Soru

Zorluk: OrtaNükleik Asit Yapısı ve Organizasyonu

Bir araştırmacı, laboratuvarda saflaştırdığı bir nükleik asit örneğini alkali (NaOHNaOH) çözeltisi ile muamele ettiğinde, polimer yapısının bozulmadığını ve hidrolize karşı direnç gösterdiğini saptamıştır. Bu nükleik asit molekülünün alkaliye karşı gösterdiği bu direncin temel yapısal nedeni aşağıdakilerden hangisidir?

  1. Pentoz şekerinin 2′2' karbonunda hidroksil (−OH-OH) grubunun bulunmamasıCevap
  2. B
    Nükleotit birimlerinin birbirine 2′−5′2'-5' fosfodiester bağları ile bağlanmış olması
  3. C
    Yapısındaki timin bazlarının alkali ortamda pürin halkasını stabilize etmesi
  4. D
    Fosfat gruplarının pentoz şekerinin 3′3' ucuna alfa-glikozidik bağ ile bağlı olması
  5. E
    Toplam pürin bazları miktarının her zaman toplam pirimidin bazları miktarına eşit olması

Cevap

Pentoz şekerinin 2′2' karbonunda hidroksil (−OH-OH) grubunun bulunmaması nükleik asitlere alkali direnci kazandırır.
DNA'nın (deoksiribonükleik asit) alkali hidrolize karşı dirençli olmasının temel nedeni, şeker yapısında (deoksiriboz) 2′2' karbonunda bir hidroksil (−OH-OH) grubunun bulunmamasıdır. RNA'da bulunan 2′−OH2'-OH grubu, alkali ortamda komşu fosfodiester bağına nükleofilik bir saldırı başlatarak zincirin kopmasına neden olur. DNA'da bu grubun yerine hidrojen (−H-H) bulunması, bu reaksiyonu imkansız kılar.

Adım Adım Çözüm

1
Nükleik asitlerin alkali ortamdaki davranışlarını karşılaştır.
RNA alkali ortamda kolayca hidrolize olurken, DNA hidrolize karşı dirençlidir.
Alkali direnci, molekülün kimyasal stabilitesinin bir göstergesidir.
2
RNA'nın alkali duyarlılığının kimyasal nedenini analiz et.
RNA'daki riboz şekerinin 2′2' karbonunda serbest bir hidroksil (−OH-OH) grubu bulunur.
Alkali ortamda bu −OH-OH grubu nükleofilik bir saldırı başlatarak fosfodiester bağını koparır.
3
DNA'nın (deoksiribonükleik asit) yapısındaki farkı belirle.
DNA'da deoksiriboz şekeri bulunur ve 2′2' konumunda −OH-OH yerine −H-H atomu vardır.
Hidroksil grubunun yokluğu, alkali ortamda nükleofilik saldırının gerçekleşmesini engeller ve molekülü stabilize eder.

Anahtar Kavram

Nükleik asitlerin alkali stabilitesi ve 2'-OH grubunun rolü
Bu soruyu puanla