N geni), 5' ucu ise pozitif polaritedir (G geni).
Ambisens terimi, bir RNA segmentinin her iki yönünde de (farklı polaritelerde) gen taşımasını ifade eder.
3
Transkripsiyon süreçlerini değerlendirme
3' yarısındaki N geni, genomik RNA üzerinden doğrudan transkribe edilir. Ancak 5' yarısındaki G geni, genomik RNA ile aynı polaritede olduğundan transkribe edilemez; önce tam boy antijenomik RNA sentezlenmeli ve G geni bu antijenomik kalıbın 3' ucundan transkribe edilmelidir.
mRNA sentezi (transkripsiyon) için her zaman zıt polaritede bir kalıp RNA gereklidir.
4
Sonucu doğrulama
N protein mRNA'sı genomik RNA'dan, G protein mRNA'sı ise antijenomik RNA'dan sentezlenir.
Bu strateji, viral protein sentezinin zamanlamasını ve miktarını kontrol etmek için kullanılan karmaşık bir mekanizmadır.

Anahtar Kavram

Arenavirüslerde S segmentinin ambisens transkripsiyon stratejisi
Tahmini Süre:2m 0s
Bu soruyu puanla

Konular

RNA Virüsleri

Bu konudan daha fazla soru