Soru

Zorluk: KolayProtein Ayrıştırma ve Analiz Teknikleri

Protein saflaştırma tekniklerinden biri olan jel filtrasyon (boyut dışlama) kromatografisinde, bir protein karışımı kolona uygulandığında kolonu ilk terk eden (en önce elüsyona uğrayan) proteinlerin genel özelliği aşağıdakilerden hangisidir?

  1. Moleküler ağırlığı en büyük olan proteinlerCevap
  2. B
    Moleküler ağırlığı en küçük olan proteinler
  3. C
    Net elektriksel yükü sıfır olan (izoizoelektrik noktadaki) proteinler
  4. D
    Hidrofobik yan zincir içeriği en yüksek olan proteinler
  5. E
    Ortamdaki spesifik bir ligand ile en güçlü bağlanan proteinler

Cevap

Jel filtrasyon kromatografisinde moleküler ağırlığı en büyük olan proteinler kolonu ilk terk eder.
Moleküler ağırlığı en büyük olan proteinlerin kolonu en önce terk etmesinin nedeni, bu moleküllerin kromatografi kolonundaki boncukların gözeneklerine (porlarına) sığmayacak kadar büyük olmasıdır. Bu durum 'dışlanma' (exclusion) olarak adlandırılır. Büyük moleküller gözeneklerin dışından dolanarak en kısa yolu takip eder ve kolonu en hızlı şekilde terk ederler.

Adım Adım Çözüm

1
Jel filtrasyon kromatografisinin ayırma mekanizmasını tanımlamak.
Ayırmanın moleküllerin büyüklüğüne ve şekline göre yapıldığı belirlenir.
Bu yöntemde kullanılan kolon dolgu maddesi (matris), içinde belirli büyüklükte kanallar (porlar) barındıran boncuklardan oluşur.
2
Farklı boyuttaki moleküllerin gözeneklerle (por) etkileşimini değerlendirmek.
Büyük moleküllerin gözeneklere giremeyeceği, küçük moleküllerin ise gözeneklerin içine gireceği anlaşılır.
Büyük proteinlerin çapı, matris üzerindeki gözeneklerin girişinden daha büyüktür.
3
Elüzyon (kolonu terk etme) sırasını belirlemek.
Büyük moleküllerin porların dışından dolanarak en kısa yolu izlediği ve en önce dışarı çıktığı sonucuna varılır.
Küçük moleküller porların içinde hapsolup dolambaçlı bir yol izledikleri için daha geç elüsyona uğrarlar.

Anahtar Kavram

Jel filtrasyon (boyut dışlama) kromatografisinde elüzyon sırası moleküler ağırlık ile ters orantılıdır; en büyük olan en önce çıkar.

İpuçları

1
Jel filtrasyon yönteminde kolonun içinde mikroskobik gözenekleri (porları) olan boncuklar olduğunu hayal edin.
2
Hangi boyuttaki moleküller bu dar gözeneklerin içine sığamayarak boncukların arasından (dışından) akıp gider?
3
Gözeneklere girmeyen büyük moleküller 'kısa yolu' kullandıkları için kolonu her zaman en önce terk ederler.

Daha Fazla Pratik

Jel filtrasyonun aksine, SDS-PAGE elektroforezinde moleküllerin ilerleme hızı ile büyüklükleri arasındaki ilişkiyi inceleyebilirsiniz.

Alternatif Yöntem

Jel filtrasyonu bir labirente benzetebilirsiniz: Küçükler labirentin her koridoruna girip kaybolurken (porlara girerken), çok büyükler labirente giremeyip çevresinden dolanarak çıkışa ulaşır.
Tahmini Süre:45s
Bu soruyu puanla