Soru

Zorluk: OrtaGen İfadesinin Düzenlenmesi

Ökaryotik hücrelerde gen ifadesinin düzenlenmesinde görev alan transkripsiyon faktörlerinin yapısal motifleri, protein-protein etkileşimi ve DNA'ya bağlanma yeteneklerini belirler. Bu motiflerden biri olan 'lösin fermuar' (leucine zipper) motifi ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. Dimerizasyonu sağlayan α\alpha-heliks yapısı boyunca her yedi amino asitte bir tekrarlayan lösin kalıntıları içerir.Cevap
  2. B
    Her motifi koordine eden bir magnezyum iyonu sayesinde DNA'nın majör oluğuna kovalent olarak bağlanır.
  3. C
    Sadece mRNA'nın 33'-UTR bölgesindeki spesifik dizilere bağlanarak translasyonel baskılama yapar.
  4. D
    Yapısındaki sistein ve histidin kalıntıları bir çinko atomu ile etkileşime girerek parmak benzeri halkalar oluşturur.
  5. E
    Sadece prokaryotik hücrelerdeki triptofan operonu baskılayıcı (represör) proteininde bulunan temel motiftir.

Cevap

Lösin fermuar motifi, dimerizasyonu sağlayan yapıda her yedi amino asitte bir tekrarlayan lösin kalıntıları içermesiyle karakterizedir.
Doğru cevap olan seçenek, lösin fermuar motifinin en temel yapısal özelliğini açıklamaktadır. Bu motifte, α\alpha-heliks yapısının bir yüzünde her yedi amino asitte bir (heptad tekrarı) lösin kalıntısı bulunur. Bu lösin yan zincirleri arasındaki hidrofobik etkileşim, iki polipeptidin bir araya gelerek homo- veya heterodimerler oluşturmasını sağlar.

Adım Adım Çözüm

1
Transkripsiyon faktörü motiflerini sınıflandır
Lösin fermuar, çinko parmak ve heliks-dönüş-heliks gibi temel motifler belirlendi.
Soruda istenen spesifik motifin özelliklerini diğerlerinden ayırt etmek gerekir.
2
Lösin fermuar yapısını incele
Amfipatik α\alpha-heliks yapısında her 7. pozisyonda bir (3.53.5 dönüşte bir) lösin bulunduğu saptandı.
Bu periyodik yerleşim, iki heliksin 'fermuar' gibi birbirine kenetlenmesini (dimerizasyon) sağlar.
3
DNA bağlanma bölgesini değerlendir
Motifin dimerizasyondan sorumlu olduğu, DNA bağlanmasının genellikle bitişikteki bazik bölge (bZIP) ile yapıldığı anlaşıldı.
Lösinlerin temel görevi DNA'ya doğrudan bağlanmak değil, dimer oluşumunu organize etmektir.

Anahtar Kavram

Lösin fermuar motifi, transkripsiyon faktörlerinde dimerizasyonu sağlayan, her 7 amino asitte bir lösin tekrarı içeren yapısal bir elemandır.
Tahmini Süre:50s
Bu soruyu puanla