Soru

Zorluk: OrtaDNA Hasarı ve Tamir Mekanizmaları

DNA molekülünde kendiliğinden oluşan sitozin deaminasyonu (urasil oluşumu) veya alkillenme gibi küçük baz modifikasyonlarının tamirinde görev alan 'Baz Eksizyon Tamiri' (BER) mekanizmasında; spesifik bir DNA glikozilazın hasarlı bazı uzaklaştırmasıyla ortaya çıkan apürinik/apirimidinik (AP) bölgeleri tanıyan ve bu bölgelerdeki fosfodiester bağını kesen temel enzim aşağıdakilerden hangisidir?

  1. AP endonükleazCevap
  2. B
    DNA Polimeraz I
  3. C
    MSH6 proteini
  4. D
    XP-G proteini
  5. E
    Fotoliyaz

Cevap

Baz Eksizyon Tamiri (BER) yolunda, hasarlı bazın uzaklaştırılmasıyla oluşan AP bölgelerini tanıyan ve iskeleti kesen enzim AP endonükleazdır.
DNA glikozilazlar tarafından oluşturulan apürinik veya apirimidinik (AP) bölgeler, hücre için sitotoksiktir. AP endonükleaz, bu özgül hasarı tanıyarak fosfodiester bağını hidrolize eder ve DNA polimerazın sentez yapabilmesi için gerekli olan serbest ucu sağlar.

Adım Adım Çözüm

1
Hasar tipini belirle
Sitozin deaminasyonu (urasil oluşumu) küçük bir baz modifikasyonudur.
Küçük baz modifikasyonları Nükleotid Eksizyon Tamiri (NER) yerine Baz Eksizyon Tamiri (BER) ile onarılır.
2
BER yolunun ilk basamağını analiz et
DNA glikozilaz hasarlı bazı (urasil) uzaklaştırır ve geriye bazsız bir şeker-fosfat (AP bölgesi) kalır.
Glikozilazlar sadece glikozid bağını koparır, iskeleti kesmez.
3
AP bölgesine etki eden enzimi saptanması
AP endonükleaz bu bölgeyi tanır ve iskelette 55' ucundan kesi yapar.
Tamir işleminin devam edebilmesi için polimerazın bağlanabileceği serbest uçlar oluşturulmalıdır.

Anahtar Kavram

Baz Eksizyon Tamiri (BER) Enzymatic Sequence

Daha Fazla Pratik

Nükleotid Eksizyon Tamiri (NER) ve Baz Eksizyon Tamiri (BER) arasındaki temel farkları (hasar tipi ve enzimler) karşılaştıran bir tablo hazırlamak bu konuyu pekiştirir.
Tahmini Süre:50s
Bu soruyu puanla