Ökaryotik hücrelerde telomer uçlarının korunmasında ve bazı onkogenlerin promotör dizilerinde transkripsiyonel regülasyonda görev alan, guanin bazlarından zengin dizilerin oluşturduğu G-quadruplex (G-dörtlüsü) yapılarının stabilizasyonunda, standart Watson-Crick eşleşmesinden farklı olarak gözlenen temel biyokimyasal özellik aşağıdakilerden hangisidir?
- AGuanin bazlarının birbirine ve atomları üzerinden kovalent dimerler oluşturarak bağlanması
- Pürin halkasının atomunun dahil olduğu Hoogsteen hidrojen bağlarının kurulmasıCevap
- CGlikozidik bağların tamamının 'anti' konformasyonunda kalarak heliks gerilimini minimize etmesi
- DYapının sadece tek zincirli RNA molekülleri tarafından oluşturulabilmesi ve DNA'da instabil olması
- EAdenin ve timin bazlarının pürin halkasındaki atomu üzerinden merkeze yerleşerek 'A-stacking' yapması
Cevap
Pürin halkasının atomunun dahil olduğu Hoogsteen hidrojen bağlarının kurulması
G-quadruplex yapıları, dört guanin bazının bir düzlem üzerinde (G-tetrad) kare şeklinde organize olmasıyla oluşur. Bu organizasyonun merkezinde pürin halkasının atomu ve ekzosiklik oksijen atomları () ile kurulan Hoogsteen hidrojen bağları yer alır. Bu bağlar, standart DNA heliksindeki Watson-Crick eşleşmesinden farklı bir geometriye sahiptir ve yapının yüksek stabilite kazanmasını sağlar.
Adım Adım Çözüm
Anahtar Kavram
Hoogsteen baz eşleşmesi ve G-quadruplex organizasyonu