Bir moleküler viroloji çalışmasında, Hepatit D virüsü (HDV) ile enfekte hücrelerde zamana … — TUS - Tıpta Uzmanlık Sınavı

Bir moleküler viroloji çalışmasında, $Hepatit$ $D$ virüsü ( $HDV$ ) ile enfekte hücrelerde zamana bağlı olarak viral $RNA$ sentezi ve virion paketlenme oranları izlenmiştir. Elde edilen verilerde, enfeksiyonun erken döneminde baskın olan genomik replikasyonun, $L-HDAg$ ( $Large$ $Delta$ $Antijeni$ ) konsantrasyonunun artışıyla beraber dramatik şekilde azaldığı ve virüsün hücreden çıkış fazına (tomurcuklanma) geçtiği saptanmıştır. Bu biyolojik 'anahtarlama' (switch) sürecinde, $L-HDAg$ sentezini mümkün kılan temel moleküler mekanizma aşağıdakilerden hangisidir?

Konak hücreye ait 'adenosine deaminase acting on RNA' ( $ADAR1$ ) enziminin, antijenomik $RNA$ üzerindeki kehribar ( $amber$ ) durdurma kodonunu ( $UAG$ ) değiştirerek okuma çerçevesini uzatmasıCevap
B
Viral $RNA$ polimerazın, $HBsAg$ varlığında revers transkriptaz aktivitesi kazanarak $RNA$ - $DNA$ hibrid formları üzerinden replikasyonu durdurması
C
Hücre içi $HBsAg$ düzeyinin kritik bir eşiği aşmasıyla birlikte, viral $RNA$ 'nın ribozim aktivitesinin indüklenerek genomik formların parçalanması
D
$Small$ $Delta$ $Antijeninin$ ( $S-HDAg$ ) çekirdekçik ( $nükleolus$ ) içinde hiperfosforilasyona uğrayarak konak $RNA$ polimeraz $II$ ile olan etkileşimini sonlandırması
E
Viral genomun dairesel yapısının bozularak lineer forma geçmesi ve bu formun sadece paketlenme sinyalleri taşıyan $mRNA$ sentezine izin vermesi

Cevap

L-HDAg sentezi, konak hücresine ait ADAR1 enziminin antijenomik RNA'daki durdurma kodonunu (UAG) triptofan kodonuna (UGG) dönüştüren 'RNA editing' işlemi sayesinde gerçekleşir.

Hepatit D virüsü (HDV), replikasyon stratejisini değiştirmek için konak hücresinin ADAR1 (adenosine deaminase acting on RNA) enzimini kullanır. Bu enzim, replikasyon sırasında oluşan antijenomik RNA üzerindeki UAG durdurma kodonundaki adenozini inozine dönüştürür. Translasyon sırasında bu bölge triptofan (UGG) olarak okunur ve protein sentezi durmayarak daha uzun olan L-HDAg sentezlenir. L-HDAg, viral replikasyonu baskılarken virionun HBsAg ile paketlenmesini indükler.

Adım Adım Çözüm

HDV replikasyon döngüsünü analiz et

Başlangıçta sadece S-HDAg üretilir ve bu protein viral RNA replikasyonunu destekler.

S-HDAg, konak RNA polimeraz II'yi viral RNA kalıbını kullanmaya yönlendirir.

Replikasyonun ilerleyen evrelerindeki moleküler değişikliği belirle

Konak hücresine ait ADAR1 enzimi, antijenomik RNA üzerindeki UAG (amber) stop kodonundaki adenozini deamine ederek inozine dönüştürür (UIG).

Bu süreç 'RNA editing' olarak adlandırılır.

Translasyon sonucunu değerlendir

Hücre inozini guanozin olarak algılar, böylece durdurma kodonu UGG (Triptofan) kodonuna dönüşür ve protein sentezi 19 amino asit daha uzayarak L-HDAg'yi oluşturur.

Durdurma kodonunun ortadan kalkması proteinin C-terminalinin uzamasını sağlar.

L-HDAg'nin fonksiyonel etkisini belirle

L-HDAg replikasyonu inhibe eder ve C-terminalindeki prenillenme (farnesillenme) sinyali sayesinde HBsAg ile etkileşime girerek paketlenmeyi başlatır.

L-HDAg virion montajı için esastır ancak replikasyon için inhibitördür.

Anahtar Kavram

HDV'de replikasyondan paketlenmeye geçiş, ADAR1 aracılı RNA düzenlemesi (RNA editing) ile kontrol edilir.

Soru

Cevap

Adım Adım Çözüm

Anahtar Kavram

Sık Yapılan Hatalar

Konular

Bu konudan daha fazla soru