Soru

Zorluk: OrtaNükleik Asit Yapısı ve Organizasyonu

Nükleik asitlerin yapısal organizasyonunda, azotlu bazlar ile pentoz şekeri arasındaki NN-glikozidik bağın özellikleri nükleotid konformasyonunu ve sarmal yapının stabilitesini belirlemektedir. Pürin nükleotidlerinde bu bağın pürin halkası üzerindeki konumu ve B-formundaki DNA sarmalı içindeki baskın konformasyonu aşağıdakilerin hangisinde birlikte verilmiştir?

  1. A
    N1N-1 atomu / 'anti' konformasyonu
  2. N9N-9 atomu / 'anti' konformasyonuCevap
  3. C
    N1N-1 atomu / 'syn' konformasyonu
  4. D
    N9N-9 atomu / 'syn' konformasyonu
  5. E
    N7N-7 atomu / 'anti' konformasyonu

Cevap

Pürin nükleotidlerinde NN-glikozidik bağ N9N-9 atomu üzerinden kurulur ve B-DNA yapısında 'anti' konformasyonu baskındır.
Pürin nükleotidlerinde (Adenin ve Guanin), azotlu baz pentoz şekerinin C1C-1' karbonuna pürin halkasındaki N9N-9 azotu üzerinden bir NN-glikozidik bağ ile bağlanır. B-formundaki DNA molekülünde, bazların şeker halkası ile çakışmasını (sterik engel) önlemek amacıyla bazlar şekerden dışarı doğru yönlenir ve bu duruma 'anti' konformasyonu denir.

Adım Adım Çözüm

1
Pürin halkasının pentoz şekeri ile yaptığı bağın konumunu belirle.
Pürin nükleotidlerinde azotlu baz, pentoz şekerinin C1C-1' karbonuna pürin halkasının N9N-9 atomu üzerinden bağlanır.
Bu, nükleik asit kimyasında pürin nükleotidleri için değişmez bir yapısal özelliktir.
2
B-DNA sarmal yapısındaki konformasyonel tercihi analiz et.
Baz ve şeker halkası arasındaki sterik engellenmeyi minimize etmek için bazın şekerden uzağa yöneldiği 'anti' konformasyonu tercih edilir.
Fizyolojik koşullardaki B-DNA yapısında bazlar sarmalın iç kısmına doğru 'anti' pozisyonunda uzanarak hidrojen bağlarını stabilize eder.

Anahtar Kavram

Nükleosid yapısında baz-şeker bağlantı noktaları ve nükleotidlerin 'syn/anti' konformasyonel özellikleri.

Daha Fazla Pratik

Z-DNA yapısındaki pürin ve pirimidinlerin konformasyonel farklarını ve bu farkın sarmalın 'sol el' yönelimine etkisini inceleyin.
Tahmini Süre:45s
Bu soruyu puanla