Soru

Zorluk: OrtaDNA Hasarı ve Tamir Mekanizmaları

DNA yapısında bulunan sitozin bazının kendiliğinden deaminasyonu sonucu oluşan urasilin onarımı "Baz Eksizyon Tamiri" (BER) mekanizması ile gerçekleştirilir. Bu onarım sürecinde, ilgili DNA glikozilaz enzimi tarafından bazın uzaklaştırılmasıyla meydana gelen apürinik/apirimidinik (AP) bölgesini tanıyarak şeker-fosfat omurgasını 55' ucundan hidrolize eden enzim aşağıdakilerden hangisidir?

  1. AP endonükleazCevap
  2. B
    DNA polimeraz β\beta
  3. C
    DNA ligaz
  4. D
    MSH2 (MutS homoloğu)
  5. E
    DNA helikaz

Cevap

Baz Eksizyon Tamiri (BER) sürecinde AP bölgesini tanıyan ve şeker-fosfat omurgasını 55' ucundan kesen enzim AP endonükleazdır.
Baz Eksizyon Tamiri (BER) mekanizmasında, hasarlı baz (örneğin urasil) bir DNA glikozilaz tarafından uzaklaştırıldıktan sonra geriye sadece şeker ve fosfat grubunun kaldığı bir bölge (AP bölgesi) kalır. AP endonükleaz, bu bölgeyi tanır ve şeker-fosfat omurgasını bu bölgenin 55' ucundan keserek bir serbest uç oluşturur. Bu adım, DNA polimerazın boşluğu doldurabilmesi için kritiktir.

Adım Adım Çözüm

1
Hasar tipini belirle
Sitozinin urasile deaminasyonu tek bazlık bir hasardır.
Urasil DNA'da normalde bulunmaz ve spesifik bir DNA glikozilaz tarafından tanınır.
2
Onarım yolağını seç
Tek bazlık hasarlar Baz Eksizyon Tamiri (BER) ile onarılır.
NER yolağı daha büyük, hacimli (bulky) lezyonlar için kullanılır.
3
Enzimatik sırayı analiz et
DNA Glikozilaz \rightarrow AP Endonükleaz \rightarrow DNA Polimeraz β\beta \rightarrow DNA Ligaz
Baz uzaklaştırıldıktan sonra omurganın açılması için bir endonükleaz aktivitesi gereklidir.

Anahtar Kavram

Baz Eksizyon Tamiri (BER) mekanizması ve AP endonükleazın rolü

İpuçları

1
Bu mekanizma 'Baz Eksizyon Tamiri'dir ve bazın atılmasından sonraki adımı sorar.
2
Geriye kalan 'bazsız' (AP) bölgeye müdahale eden enzim ismini bu bölgeden alır.

Daha Fazla Pratik

Nükleotid Eksizyon Tamiri (NER) mekanizmasında XP proteinlerinin ve TFIIH kompleksinin rollerini gözden geçirin.
Tahmini Süre:1m 15s
Bu soruyu puanla