Soru

Zorluk: OrtaNükleik Asit Yapısı ve Organizasyonu

Ökaryotik hücrelerde genomik DNA, histon proteinleri ile birleşerek nükleozom adı verilen temel paketleme birimlerini oluşturur. Nükleozomun yapısal organizasyonu ve DNA ile proteinler arasındaki etkileşimlerin doğası düşünüldüğünde, aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

  1. Histon proteinleri, fizyolojik pHpH'da pozitif yüklü olan lizin ve arjinin amino asit kalıntılarından zengindir.Cevap
  2. B
    Nükleozom kor parçacığı (core particle); H1, H2A, H2B, H3 ve H4 proteinlerinden oluşan bir dekamer yapısındadır.
  3. C
    DNA molekülü, histon oktameri etrafında yaklaşık iki tam tur atarak sağ el dönüşlü bir süperkıvrım oluşturur.
  4. D
    Histon proteinleri, DNA ile etkileşime girebilmek için yüksek oranda negatif yüklü aspartat ve glutamat amino asitleri içerir.
  5. E
    DNA ve histonlar arasındaki ana etkileşim, deoksiriboz şekerinin 22' karbonuna bağlı hidroksil grubu üzerinden kurulur.

Cevap

Histon proteinleri, fizyolojik pHpH değerlerinde pozitif yük taşıyan lizin ve arjinin amino asitleri bakımından zengindir; bu durum DNA'nın negatif yüklü fosfat omurgasıyla güçlü iyonik etkileşimler kurulmasını sağlar.
Histon proteinleri, fizyolojik koşullarda pozitif yüklü olan lizin ve arjinin amino asitleri açısından son derece zengindir. Bu pozitif yükler, DNA'nın fosfodiester bağlarındaki negatif yüklü fosfat grupları ile iyonik etkileşimler kurarak DNA'nın histon oktameri etrafında sıkıca paketlenmesini sağlar.

Adım Adım Çözüm

1
Nükleozom bileşenlerini analiz et.
Nükleozom kor parçacığı H2A,H2B,H3,H4H2A, H2B, H3, H4 proteinlerinden ikişer adet içerir (oktamer). H1H1 dışarıdadır.
Yapısal organizasyonun anlaşılması için çekirdek ve bağlayıcı protein ayrımı yapılmalıdır.
2
DNA ve protein etkileşim tipini belirle.
DNA fosfatları negatif (-), histon yan zincirleri pozitif (+) yüklüdür.
Nükleik asit organizasyonunda ana stabilize edici kuvvet elektrostatik (iyonik) çekimdir.
3
Histon amino asit kompozisyonunu değerlendir.
Lizin ve arjinin bazik (pozitif yüklü) amino asitlerdir.
Proteinlerin yükü, içerdikleri amino asitlerin yan zincirlerinin pKapKa değerlerine bağlıdır.

Anahtar Kavram

Nükleozom yapısı ve histon-DNA elektrostatik etkileşimi

İpuçları

1
DNA'nın fosfat omurgasının net yükünü ve bu yükü dengelemek için proteinlerin ne tür amino asitler içermesi gerektiğini düşünün.

Daha Fazla Pratik

Histonların asetilasyon ve metilasyon gibi post-translasyonel modifikasyonlarının DNA paketlenmesi üzerindeki etkilerini inceleyin.
Tahmini Süre:1m 15s
Bu soruyu puanla