Soru

Zorluk: ZorHepatit Virüsleri

Kronik Hepatit B tanısıyla takip edilen bir hastanın karaciğer biyopsisinde viral replikasyonun aktif olduğu ve bol miktarda pregenomik RNARNA (pgRNApgRNA) sentezlendiği belirlenmiştir. Hepatit B virüsünün (HBVHBV) replikasyon döngüsü sırasında nükleokapsid içerisinde gerçekleşen olaylar incelendiğinde, bu pgRNApgRNA molekülü ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi yanlıştır?

  1. A
    Konak hücre RNARNA polimeraz IIII tarafından cccDNAcccDNA kalıbı üzerinden sentezlenir.
  2. B
    Sitoplazmada hem core (HBcAgHBcAg) hem de viral polimeraz proteinlerinin sentezi için mRNAmRNA görevi görür.
  3. C
    Viral polimeraz enziminin pgRNApgRNA'nın 55' ucundaki ϵ\epsilon (epsilon) dizisine bağlanması, molekülün paketlenmesini başlatır.
  4. Nükleokapsid içerisinde reverse transkriptaz aracılığıyla pozitif iplikli DNADNA sentezi için doğrudan kalıp olarak kullanılır.Cevap
  5. E
    Zarf proteinlerini (HBsAgHBsAg) kodlayan mRNAmRNA molekülleri, pgRNApgRNA segmentinden daha kısa olan subgenomik yapılardır.

Cevap

Pozitif iplikli DNA sentezi için doğrudan kalıp olarak kullanılması ifadesi yanlıştır, çünkü pgRNApgRNA sadece negatif iplikli DNADNA sentezinde kalıp görevi görür.
Hepatit B virüsünün replikasyonunda pgRNApgRNA (3.53.5 kb), nükleokapsid içerisinde sadece negatif iplikli DNADNA sentezi için kalıp (template) görevi görür. Bu sentez sırasında viral polimerazın RNase HRNase\ H aktivitesi pgRNApgRNA kalıbını sindirir. Pozitif iplikli DNADNA ise daha sonra, az önce sentezlenmiş olan negatif iplikli DNADNA kalıp kullanılarak üretilir. Bu nedenle pgRNApgRNA'nın pozitif iplik için doğrudan kalıp olması biyolojik olarak mümkün değildir.

Adım Adım Çözüm

1
HBVHBV replikasyonunda pgRNApgRNA'nın kaynağını belirle.
pgRNApgRNA, nükleusta bulunan cccDNAcccDNA üzerinden konak hücre RNARNA polimeraz IIII tarafından sentezlenir.
Virüs kendi transkriptazına sahip değildir, hücrenin mekanizmasını kullanır.
2
pgRNApgRNA'nın protein sentezindeki rolünü değerlendir.
pgRNApgRNA, core antijeni ve polimeraz proteini için mRNAmRNA olarak işlev görür.
3.53.5 kb'lık bu uzun RNARNA, bu iki proteinin kod dizilerini içerir.
3
Paketlenme ve reverse transkripsiyon sürecini incele.
Viral polimeraz ϵ\epsilon yapısına bağlanır, pgRNApgRNA kapsid içine alınır ve negatif iplikli DNADNA sentezlenir.
Reverse transkriptaz aktivitesi pgRNApgRNA kalıbını kullanarak ilk DNADNA ipliğini oluşturur.
4
Pozitif iplikli DNADNA sentezinin kalıbını doğrula.
Pozitif iplikli DNADNA, pgRNA üzerinden değil, yeni sentezlenen negatif iplikli DNADNA üzerinden sentezlenir.
Bu aşamada pgRNApgRNA, polimerazın RNase HRNase\ H aktivitesi ile parçalanmış durumdadır.

Anahtar Kavram

HBV replikasyon döngüsü ve RNA moleküllerinin işlevleri
Tahmini Süre:1m 30s
Bu soruyu puanla