Soru

Zorluk: OrtaMoleküler Genetik Teknikler

Orak hücreli anemiye yol açan nokta mutasyonu (β\beta-globin geninde 6.6. amino asitte gerçekleşen GluValGlu \rightarrow Val değişimi), ilgili DNA dizisindeki MstIIMstII restriksiyon enziminin tanıma bölgesini bozmaktadır. Moleküler tanı amacıyla, hastadan alınan DNA örneğinin ilgili bölgesi PCR ile çoğaltılmış ve ardından MstIIMstII enzimi ile kesilmiştir (RFLP analizi). Normal allelden köken alan 1.1kb1.1 kb uzunluğundaki PCR ürünü, enzimle kesildiğinde 0.9kb0.9 kb ve 0.2kb0.2 kb büyüklüğünde iki fragman oluşturmaktadır.

Buna göre, heterozigot bir taşıyıcının jel elektroforezi analizi sonucunda aşağıdaki bantlardan hangilerinin gözlenmesi beklenir?

  1. 1.1kb1.1 kb, 0.9kb0.9 kb ve 0.2kb0.2 kbCevap
  2. B
    Sadece 1.1kb1.1 kb
  3. C
    0.9kb0.9 kb ve 0.2kb0.2 kb
  4. D
    1.1kb1.1 kb ve 0.9kb0.9 kb

Cevap

Heterozigot bir taşıyıcıda hem sağlam hem de mutasyonlu allel bir arada bulunduğu için jelde 1.1kb1.1 kb (kesilmemiş mutant allel), 0.9kb0.9 kb ve 0.2kb0.2 kb (kesilmiş normal allel) olmak üzere toplam üç bant gözlenir.
Orak hücreli anemide mutasyon sonucunda MstIIMstII bölgesinin kaybı, mutant allelin kesilmesini imkansız kılar. Heterozigot birey hem bir sağlam allel (kesilerek 0.90.9 ve 0.2kb0.2 kb bantlarını oluşturur) hem de bir mutant allel (kesilmeden 1.1kb1.1 kb olarak kalır) taşıdığı için jelde bu üç farklı boyuttaki bandın hepsinin bir arada görülmesi gerekir.

Adım Adım Çözüm

1
Normal allelin enzimle etkileşimini belirlemek
0.9kb0.9 kb ve 0.2kb0.2 kb büyüklüğünde iki fragman oluşur.
Normal allelde MstIIMstII restriksiyon enziminin tanıma dizisi korunmuştur.
2
Mutant allelin enzimle etkileşimini belirlemek
1.1kb1.1 kb büyüklüğünde tek bir fragman kalır.
Orak hücreli anemiye yol açan nokta mutasyonu, MstIIMstII tanıma bölgesini bozarak enzimatik kesimi engeller.
3
Heterozigot bireyin allel yapısını ve jel paternini birleştirmek
1.1kb1.1 kb, 0.9kb0.9 kb ve 0.2kb0.2 kb bantlarının tümü gözlenir.
Heterozigotluk, her iki allel tipinin de aynı örnekte bulunması anlamına gelir; dolayısıyla tüm fragmanlar jelde ayrı ayrı görülür.

Anahtar Kavram

RFLP (Restriksiyon Fragment Uzunluk Polimorfizmi) analizi ve heterozigot bireylerde bant paterninin yorumlanması.

İpuçları

1
Heterozigot bireylerin her iki gen kopyasını (allelini) da taşıdığını unutmayın.
2
Normal allelin enzimle kesildiğinde kaç parça, mutant allelin ise kaç parça oluşturduğunu ayrı ayrı hesaplayın.
3
Mutasyon kesim bölgesini bozduğu için mutant allel 1.1kb1.1 kb olarak kalırken, normal allel 0.90.9 ve 0.2kb0.2 kb olarak parçalanır; heterozigotta bunların hepsini görürsünüz.

Daha Fazla Pratik

Restriksiyon enzimlerinin tanıma bölgelerinin palindromik diziler olduğunu ve nokta mutasyonlarının bu dizileri nasıl bozabileceğini gözden geçirin.
Tahmini Süre:1m 30s
Bu soruyu puanla