Soru

Zorluk: ZorRNA Virüsleri

Ağır solunum yetmezliği tablosuyla başvuran bir hastada saptanan viral etkenin; 27−3227-32 kb uzunluğunda pozitif polariteli tek iplikli RNA genomuna sahip olduğu, zarflı yapıda olduğu ve elektron mikroskobunda nükleokapsidinin helikal simetri sergilediği gözlenmiştir. Ayrıca bu virüsün, genomundaki hataları düzelten 3′−5′3'-5' ekzonükleaz (ExoN) aktivitesine sahip olduğu belirlenmiştir. Bu virüs aşağıdakilerden hangisidir?

  1. SARS-CoV-2Cevap
  2. B
    Respiratuar Sinsityal Virüs
  3. C
    İnfluenza A virüsü
  4. D
    Rinovirüs
  5. E
    Batı Nil Virüsü

Cevap

Söz konusu virüs SARS-CoV-2'dir.
Doğru kabul edilen virüs, Coronaviridae ailesinin bir üyesidir. Bu aile, pozitif polariteli tek iplikli RNA genomuna sahip olmasına rağmen, diğer pozitif RNA virüslerinden farklı olarak helikal nükleokapsid simetrisine sahiptir. Ayrıca, RNA virüsleri içinde bilinen en büyük genoma (27−3227-32 kb) sahiptirler ve replikasyon sırasında oluşan mutasyonları nsp14 (ExoN) enzimi ile düzeltebilirler. Klinik tablo olan ağır solunum yetmezliği de bu virüs grubuyla (SARS, MERS, SARS-CoV-2) uyumludur.

Adım Adım Çözüm

1
Nükleik asit tipi ve polaritesini değerlendir
Soruda belirtilen pozitif polariteli RNA genomu; Coronaviridae, Picornaviridae ve Flaviviridae gibi aileleri işaret eder.
Virüslerin sınıflandırılmasında genom tipi ilk basamaktır.
2
Nükleokapsid simetrisini incele
Pozitif polariteli RNA virüslerinin çoğu ikozahedral simetriye sahipken, Coronaviridae ailesi (SARS-CoV-2 dahil) helikal simetri gösteren önemli bir istisnadır.
Yapısal özellikler virüs aileleri arasında ayırt edicidir.
3
Genom büyüklüğü ve hata düzeltme mekanizmasını analiz et
Yaklaşık 3030 kb büyüklüğündeki genom ve nsp14 proteini ile sağlanan 3′−5′3'-5' ekzonükleaz aktivitesi Coronaviridae ailesine özgüdür.
Çoğu RNA virüsü hata düzeltme yeteneğinden yoksundur ve bu kadar büyük genoma sahip olamaz.

Anahtar Kavram

Coronaviridae ailesinin yapısal ve genetik özgünlükleri (Pozitif RNA, Helikal simetri, Büyük genom ve ExoN aktivitesi).

Alternatif Yöntem

Symmetry-Polarity eşleşmesi yapılarak elenebilir: Pozitif RNA + Helikal kombinasyonu sadece Coronaviruslar ve diğer Nidovirales üyeleri için geçerlidir.
Tahmini Süre:2m 0s
Bu soruyu puanla