Soru

Zorluk: OrtaNükleik Asit Yapısı ve Organizasyonu

RNA moleküllerinin, özellikle de tRNA'nın yapısal organizasyonunda standart nükleozidlerin yanı sıra çeşitli post-transkripsiyonel modifikasyonlara uğramış bazlar da yer alır. Bu modifikasyonlar arasında, azotlu bazın riboz şekeriyle yaptığı bağın alışılagelmiş azot (NN) atomu yerine karbon (CC) atomu üzerinden (C5C1C5-C1') kurulmasıyla (C-glikozidik bağ) diğerlerinden ayrılan nükleozid aşağıdakilerden hangisidir?

  1. PsödouridinCevap
  2. B
    İnozin
  3. C
    Dihidrouridin
  4. D
    7-Metilguanozin
  5. E
    Ribotimidin

Cevap

Psödouridin, urasil bazının karbon atomu (C5C-5) üzerinden riboz şekerine bağlanmasıyla oluşan ve alışılagelmiş N-glikozidik bağ yerine C-glikozidik bağ içeren modifiye bir nükleoziddir.
Psödouridin, standart nükleozidlerin aksine baz ile riboz şekeri arasında azot-karbon (NCN-C) bağı yerine karbon-karbon (C5C1C5-C1') bağı içeren tek yaygın RNA modifikasyonudur. Bu yapısal özellik ona 'C-glikozidik bağ' tanımını kazandırır.

Adım Adım Çözüm

1
Nükleozidlerin temel yapısal bağını hatırla.
Standart nükleozidlerde (adenozin, guanozin, sitidin, uridin) baz ile şeker arasında bir azot (NN) atomu üzerinden glikozidik bağ kurulur.
Bu bağ pürinlerde N9N-9, pirimidinlerde ise N1N-1 atomu ile ribozun C1C-1' atomu arasındadır.
2
tRNA'daki modifiye bazların özelliklerini karşılaştır.
İnozin, dihidrouridin ve ribotimidin gibi bazlar modifiye olsa da bağ yapıları halen azot üzerindendir.
Modifikasyonlar genellikle halkadaki atomların (metilasyon, deaminasyon, hidrojenasyon) değişimiyle ilgilidir.
3
İstisnai olan C-glikozidik bağ yapısını belirle.
Psödouridin (ψ\psi), urasil halkasının dönerek C5C-5 atomu üzerinden ribozun C1C-1' atomuna bağlandığı tek yaygın nükleoziddir.
Bu yapı tRNA'nın üçüncül yapısını stabilize etmede ve katlanmasında kritik rol oynar.

Anahtar Kavram

Psödouridin (ψ\psi), nükleik asitlerdeki nadir 'C-glikozidik' bağ yapısının prototipidir.
Bu soruyu puanla