Soru

Zorluk: OrtaAmino Asitlerin Yapısı ve Özellikleri

Proteinlerin sulu çözeltilerdeki katlanma sürecinde, yan zincirlerin su molekülleriyle temas etmekten kaçınarak proteinin iç kısımlarında kümelenmesiyle oluşan "hidrofobik çekirdek" (hydrophobic core), protein stabilitesinin temel belirleyicisidir. Buna göre, yan zincirinin tamamen hidrokarbon karakterinde olması nedeniyle bu etkileşime girmeye eğilimi en yüksek olan amino asit aşağıdakilerden hangisidir?

  1. LösinCevap
  2. B
    Serin
  3. C
    Asparagin
  4. D
    Glutamin
  5. E
    Treonin

Cevap

Lösin amino asidi, yan zincirinin alifatik ve apolar yapıda olması nedeniyle proteinlerin iç kısmındaki hidrofobik çekirdek oluşumuna en yüksek katkıyı sağlar.
Lösin, yan zincirinde sadece karbon ve hidrojen atomları içeren dallanmış bir alifatik gruba sahiptir. Bu yapı suyla etkileşime giremez (hidrofobiktir). Proteinler sulu ortamda katlanırken, bu tip apolar amino asitler su molekülleri tarafından dışlanarak proteinin merkezinde kümelenirler. Bu durum sistemin serbest enerjisini minimize eder ve yapıyı stabilize eder.

Adım Adım Çözüm

1
Amino asit yan zincirlerinin (RR grubu) kimyasal özelliklerini ve polaritelerini belirlemek.
Seçeneklerdeki Serin, Asparagin, Glutamin ve Treonin polar yan zincirlere sahipken; Lösin apolar (hidrofobik) bir yan zincire sahiptir.
Hidrofobik etki, polar olmayan grupların su molekülleri tarafından dışlanmasıyla gerçekleşir.
2
Protein katlanma dinamikleri ile yan zincir özellikleri arasındaki ilişkiyi kurmak.
Apolar amino asitler suyla temas etmemek için proteinin merkezine yönelerek çekirdeği oluşturur, polar amino asitler ise yüzeyde kalır.
Termodinamik olarak sistemin entropisini artırmak için hidrofobik grupların içe çekilmesi gerekir.

Anahtar Kavram

Amino asitlerin yan zincir polariteleri proteinlerin üçüncül yapısını ve katlanma biçimini doğrudan belirler.

İpuçları

1
Hidrofobik çekirdekte yer alan amino asitlerin yan zincirleri genellikle sadece karbon ve hidrojenden oluşur.

Daha Fazla Pratik

Diğer alifatik dallı zincirli amino asitlerin (Valin, İzolösin) yapısal benzerliklerini inceleyiniz.
Tahmini Süre:50s
Bu soruyu puanla