Examkin

Soru

Zorluk: OrtaDNA Hasarı ve Tamir Mekanizmaları

Nükleotid eksizyon tamiri (NER) mekanizması, özellikle UV ışınlarının etkisiyle oluşan pirimidin dimerleri gibi DNA yapısında hacimli (bulky) distorsiyonlara yol açan hasarların onarımında kritik rol oynar. Bu mekanizmada, hasarlı bölge belirlendikten sonra çift sarmalın lokal olarak açılmasını (unwinding) sağlayan ve helikaz aktivitesine sahip olan protein kompleksi aşağıdakilerden hangisidir?

  1. A
    DNA polimeraz ϵ\epsilon
  2. B
    MutS homoloğu
  3. TFIIHTFIIH kompleksiCevap
  4. D
    AP endonükleaz

Cevap

TFIIHTFIIH kompleksi
Nükleotid eksizyon tamirinde (NER), hasarlı bölgedeki DNA sarmalının açılmasından sorumlu olan yapı TFIIHTFIIH kompleksidir. Bu kompleks, transkripsiyonda da görev almasına rağmen, onarım sırasında XPBXPB (3′→5′3'\rightarrow 5') ve XPDXPD (5′→3′5'\rightarrow 3') alt birimlerinin helikaz gücüyle DNA zincirlerini birbirinden ayırır.

Adım Adım Çözüm

1
Hasar bölgesinin (pirimidin dimeri vb.) tanınması
Hasarın yerleşimi belirlenir ve onarım proteinleri bölgeye çağrılır.
Tamirin başlayabilmesi için genomdaki yapısal bozukluğun tespit edilmesi gerekir.
2
TFIIHTFIIH kompleksinin hasar bölgesine bağlanması ve sarmalı açması
Helikaz aktivitesi (XPB/XPD) ile DNA çift sarmalı yaklaşık 2525-3030 baz çifti boyunca açılır.
Sarmalın açılması, ekzizyon nükleazlarının hasarlı zinciri kesebilmesi için alan oluşturur.
3
Hasarlı segmentin endonükleazlar (XPF ve XPG) tarafından kesilmesi
Hasarı içeren yaklaşık 2727-2929 nükleotidlik parça uzaklaştırılır.
Hatalı nükleotidlerin fiziksel olarak zincirden atılması onarımın temelidir.

Anahtar Kavram

Nükleotid Eksizyon Tamiri (NER) ve TFIIHTFIIH Kompleksinin Rolü

İpuçları

1
Bu protein kompleksi aynı zamanda RNA polimeraz II aracılı transkripsiyonun başlatılmasında da görev alan bir genel transkripsiyon faktörüdür.
2
NER mekanizmasında DNA sarmalını açan proteinin mutasyonları Xeroderma Pigmentosum ve Cockayne Sendromu gibi hastalıklara yol açabilir.
3
Bu kompleks, XPB ve XPD adı verilen iki önemli helikaz alt birimi içerir.

Daha Fazla Pratik

Xeroderma Pigmentosum klinik tipleri ile onarım basamakları arasındaki ilişkiyi inceleyebilirsiniz.
Tahmini Süre:1m 15s
Bu soruyu puanla

Konular

DNA Hasarı ve Tamir Mekanizmaları

Bu konudan daha fazla soru