Soru

Zorluk: ZorDNA Hasarı ve Tamir Mekanizmaları

Hücrede genomik bütünlüğün korunması amacıyla işleyen DNA hasar tamir mekanizmaları ve bu süreçlerde görev alan proteinlerin fonksiyonları ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. A
    Yanlış eşleşme tamiri (MMR) sisteminde, yeni sentezlenen zincirdeki hatalı nükleotidin tanınmasından sonra şeker-fosfat omurgasında çentik oluşturulması AP endonükleaz enzimi tarafından gerçekleştirilir.
  2. B
    Nükleotid eksizyon tamiri (NER) sadece transkripsiyonun devam ettiği aktif gen bölgelerindeki hasarları onarabilir ve bu süreçte XPC proteini helikaz aktivitesi gösterir.
  3. Baz eksizyon tamiri (BER) mekanizmasında, DNA glikozilaz ile hasarlı bazın uzaklaştırılması sonucu oluşan AP bölgesinin 55' ucu AP endonükleaz tarafından kesilerek serbest 3OH3'-OH ucu oluşturulur.Cevap
  4. D
    DNA çift zincir kırıklarının onarımında kullanılan homolog olmayan uç birleştirme (NHEJ) mekanizması, hücre döngüsünün SS ve G2G2 evrelerinde kardeş kromatidi kalıp olarak kullanarak hatasız onarım sağlar.
  5. E
    Xeroderma pigmentosum hastalığının patogenezinden sorumlu olan temel moleküler defekt, iyonize radyasyon hasarlarını tanıyan ATM proteininin eksikliğidir.

Cevap

Baz eksizyon tamiri (BER) sırasında AP endonükleazın AP bölgesinin 5' ucunu keserek serbest 3'-OH grubu oluşturduğu ifade doğrudur.
Baz eksizyon tamiri (BER), sitozin deaminasyonu veya oksidatif hasar gibi tekli baz hasarlarını onarır. Süreçte önce bir DNA glikozilaz hasarlı bazı çıkararak AP bölgesi oluşturur. Ardından AP endonükleaz, bu bölgenin 55' ucundaki fosfodiester bağını keserek serbest bir 3OH3'-OH ucu yaratır. Bu uç, DNA polimeraz beta tarafından yeni nükleotid eklenmesi için kalıp olarak kullanılır.

Adım Adım Çözüm

1
DNA glikozilaz aktivitesini değerlendir.
Hasarlı baz uzaklaştırılır ve AP (apurinic/apyrimidinic) bölge oluşur.
BER'in ilk adımı spesifik bazın uzaklaştırılmasıdır.
2
AP endonükleaz (APE1) etkisini incele.
AP bölgesinin 55' ucu kesilir, bir tarafta 3OH3'-OH diğer tarafta 5dRP5'-dRP (deoksiriboz fosfat) ucu oluşur.
Polimerazın yeni nükleotid ekleyebilmesi için serbest bir 3'-OH ucuna ihtiyaç vardır.
3
DNA polimeraz ve ligaz etkisini analiz et.
Eksik nükleotid doldurulur ve zincir kapatılır.
Onarımın tamamlanması için sentez ve ligasyon şarttır.

Anahtar Kavram

DNA Hasar Tamir Mekanizmalarında Enzim-Fonksiyon Eşleşmesi
Tahmini Süre:1m 30s
Bu soruyu puanla