Examkin

Soru

Zorluk: OrtaNükleik Asit Yapısı ve Organizasyonu

DNA çift sarmalında nükleotidler birbirlerine fosfodiester bağlarıyla bağlanarak şeker-fosfat omurgasını oluşturur. Ancak sarmalın termodinamik stabilitesine, bazlar arasındaki hidrojen bağlarından daha fazla katkı sağlayan ve ardışık bazların dikey eksende birbiri üzerine binmesiyle karakterize edilen temel kuvvet aşağıdakilerden hangisidir?

  1. Hidrofobik istiflenme (base stacking) etkileşimleriCevap
  2. B
    3'-5' fosfodiester bağları
  3. C
    NN-glikozidik bağlar
  4. D
    Bazlar arasındaki kovalent çapraz bağlar
  5. E
    DNA omurgası ile histonlar arasındaki iyonik etkileşimler

Cevap

DNA çift sarmalının stabilitesine en büyük katkıyı sağlayan kuvvet, dikey eksende bazların birbiri üzerine yerleşmesiyle oluşan hidrofobik istiflenme (base stacking) etkileşimleridir.
DNA çift sarmalının iç kısmında yer alan azotlu bazlar hidrofobiktir. Bu bazların dikey bir sütun oluşturacak şekilde üst üste binmesi (stacking), su moleküllerinin sarmalın iç kısmından dışlanmasını sağlar ve van der Waals kuvvetleri aracılığıyla sarmalın termodinamik stabilitesine en büyük katkıyı sunar.

Adım Adım Çözüm

1
DNA sarmalını bir arada tutan dikey ve yatay etkileşimleri analiz et.
Yatayda hidrojen bağları, dikeyde ise istiflenme kuvvetleri bulunur.
Sarmalın bütünlüğünü sağlayan farklı düzlemlerdeki kuvvetleri ayırt etmek gerekir.
2
Hidrojen bağlarının temel fonksiyonunu belirle.
Hidrojen bağları baz eşleşmesinin özgüllüğünü (A-T, G-C) sağlar.
H-bağları stabiliteye katkı sağlasa da asıl görevi doğru bazların karşı karşıya gelmesini sağlamaktır.
3
İstiflenme (stacking) etkileşimlerinin termodinamik katkısını değerlendir.
Hidrofobik etkileşimler ve van der Waals kuvvetleri, sarmalın merkezindeki sudan kaçınan bazların üst üste binmesiyle toplam enerjiyi düşürür ve stabiliteyi maksimize eder.
Dikey istiflenme, sarmalın suyla temas eden yüzey alanını azaltarak entropik bir avantaj sağlar.

Anahtar Kavram

DNA Stabilitesi ve İstiflenme Kuvvetleri
Tahmini Süre:1m 15s
Bu soruyu puanla

Konular

Nükleik Asit Yapısı ve Organizasyonu

Bu konudan daha fazla soru