Viroloji

458 soru

Soru 281Soru

2828 yaşında kadın hasta, 3636 saattir devam eden yüksek ateş, yaygın miyalji ve kuru öksürük şikayetleri ile başvuruyor. Yapılan hızlı antijen testi sonucunda Influenza A pozitif saptanıyor. Hastaya, viral replikasyon döngüsünün erken evrelerinde görev alan, viral mRNAmRNA sentezi için gerekli olan 'cap-snatching' (başlık çalma) mekanizmasını, polimeraz asidik (PAPA) proteininin endonükleaz aktivitesini inhibe ederek bozan bir antiviral ilaç planlanıyor. Bahsedilen bu güncel antiviral ilaç aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Baloksavir marboksil

Cevap

Polimeraz asidik (PAPA) proteininin endonükleaz aktivitesini inhibe ederek 'cap-snatching' mekanizmasını bozan ilaç Baloksavir marboksildir.
Baloksavir marboksil, bir ön ilaç olup aktif formuna dönüştüğünde Influenza virüslerinin polimeraz kompleksindeki PAPA (polimeraz asidik) alt biriminin endonükleaz aktivitesini seçici olarak inhibe eder. Bu enzim, konak hücrenin mRNAmRNA moleküllerinden 55' başlık (capcap) yapılarını kesip çıkararak viral mRNAmRNA sentezi için primer olarak kullanır ('cap-snatching'). Bu işlemin engellenmesi, virüsün çoğalmasını replikasyonun başlangıç aşamasında durdurur.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik tabloyu ve etkeni tanımla.
Hasta Influenza A enfeksiyonu geçirmektedir.
Yüksek ateş, miyalji, öksürük ve pozitif antijen testi Influenza tanısını doğrular.
2
Belirtilen antiviral mekanizmayı analiz et.
'Cap-snatching' (başlık çalma) ve PAPA endonükleaz inhibisyonu hedeflenmektedir.
Bu mekanizma viral mRNAmRNA sentezinin başlatılması için gereklidir.
3
Mekanizmaya uygun ilacı seçeneklerden belirle.
Baloksavir marboksil bu mekanizmaya sahip tek seçenektir.
Oseltamivir salınımı, Rimantadin soyulmayı, Favipiravir polimerazı (RdRp) inhibe eder.

Anahtar Kavram

Baloksavir marboksil, Influenza virüs polimeraz kompleksindeki PAPA ünitesinin endonükleaz aktivitesini inhibe ederek viral mRNAmRNA transkripsiyonunu önler.

Alternatif Yöntem

Klinik bir ipucu olarak: Baloksavir marboksil tek doz olarak uygulanırken, oseltamivir genellikle 55 gün boyunca günde iki kez kullanılır. Ayrıca baloksavir, oseltamivir direncinden bağımsız olarak etki gösterir.
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 282Soru

Viral aşıların biyolojik yapıları, immün sistemle etkileşim mekanizmaları ve klinik uygulama prensipleri dikkate alındığında, bu aşı türleri ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Canlı atenüe viral aşılar, konak hücre içerisinde replike olabildikleri için hem hümoral hem de güçlü bir hücresel (CD8+ sitotoksik T hücresi) immün yanıt indüklerler.

Cevap

Canlı atenüe viral aşılar, konak hücre içerisinde çoğalabildikleri (replikasyon) için hem antikor yanıtını hem de güçlü bir hücresel immün yanıtı (sitotoksik T hücreleri) tetiklerler.
Doğru yanıt olan seçenek, canlı atenüe aşıların temel avantajını vurgulamaktadır. Bu aşılar, doğal enfeksiyonu taklit ederek hücre içinde çoğalır. Bu replikasyon süreci, viral proteinlerin sitozolde işlenip MHC Sınıf I molekülleriyle CD8+ sitotoksik T hücrelerine sunulmasını sağlar. Aynı zamanda antikor yanıtını (hümoral bağışıklık) da güçlü bir şekilde indükleyerek tam bir koruma sağlarlar.

Adım Adım Çözüm

1
Aşı türlerinin immünolojik sunum yollarını karşılaştır.
Canlı aşılar endojen (hücre içi) replikasyon yaparak MHC-I üzerinden CD8+ T hücrelerini uyarırken, inaktive aşılar eksojen yolakla MHC-II üzerinden sunulur.
İmmün yanıtın niteliği antijenin işlenme sürecine bağlıdır.
2
Klinik kontrendikasyonları değerlendir.
Canlı aşılar fetal enfeksiyon riski nedeniyle gebelikte kontrendikedir, inaktif ve rekombinant aşılar ise güvenlidir.
Atenüe edilmiş patojenlerin teorik olarak konakta hastalık yapma veya fetüse geçme riski vardır.

Anahtar Kavram

Canlı atenüe aşılar, MHC-I yoluyla hücresel (sitotoksik) yanıtı uyarma kapasitesi ve replikasyon yetenekleri sayesinde uzun süreli bağışıklık sağlarlar.

İpuçları

1
Antijenin hücre içinde çoğalıp çoğalmaması, MHC-I veya MHC-II üzerinden sunulmasını belirler.

Daha Fazla Pratik

Polio aşıları arasındaki (Salk vs Sabin) immünolojik farkları ve kontrendikasyonları tekrar gözden geçirin.
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 283Soru

4242 yaşında bir cerrah, 66 ay önce geçirdiği cerrahi operasyon sırasında şüpheli bir iğne batması öyküsü nedeniyle kontrol amaçlı tetkiklerini yaptırıyor. Hastanın serolojik sonuçları şu şekildedir:

- HBsAg: Negatif
- Anti-HBs: Pozitif (150150 mIU/mL)
- Anti-HBc Total: Pozitif

Bu serolojik profil ve klinik öyküye göre, bu kişi hakkında yapılabilecek en doğru yorum aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Doğal enfeksiyon sonrası bağışıklık gelişmiştir

Cevap

Hastanın serolojik profili (HBsAg -, Anti-HBs +, Anti-HBc Total +), kişinin virüsle karşılaştığını ve enfeksiyonu doğal yoldan atlatarak bağışıklık kazandığını göstermektedir.
Serolojik tabloda HBsAg negatif, Anti-HBs pozitif ve Anti-HBc Total pozitif olarak verilmiştir. HBsAg negatifliği enfeksiyonun sonlandığını, Anti-HBs pozitifliği bağışıklığı temsil eder. Anti-HBc Total'in pozitif olması, kişinin bağışıklığının aşı kaynaklı değil, virüsün tamamıyla karşılaşılması (doğal enfeksiyon) sonucu oluştuğunu kesinleştirir.

Adım Adım Çözüm

1
HBsAg sonucunu değerlendir
HBsAg'nin negatif olması, hastada şu an aktif (akut veya kronik) bir HBV enfeksiyonu olmadığını gösterir.
HBsAg, enfeksiyonun varlığını gösteren ilk yüzey belirtecidir.
2
Anti-HBs sonucunu değerlendir
Anti-HBs'nin pozitif olması (>10>10 mIU/mL), hastanın HBV'ye karşı bağışık olduğunu kanıtlar.
Anti-HBs, nötralizan antikordur ve koruyucu bağışıklığın göstergesidir.
3
Anti-HBc Total sonucunu değerlendirerek bağışıklığın kökenini belirle
Anti-HBc Total pozitifliği, hastanın vücudunun HBV core (çekirdek) antijeniyle karşılaştığını gösterir. Bu durum ancak doğal enfeksiyonla mümkündür.
HBV aşıları sadece HBsAg (yüzey antijeni) içerir, core antijeni içermez. Bu nedenle aşılananlarda Anti-HBc Total pozitifleşmez.

Anahtar Kavram

Hepatit B bağışıklığının ayırıcı tanısında Anti-HBc Total kullanımı
Tahmini Süre:1m 15s
Soru 284Soru

66 aylık bir bebekte ani başlayan sulu diyare, kusma ve hafif ateş şikayetleri ile başvurulmuştur. Yapılan laboratuvar incelemelerinde etkenin zarfsız, ikosahedral simetrili ve segmentli bir genom yapısına sahip olduğu saptanmıştır. Bu virüsün nükleik asit yapısı ve replikasyon stratejisi ile ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Genomu çift iplikli RNA'dır ve mRNA sentezi için virion içerisinde RNA bağımlı RNA polimeraz enzimi taşır.

Cevap

Virüsün genomu çift iplikli RNA yapısındadır ve replikasyon için virion içerisinde RNA bağımlı RNA polimeraz enzimi taşımaktadır.
Doğru seçenek, virüsün çift iplikli RNA genomuna sahip olduğunu ve virion içerisinde RNA bağımlı RNA polimeraz taşıdığını belirten ifadedir. Reoviridae ailesi (Rotavirüs dahil) üyeleri, ökaryotik hücrelerde bulunmayan bir mekanizma ile çift iplikli RNA'yı şablon olarak kullanarak mRNA sentezlemek zorundadırlar. Bu işlem için gerekli olan polimeraz enzimi nükleokapsid içerisinde hazır bulunur.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik ve morfolojik verileri değerlendir.
Etkenin çocukluk çağı diyarelerinin en önemli nedeni olan Rotavirüs (Reoviridae ailesi) olduğu belirlenir.
Bebekte sulu diyare, zarfsız ve segmentli yapı Reoviridae familyası için tipik özelliklerdir.
2
Virüsün genomik yapısını analiz et.
Reoviridae ailesinin tüm RNA virüsleri arasında benzersiz olan çift iplikli RNA (dsRNAdsRNA) genomuna sahip olduğu saptanır.
Bu yapısal özellik, bu aileyi diğer tüm RNA virüs gruplarından ayıran temel taksonomik kriterdir.
3
Replikasyon stratejisini belirle.
Virüsün kendi RNA bağımlı RNA polimeraz (RdRpRdRp) enzimini virion içerisinde taşıması gerektiği sonucuna varılır.
Çift iplikli RNA genomu doğrudan mRNA olarak işlev göremez ve ökaryotik hücrelerde çift iplikli RNA'yı mRNA'ya transkribe edecek bir enzim sistemi bulunmaz.

Anahtar Kavram

Reoviridae ailesinin (Rotavirüs) çift iplikli RNA genomu ve virion içi RNA bağımlı RNA polimeraz taşıma zorunluluğu.
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 285Soru

Viral replikasyonun son basamağı olan olgunlaşma ve salınım sürecinde, bazı virüsler konak hücrenin farklı membran sistemlerinden tomurcuklanarak zarf kazanırlar. Aşağıdaki yapısal özelliklerin tamamına sahip olan bir virüsün, zarfını konak hücre nükleer membranından (çekirdek zarı) tomurcuklanarak kazanması beklenir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Çift iplikli lineer DNADNA genomu, ikozahodral simetri

Cevap

Çift iplikli lineer DNADNA genomu ve ikozahodral simetriye sahip olan Herpesvirüslerin nükleer membrandan tomurcuklanması beklenir.
Çift iplikli lineer DNADNA genomu ve ikozahodral simetriye sahip olan virüs grubu Herpesvirüslerdir (Herpesviridae). Bu ailedeki virüsler (HSV, VZV, CMV, EBV vb.) nükleokapsidlerini çekirdek içinde kurarlar ve çekirdek iç zarından (nükleer membran) tomurcuklanarak sitoplazmaya geçerler. Bu, genel virolojide spesifik ve ayırt edici bir replikasyon özelliğidir.

Adım Adım Çözüm

1
Tomurcuklanma bölgesini analiz et.
Nükleer membrandan (çekirdek zarı) tomurcuklanma özelliği belirlendi.
Tıbbi önemi olan virüsler arasında sadece Herpesviridae ailesi zarfını nükleer membran üzerinden kazanır.
2
Belirlenen virüs ailesinin yapısal özelliklerini eşleştir.
Herpesvirüsler; çift iplikli lineer DNADNA genomuna ve ikozahodral nükleokapsid simetrisine sahiptir.
Virüs sınıflandırmasında nükleik asit tipi ve kapsid simetrisi temel ayırt edici kriterlerdir.
3
Diğer seçeneklerdeki yanlış yapı-mekanizma eşleşmelerini ele.
RNARNA virüslerinin ve diğer DNADNA virüslerinin (Hepadna, Pox vb.) tomurcuklanma yerleri farklıdır.
Hepatit B virüsü ER'den, Coronavirüsler ERGIC'ten, çoğu negatif RNARNA virüsü ise plazma membranından tomurcuklanır.

Anahtar Kavram

Herpesvirüslerin replikasyon döngüsünde nükleer membrandan tomurcuklanarak zarf kazanması.
Tahmini Süre:1m 15s
Soru 286Soru

29 yaşında damar içi madde bağımlılığı öyküsü olan erkek hasta; son bir haftadır gelişen iştahsızlık, bulantı, sağ üst kadran ağrısı ve göz aklarında sararma şikayetleriyle başvuruyor. Fizik muayenesinde belirgin ikter saptanıyor ve karaciğer kot altında 2 cm2 \text{ cm} palpabl, hassas olarak bulunuyor. Laboratuvar tetkiklerinde ALT:2.450 U/LALT: 2.450 \text{ U/L} ve AST:1.980 U/LAST: 1.980 \text{ U/L} olarak saptanıyor. Hastanın hepatit serolojisi sonuçları şöyledir:

- HBsAgHBsAg: Pozitif
- AntiHBcAnti-HBc IgMIgM: Pozitif
- HBeAgHBeAg: Pozitif
- AntiHDVAnti-HDV: Pozitif
- HDVRNAHDV-RNA: Pozitif

Bu bulgulara göre hastada en olası klinik tablo aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Akut Hepatit B ve Hepatit D ko-enfeksiyonu

Cevap

Akut Hepatit B ve Hepatit D ko-enfeksiyonu
Hastada saptanan AntiHBcAnti-HBc IgMIgM pozitifliği, Hepatit B enfeksiyonunun yeni (akut) olduğunu gösterir. Bu tabloya eşlik eden AntiHDVAnti-HDV ve HDVRNAHDV-RNA pozitifliği, her iki virüsün (HBV ve HDV) aynı anda veya çok kısa aralıklarla bulaştığını, yani 'ko-enfeksiyon' geliştiğini kanıtlar. Ko-enfeksiyon genellikle fulminan hepatit riskini artırsa da, kronikleşme oranı süperenfeksiyona göre çok daha düşüktür.

Adım Adım Çözüm

1
Hepatit B durumunun değerlendirilmesi
HBsAgHBsAg (+), AntiHBcAnti-HBc IgMIgM (+) ve yüksek aminotransferaz düzeyleri
AntiHBcAnti-HBc IgMIgM pozitifliği, enfeksiyonun akut olduğunu (son 6 ay içinde alındığını) gösterir.
2
Hepatit D durumunun değerlendirilmesi
AntiHDVAnti-HDV (+) ve HDVRNAHDV-RNA (+)
HDVRNAHDV-RNA pozitifliği, HDV'nin replike olduğunu ve aktif enfeksiyon oluşturduğunu kanıtlar.
3
Ko-enfeksiyon ve Süperenfeksiyon ayrımının yapılması
Akut HBV + Aktif HDV = Ko-enfeksiyon
Eğer AntiHBcAnti-HBc IgMIgM negatif olsaydı, tablo 'Kronik HBV üzerine HDV süperenfeksiyonu' olarak adlandırılırdı.

Anahtar Kavram

Hepatit B ve D ko-enfeksiyonu ile süperenfeksiyonu arasındaki serolojik farkın (Anti-HBc IgM) ayırt edilmesi.
Soru 287Soru

HIV1HIV-1 enfeksiyonu sırasında, enfekte konak hücre yüzeyindeki CD4CD4 moleküllerinin ve MHCMHC Sınıf I ekspresyonunun aşağı regülasyonunu (down-regulation) sağlayarak virüsün sitotoksik T lenfositlerden kaçışına yardımcı olan viral protein aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: nef

Cevap

Nef proteini
Doğru seçenek olan Nef proteini, enfekte hücre yüzeyindeki CD4CD4 reseptörlerini ve MHCMHC Sınıf I moleküllerini aşağı regüle ederek virüsün immün denetimden kaçmasını sağlar. Bu etki, özellikle sitotoksik T lenfositlerin (CTLCTL) enfekte hücreyi tanımasını zorlaştırır.

Adım Adım Çözüm

1
HIV-1 düzenleyici ve aksesuar proteinlerinin immün sistemle olan etkileşimlerini analiz et.
Nef proteininin 'Negative Factor' olarak adlandırılan ve patogenezde kritik rol oynayan bir aksesuar protein olduğu belirlendi.
Soru, immün kaçış mekanizması olan MHC-I ve CD4 aşağı regülasyonunu sormaktadır.
2
Nef proteininin spesifik hücresel etkilerini doğrula.
Nef'in, konak hücre yüzeyindeki CD4 ve MHC Sınıf I moleküllerini endositoz yoluyla internalize ettiği veya trans-Golgi ağında tuttuğu bilgisi doğrulandı.
Bu mekanizma, enfekte hücrelerin CD8+ sitotoksik T hücreleri tarafından tanınmasını engeller.

Anahtar Kavram

HIV-1 Nef proteini ve immün kaçış mekanizmaları
Soru 288Soru

Yaz kampında kalan bir grup öğrencide ateş, boğaz ağrısı ve bilateral konjonktivit ile seyreden bir salgın saptanmıştır. Yapılan incelemeler sonucunda bu tabloya bir DNA virüsünün neden olduğu belirlenmiştir. Bu virüs ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: İkozahedral simetrili, zarfsız bir yapıya sahiptir ve kapsid köşelerinden uzanan fiber proteinleri bulunur.

Cevap

İkozahedral simetrili, zarfsız bir yapıya sahiptir ve kapsid köşelerinden uzanan fiber proteinleri bulunur.
Vakada tanımlanan ateş, farenjit ve bilateral konjonktivit tablosu Adenovirüsler tarafından oluşturulan 'Faringokonjonktival Ateş' tablosudur. Adenovirüsler ikozahedral simetrili, zarfsız virüslerdir. En karakteristik yapısal özellikleri kapsid köşelerinden (penton üniteleri) dışarı doğru uzanan ve konak hücre reseptörlerine tutunmayı sağlayan fiber proteinleridir.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik tabloyu analiz etme
Faringokonjonktival ateş (ateş, farenjit ve konjonktivit üçlemesi).
Belirtilen semptomlar tipik bir Adenovirüs enfeksiyonu salgınını işaret etmektedir.
2
Etkeni tanımlama
Adenoviridae ailesi.
Özellikle havuzlar veya toplu yaşam alanlarında görülen bu tip salgınların en yaygın DNA virüsü etkeni Adenovirüslerdir.
3
Etkenin yapısal özelliklerini belirleme
Zarfsız, ikozahedral kapsidli ve fiber proteinli yapı.
Adenovirüsler, konak hücreye tutunmak için kapsid köşelerindeki penton tabanından uzanan fiberleri kullanan karakteristik bir yapıya sahiptir.

Anahtar Kavram

Adenovirüslerin yapısal özellikleri ve klinik prezentasyonu (Faringokonjonktival ateş).

Daha Fazla Pratik

Adenovirüslerin hücre kültüründe oluşturduğu karakteristik sitopatik etkileri (üzüm salkımı şeklinde hücre kümelenmesi) inceleyebilirsiniz.
Tahmini Süre:1m 15s
Soru 289Soru

Ağır solunum yetmezliği tablosuyla başvuran bir hastada saptanan viral etkenin; 273227-32 kb uzunluğunda pozitif polariteli tek iplikli RNA genomuna sahip olduğu, zarflı yapıda olduğu ve elektron mikroskobunda nükleokapsidinin helikal simetri sergilediği gözlenmiştir. Ayrıca bu virüsün, genomundaki hataları düzelten 353'-5' ekzonükleaz (ExoN) aktivitesine sahip olduğu belirlenmiştir. Bu virüs aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: SARS-CoV-2

Cevap

Söz konusu virüs SARS-CoV-2'dir.
Doğru kabul edilen virüs, Coronaviridae ailesinin bir üyesidir. Bu aile, pozitif polariteli tek iplikli RNA genomuna sahip olmasına rağmen, diğer pozitif RNA virüslerinden farklı olarak helikal nükleokapsid simetrisine sahiptir. Ayrıca, RNA virüsleri içinde bilinen en büyük genoma (273227-32 kb) sahiptirler ve replikasyon sırasında oluşan mutasyonları nsp14 (ExoN) enzimi ile düzeltebilirler. Klinik tablo olan ağır solunum yetmezliği de bu virüs grubuyla (SARS, MERS, SARS-CoV-2) uyumludur.

Adım Adım Çözüm

1
Nükleik asit tipi ve polaritesini değerlendir
Soruda belirtilen pozitif polariteli RNA genomu; Coronaviridae, Picornaviridae ve Flaviviridae gibi aileleri işaret eder.
Virüslerin sınıflandırılmasında genom tipi ilk basamaktır.
2
Nükleokapsid simetrisini incele
Pozitif polariteli RNA virüslerinin çoğu ikozahedral simetriye sahipken, Coronaviridae ailesi (SARS-CoV-2 dahil) helikal simetri gösteren önemli bir istisnadır.
Yapısal özellikler virüs aileleri arasında ayırt edicidir.
3
Genom büyüklüğü ve hata düzeltme mekanizmasını analiz et
Yaklaşık 3030 kb büyüklüğündeki genom ve nsp14 proteini ile sağlanan 353'-5' ekzonükleaz aktivitesi Coronaviridae ailesine özgüdür.
Çoğu RNA virüsü hata düzeltme yeteneğinden yoksundur ve bu kadar büyük genoma sahip olamaz.

Anahtar Kavram

Coronaviridae ailesinin yapısal ve genetik özgünlükleri (Pozitif RNA, Helikal simetri, Büyük genom ve ExoN aktivitesi).

Alternatif Yöntem

Symmetry-Polarity eşleşmesi yapılarak elenebilir: Pozitif RNA + Helikal kombinasyonu sadece Coronaviruslar ve diğer Nidovirales üyeleri için geçerlidir.
Tahmini Süre:2m 0s
Soru 290Soru

3232 yaşındaki erkek hasta, dudak kenarında tekrarlayan, ağrılı ve içi şeffaf sıvı dolu küçük kabarcıklar (vezikül) şikayetiyle dermatoloji polikliniğine başvurmuştur. Lezyonun tabanından yapılan kazıntı örneğinin Tzanck yaymasında multinükleer dev hücreler saptanmıştır. Bu hastadaki klinik tabloya neden olan virüsün temel yapısal özelliği aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Zarflı bir yapıya, ikozahedral simetriye ve çift iplikli DNA genomuna sahip olması

Cevap

Herpesvirüsler zarflı bir yapıya, ikozahedral kapsid simetrisine ve çift iplikli DNA genomuna sahiptir.
Hastada görülen veziküler lezyonlar ve Tzanck yaymasındaki multinükleer dev hücre bulgusu Herpes Simplex Virüs (HSVHSV) enfeksiyonunu tanımlar. HSVHSV, Herpesviridae ailesinin bir üyesidir. Bu ailedeki virüsler zarflı yapıdadır, kapsidleri ikozahedral simetri gösterir ve genomları lineer çift iplikli DNA'dan oluşur.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik ve laboratuvar bulgularının analizi
Etkenin Herpes Simplex Virüs (HSVHSV) olduğu saptanmıştır.
Dudak kenarındaki ağrılı veziküller ve Tzanck yaymasındaki multinükleer dev hücreler HSVHSV enfeksiyonu için patognomoniktir.
2
Etkenin ait olduğu virüs ailesinin yapısal özelliklerinin belirlenmesi
Herpesviridae ailesinin genel özellikleri değerlendirilir.
HSVHSV, Herpesviridae ailesinin bir üyesidir ve bu ailedeki tüm virüsler zarflı, ikozahedral simetrili ve çift iplikli DNA genomuna sahiptir.

Anahtar Kavram

Herpesviridae ailesinin yapısal ve replikatif özellikleri
Tahmini Süre:1m 15s
Soru 291Soru

Sitomegalovirüs (CMVCMV) retiniti tanısı alan HIVHIV pozitif bir hastada, başlanan antiviral tedavinin doz kısıtlayıcı nefrotoksisite etkisini azaltmak amacıyla tedavi protokolüne intravenöz hidrasyon ve oral probenesid eklenmiştir.

Buna göre, bu hastada kullanılan antiviral ilacın etki mekanizması aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Konak hücre kinazları tarafından aktif difosfat formuna dönüştürülen bir nükleotid analoğu olarak DNADNA polimerazı inhibe etme

Cevap

İlacın etki mekanizması, konak hücre kinazları tarafından aktif difosfat formuna dönüştürülen bir nükleotid (sitozin monofosfat) analoğu olarak viral DNADNA polimerazı inhibe etmesidir.
Vaka sorusunda tanımlanan ilaç Sidofovir'dir. Sidofovir, bir sitidin monofosfat (nükleotid) analoğudur. Diğer birçok antiviralin aksine, aktif hale gelmek için viral kinazlara (örneğin CMVCMV'nin UL97UL97 kinazı) ihtiyaç duymaz; doğrudan konak hücre kinazları tarafından difosfat formuna (fonksiyonel olarak nükleozid trifosfat dengi) dönüştürülür. Ciddi nefrotoksisite riski nedeniyle, böbrek tübüllerinden sekresyonunu azaltmak için probenesid ile birlikte verilmesi karakteristiktir.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik ipuçlarını değerlendir.
CMVCMV retiniti tedavisinde kullanılan ve nefrotoksisiteyi önlemek için probenesid gerektiren ilacın Sidofovir olduğu saptandı.
Sidofovir, proksimal tübüllerden organic anion transporter-1 (OAT1OAT-1) ile salınır; probenesid bu taşıyıcıyı bloke ederek ilacın böbrek hücrelerinde birikmesini ve toksisitesini engeller.
2
İlacın biyokimyasal sınıfını belirle.
Sidofovir bir nükleotiddir (asiklovir ve gansiklovir gibi nükleozid değildir).
Yapısında halihazırda bir fosfat grubu (sitozin monofosfat analoğu) bulundurur.
3
Aktivasyon mekanizmasını analiz et.
Sidofovir, viral kinazlara (UL97UL97 gibi) ihtiyaç duymaz; sadece konak hücre kinazları tarafından fosforile edilir.
Nükleotid yapısında olması, viral kinaz gerektiren ilk fosforilasyon basamağını baypas etmesini sağlar.
4
Nihai etkiyi belirle.
Aktif difosfat formu, viral DNADNA polimerazı yarışmalı olarak inhibe eder ve DNADNA zincirine katılarak sentezi durdurur.
Antiviral etkinin temel mekanizması nükleik asit sentezinin durdurulmasıdır.

Anahtar Kavram

Sidofovir'in nükleotid yapısı sayesinde viral kinazdan bağımsız aktivasyonu ve probenesid ile yönetilen nefrotoksisitesi.

Alternatif Yöntem

Eğer soruda 'probenesid' anahtar kelimesi geçiyorsa, TUS farmakoloji ve mikrobiyoloji sorularında akla gelmesi gereken ilk antiviral Sidofovir'dir. Sidofovir ile ilgili en kritik bilgi ise 'nükleotid' olması ve viral kinaza ihtiyaç duymamasıdır.
Tahmini Süre:2m 0s
Soru 292Soru

3434 yaşında AIDS tanılı erkek hasta, görme keskinliğinde azalma şikayetiyle başvuruyor. Oftalmolojik muayenede her iki retinada yaygın eksuda ve hemoraji ("pizza peyniri ve ketçap" görünümü) saptanıyor. Hastaya başlanan gansiklovir tedavisine 33 hafta sonunda klinik yanıt alınamıyor ve yapılan direnç testlerinde viral UL97UL97 protein kinaz geninde mutasyon olduğu doğrulanıyor. Bu hastada gansiklovir direncinin üstesinden gelmek amacıyla kullanılabilecek olan sidofovir (cidofovir) ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi, bu ilacın dirençli suşa karşı etkili olmasını sağlayan temel mekanizmadır?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Bir nükleotid (fosfonat) analoğu olması ve yapısındaki fosfat benzeri grup sayesinde aktivasyon için viral bir enzime gereksinim duymaması

Cevap

Sidofovir bir nükleotid (fosfonat) analoğu olması ve yapısındaki fosfat benzeri grup sayesinde aktivasyon için viral bir enzime (UL97) gereksinim duymaması nedeniyle dirençli suşa karşı etkilidir.
Sidofovir, kimyasal yapısı gereği bir nükleotid (fosfonat) analoğudur. Gansiklovir gibi nükleozid analogları, aktif formlarına dönüşmek için ilk fosforilasyon basamağında viral bir enzime (CMV için UL97UL97 kinaz) ihtiyaç duyarlar. Ancak sidofovir yapısında zaten fosfat benzeri bir grup (fosfonat) taşıdığı için viral kinaz basamağını atlar ve doğrudan konak hücre kinazları tarafından aktive edilir. Bu nedenle UL97UL97 mutasyonu nedeniyle gelişen gansiklovir direncinde etkili bir seçenektir.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik tabloyu ve direnç durumunu tanımlayın.
Hasta CMV retiniti olup, gansiklovire dirençli (UL97UL97 mutasyonu) bir suşla enfektedir.
Gansiklovirin aktive olabilmesi için ilk fosforilasyonu viral UL97UL97 kinaz tarafından yapılmalıdır; bu gendeki mutasyon direnç oluşturur.
2
Alternatif ilaçların (sidofovir ve foskarnet) biyokimyasal özelliklerini karşılaştırın.
Foskarnet bir pirofosfat analoğudur ve aktivasyon gerektirmez. Sidofovir ise bir nükleotid (fosfonat) analoğudur.
İlaçların etki mekanizmalarını bilmek, neden dirençli suşlarda etkili olduklarını anlamayı sağlar.
3
Sidofovirin aktivasyon yolunu belirleyin.
Sidofovir, yapısında fosfonat grubu içerdiği için viral kinaza (UL97UL97) ihtiyaç duymaz; sadece hücresel kinazlarla aktifleşir.
Bu özellik, UL97UL97 mutasyonu olan gansiklovire dirençli CMV suşlarına karşı sidofovirin etkili olmasını sağlar.

Anahtar Kavram

Sidofovir (Cidofovir), bir sitozin nükleotid (fosfonat) analoğudur. Diğer nükleozid analoglarından (asiklovir, gansiklovir) farklı olarak, aktivasyon için gereken ilk fosforilasyon basamağı için viral enzimlere (Viral TK veya UL97) ihtiyaç duymaz.
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 293Soru

Virüslerin yapısal bileşenleri, biyokimyasal özellikleri ve replikasyon stratejileri dikkate alındığında; zarflı virüslerle ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Matriks proteinleri, nükleokapsid ile zarf arasında yer alarak virionun yapısal bütünlüğünü sağlar ve tomurcuklanma (budding) sürecinde kritik rol oynar.

Cevap

Matriks proteinleri, nükleokapsid ile zarf arasında yer alarak virionun yapısal bütünlüğünü sağlar ve tomurcuklanma sürecinde görev alır.
Zarflı virüslerde nükleokapsid ile lipid zarf arasında bulunan matriks (M) proteinleri, virionun yapısal bütünlüğünü korumasının yanı sıra, replikasyonun son aşamasında viral bileşenlerin bir araya gelmesini ve virüsün hücre membranından tomurcuklanarak çıkmasını organize eder.

Adım Adım Çözüm

1
Zarflı virüslerin temel katmanlarını analiz et.
Zarflı virüsler içten dışa; nükleik asit, kapsid (nükleokapsid), matriks tabakası (bazı virüslerde) ve lipid zarftan oluşur.
Virüs yapısını anlamak her bileşenin fonksiyonunu belirlemek için temeldir.
2
Matriks (M) proteininin konumunu ve fonksiyonunu değerlendir.
Matriks proteinleri nükleokapsid ile dış zarf arasında bir köprü görevi görür.
Bu proteinler hem yapısal iskeleti oluşturur hem de viral genomun zarflı bölgeye yönlendirilmesini sağlayarak tomurcuklanmayı yönetir.
3
Diğer yapısal ve biyolojik kuralları doğrula.
Lipidlerin konaktan alındığı, zarfın hassasiyet yarattığı ve helikal simetrinin RNA virüslerine özgü olduğu bilgilerini karşılaştır.
Seçenekler arasındaki yanlış biyolojik genellemeleri eleyerek doğru sonuca ulaşılır.

Anahtar Kavram

Zarflı Virüs Yapısı ve Matriks Proteinleri
Tahmini Süre:1m 15s
Soru 294Soru

Virüslerin hücre tropizmi, viral yüzey proteinleri ile konak hücre reseptörleri arasındaki özgül etkileşime dayanır. Kompleman reseptörü 2 (CR2CR2 / CD21CD21) molekülünü kullanarak B lenfositleri enfekte eden DNA virüsü ile ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Nükleokapsidi etrafında konak hücre membranından köken alan bir zarf yapısı bulunur.

Cevap

B lenfositlerdeki CD21CD21 reseptörüne bağlanan virüs Epstein-Barr virüsüdür (EBVEBV) ve bu virüs zarflı bir yapıya sahiptir.
Soru kökünde tanımlanan, CD21CD21 (CR2CR2) reseptörünü kullanarak B lenfositleri enfekte eden virüs Epstein-Barr virüsüdür (EBVEBV). EBV, Herpesviridae ailesinin bir üyesidir ve bu ailenin tüm üyeleri gibi konak hücre membranından köken alan lipid yapıda bir zarfa sahiptir. Bu zarf, virüsün dış ortama ve lipid çözücülere (eter, kloroform vb.) karşı duyarlı olmasına neden olur.

Adım Adım Çözüm

1
Reseptör bilgisinden virüsü tanımlama
Epstein-Barr virüsü (EBVEBV)
CD21CD21 (CR2CR2) reseptörü, EBV'nin B lenfositlere tutunmak için kullandığı spesifik reseptördür.
2
Tanımlanan virüsün taksonomik özelliklerini değerlendirme
Herpesviridae ailesi üyesi; zarflı, çift iplikli doğrusal DNADNA genomu
EBV bir Gamma-herpesvirüs olup ailesinin temel yapısal özelliklerini (zarf, ikozahedral kapsid, tegüment) taşır.
3
Seçenekleri bu özelliklere göre analiz etme
Zarflı olduğu bilgisi doğrudur
Herpesvirüslerin tümü zarflıdır.

Anahtar Kavram

EBV Reseptörü ve Yapısal Özellikleri
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 295Soru

Viral antijenlerin hümoral immünite yanında etkin bir sitotoksik T hücre (CD8+CD8^+) yanıtı oluşturabilmesi için antijenin endojen yolla işlenerek MHC Sınıf I molekülleri ile sunulması gereklidir. Bu süreçte viral proteinlerin proteazomlarda yıkılması ve TAP (Transporter associated with antigen processing) proteinleri aracılığıyla endoplazmik retikulum (ERER) lümenine taşınması kritik basamaklardır. Aşağıdaki aşılardan hangisinin immünolojik mekanizması, bu endojen sunum yolunun aktif kullanımına en fazla bağımlıdır?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Kızamık aşısı

Cevap

Kızamık aşısı, canlı atenüe bir aşı olduğu için viral replikasyon yoluyla endojen antijen sunumunu (MHC Sınıf I, TAP ve Proteazom bağımlı) tetikler.
Kızamık aşısı canlı atenüe bir aşıdır. Canlı aşılar konak hücresini enfekte eder ve viral proteinler hücrenin kendi ribozomlarında sentezlenir. Bu endojen proteinler proteazomlar tarafından parçalanır, TAP proteinleri aracılığıyla endoplazmik retikulum lümenine taşınır ve MHC Sınıf I molekülleri ile CD8+CD8^+ T hücrelerine sunulur. Bu süreç, aşının hümoral yanıtın yanı sıra güçlü bir hücresel bağışıklık oluşturmasını sağlar.

Adım Adım Çözüm

1
Aşı tiplerini sınıflandırın.
Kızamık aşısı canlı atenüe; Polio (Salk), Hepatit A ve parenteral İnfluenza aşıları inaktive; HPV aşısı ise rekombinant/subunit aşıdır.
Soruda bahsedilen TAP ve proteazom mekanizması canlı aşıların karakteristik özelliğidir.
2
Antijen işleme yollarını karşılaştırın.
Endojen yol (canlı virus/aşı): Proteazom -> TAP -> ER -> MHC Sınıf I -> CD8+CD8^+ T hücresi. Eksojen yol (ölü/subunit aşı): Endozom -> MHC Sınıf II -> CD4+CD4^+ T hücresi.
Canlı aşılar hücreyi enfekte edip içeride protein sentezlettiği için 'endojen' kaynaklıdır.
3
En fazla bağımlı olan seçeneği belirleyin.
Seçenekler arasındaki tek canlı aşı olan kızamık aşısı bu yola en fazla bağımlıdır.
Diğer seçeneklerdeki ölü veya rekombinant antijenler doğrudan endozomal yolla (eksojen) işlenir.

Anahtar Kavram

Canlı atenüe aşılar, viral replikasyon sayesinde endojen antijen sunum yolunu (MHC Sınıf I) kullanarak hümoral yanıtın yanında güçlü bir hücresel (CD8+CD8^+ sitotoksik) immün yanıt oluştururlar.
Tahmini Süre:2m 0s
Soru 296Soru

Adenovirüs tip 4 ve 7'ye bağlı gelişen akut respiratuar hastalıkları (ARD) önlemek amacıyla özellikle askeri personel gibi riskli gruplarda kullanılan ve virülan (patojenik) suşları içermesine rağmen güvenle uygulanan viral aşı ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Uygulama yolunun (oral) değiştirilmesi sayesinde virüsün respiratuar sistem yerine bağırsak epiteliyle sınırlı asemptomatik bir enfeksiyon oluşturmasıyla bağışıklık sağlar.

Cevap

Adenovirüs tip 4 ve 7 aşısı, uygulama yolunun değiştirilmesi sayesinde respiratuar sistem yerine bağırsakta sınırlı asemptomatik enfeksiyon oluşturarak bağışıklık sağlar.
Adenovirüs tip 4 ve 7 aşıları, virülan virüsü içeren ancak enterik kaplı tabletler şeklinde ağızdan verilen aşılardır. Virüs mideden zarar görmeden geçer ve bağırsak epitelyumunda replike olur. Burada oluşan asemptomatik enfeksiyon, respiratuar sistemde oluşabilecek ciddi hastalıklara (ARD) karşı sistemik ve mukozal bağışıklık sağlar. Bu yöntem, virüsün asıl hedef organı olan akciğerlere ulaşmasını engelleyerek güvenli bir bağışıklama sunar.

Adım Adım Çözüm

1
Aşı tipini ve hedef virüsü tanımlama
Adenovirüs tip 4 ve 7 aşısının askeri personel gibi gruplarda ARD'yi önlemek için kullanılan özel bir aşı olduğu belirlenir.
Bu aşı, klasik aşı türlerinden farklı bir mekanizma ile çalışır.
2
Aşının üretim ve uygulama teknolojisini analiz etme
Aşının atenüe edilmemiş (virülan) virüs içerdiği ve enterik kaplı tabletlerle oral yoldan uygulandığı tespit edilir.
Enterik kaplama, virüsü mide asidinden koruyarak bağırsaklara ulaşmasını sağlar.
3
İmmünolojik mekanizmayı değerlendirme
Bağırsak epitelinde gerçekleşen asemptomatik enfeksiyonun, virüsün asıl hedefi olan respiratuar sistemde hastalık yapmadan sistemik ve mukozal bağışıklık oluşturduğu anlaşılır.
Hastalık oluşmamasının nedeni virüsün zayıflatılması değil, doğal tropizminden farklı bir dokuda (bağırsak) sınırlı kalmasıdır.

Anahtar Kavram

Yerinde sınırlı (site-restricted) non-atenüe canlı viral aşı mekanizması.

Daha Fazla Pratik

Viral aşıların replikasyon yeteneklerine göre MHC-I ve MHC-II üzerinden antijen sunum farklarını gözden geçiriniz.
Tahmini Süre:2m 0s
Soru 297Soru

Viral aşıların immünolojik etkinliği, antijenin konak hücreye giriş yolu ve işlenme mekanizması ile doğrudan ilişkilidir. Canlı atenüe aşılar genellikle sitozolik yolla işlenip MHCIMHC-I üzerinden sunularak güçlü bir sitotoksik hücresel yanıt oluştururken; inaktif, subünit veya rekombinant aşılar eksojen yolla alınarak MHCIIMHC-II molekülleri aracılığıyla TT yardımcı hücrelerine sunulur.

Buna göre, aşağıdakilerden hangisi antijenleri MHCIIMHC-II aracılığıyla sunulan ve RNARNA genomuna sahip bir virüse karşı geliştirilmiş bir aşıdır?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Hepatit A

Cevap

Hepatit A aşısı, RNA genomuna sahip bir virüsün inaktif formunu içerdiği için antijenleri MHC-II üzerinden sunulur.
Doğru cevap olan seçenek, hem bir RNARNA virüsüne karşı geliştirilmiştir hem de antijenleri eksojen yoldan işlenerek MHCIIMHC-II aracılığıyla sunulmaktadır. Hepatit A aşısı, tam viriyon inaktif (ölü) bir aşıdır. İnaktif aşılar hücre içinde çoğalamadıkları için eksojen antijen olarak kabul edilir ve profesyonel antijen sunan hücreler tarafından MHCIIMHC-II molekülleri üzerinde TT yardımcı hücrelerine sunulur. Ayrıca Hepatit A virüsü, RNARNA genomuna sahip bir Picornavirus'tur.

Adım Adım Çözüm

1
Antijen sunum yolunu belirle
MHCIIMHC-II sunumu, aşının inaktif, subünit veya rekombinant (eksojen) yapıda olduğunu gösterir.
Canlı aşılar endojen (sitozolik) yolla işlenirken, inaktif aşılar eksojen yolla işlenir.
2
Genom tipini analiz et
Soruda istenen etkenin RNARNA virüsü olması gerekmektedir.
Hepatit B ve Suçiçeği gibi DNADNA virüslerini elemek için gereklidir.
3
Seçenekleri eşleştir
Hepatit A hem inaktif bir aşıdır hem de RNARNA genomuna (Picornavirus) sahiptir.
Doğru cevaba ulaşmak için iki kriterin de karşılanması gerekir.

Anahtar Kavram

Viral aşıların sınıflandırılmasında genom tipi (DNA/RNA) ve üretim teknolojisinin (Canlı/İnaktif) immün sunum yolu (MHC-I/II) üzerindeki etkisi.
Tahmini Süre:1m 15s
Soru 298Soru

Virüslerin nükleokapsidini çevreleyen lipid yapısındaki zarfın varlığı, virüsün çevresel koşullara direnci ve bulaş yolları üzerinde belirleyicidir. Aşağıdaki DNA virüs ailelerinden hangisi yapısal olarak zarfsız (çıplak) bir kapsid yapısına sahiptir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Adenoviridae

Cevap

Adenoviridae ailesi zarfsız (çıplak) bir DNA virüsüdür.
Adenoviridae ailesi üyeleri (Adenovirüsler), ikozahedral simetrili nükleokapsid yapısına sahip olup bu yapıyı çevreleyen bir lipid zarf bulundurmazlar. Bu özellikleri sayesinde mide asidine ve dış ortam koşullarına karşı oldukça dirençlidirler.

Adım Adım Çözüm

1
DNA virüs ailelerini zarf varlığına göre sınıflandırın.
DNA virüslerinden Parvoviridae, Papillomaviridae, Polyomaviridae ve Adenoviridae zarfsızdır.
Temel morfolojik özelliklerin hatırlanması sorunun çözümünü sağlar.
2
Verilen seçenekler arasında zarfsız olan aileyi belirleyin.
Adenoviridae ailesi zarfsızdır.
Seçeneklerdeki diğer DNA virüsleri (Herpes, Pox, Hepadna) zarflı gruptadır.

Anahtar Kavram

DNA virüslerinin zarflı/zarfsız olma durumuna göre sınıflandırılması.
Tahmini Süre:45s
Soru 299Soru

Allojenik hematopoetik kök hücre nakli yapılan ve sitomegalovirüs (CMV) seropozitif (R+R+) olan erişkin bir hastada, CMV reaktivasyonunu önlemek amacıyla profilaktik olarak kullanılan; viral terminaz kompleksinin pUL56pUL56 alt birimine bağlanarak viral DNA'nın işlenmesini ve paketlenmesini inhibe eden antiviral ajan aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Letermovir

Cevap

Letermovir, CMV DNA'sının paketlenmesini sağlayan terminaz kompleksinin pUL56 ünitesini inhibe ederek etki gösterir.
Letermovir, CMV'ye özgü terminaz kompleksinin pUL56pUL56 alt birimini hedef alarak viral DNA'nın bölünmesini ve kapsid içine paketlenmesini engeller. Bu mekanizma insan hücrelerinde bulunmadığı için toksisitesi düşüktür ve çapraz direnç riski azdır.

Adım Adım Çözüm

1
Hastanın klinik durumu ve profilaksi ihtiyacı değerlendirilir.
Allojenik kök hücre nakli alıcısı ve CMV seropozitif hastada profilaksi endikasyonu vardır.
Bu grup hastalar CMV reaktivasyonu açısından yüksek risk altındadır.
2
Soruda belirtilen spesifik etki mekanizması incelenir.
Viral terminaz kompleksi (pUL56pUL56 alt birimi) hedeflenmektedir.
Bu mekanizma, klasik DNA polimeraz inhibitörlerinden farklı bir aşamayı (DNA paketleme) hedefler.
3
Antiviral ilaçlar etki mekanizmalarına göre elenir.
Gansiklovir, Foskarnet ve Sidofovir DNA polimerazı hedefler; Maribavir ise UL97UL97 kinazı hedefler.
Terminaz inhibisyonu Letermovir'e özgü bir mekanizmadır.
4
Doğru ilaç seçilir.
Letermovir.
Letermovir, belirtilen mekanizma ile CMV profilaksisinde onaylı tek ajandır.

Anahtar Kavram

Letermovir, CMV replikasyon döngüsünde DNA polimeraz aşamasından sonraki basamak olan terminaz (DNA paketleme) kompleksini inhibe eden özgün bir antiviraldir.
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 300Soru

Arenaviridae ailesi (Lassa ateşi virüsü, Lenfositik Koryomenenjit Virüsü - LCMV), elektron mikroskobunda partikül yapısında konak hücre kökenli ribozomları barındırmasıyla karakterize 'kumlu' (sandy) bir görünüme sahiptir. Genomları iki segmentli (L ve S), halkasal görünümlü RNA'dan oluşur ve 'ambisens' (iki yönlü) kodlama stratejisi kullanırlar. Buna göre, Arenavirüslerin S segmentindeki gen ekspresyon stratejisi ile ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Nükleokapsid (N) proteini için mRNA sentezinde genomik RNA, glikoprotein (G) öncülü için mRNA sentezinde ise antijenomik RNA kalıp olarak kullanılır.

Cevap

Nükleokapsid (N) proteinine ait mRNA'nın sentezinde negatif polariteli genomik RNA kalıp olarak kullanılırken, glikoprotein (G) öncülüne ait mRNA'nın sentezinde pozitif polariteli antijenomik RNA kalıp olarak kullanılır.
Arenavirüslerin S segmenti ambisens yapıdadır. Nükleokapsid (N) geni segmentin 3' yarısında yer alır ve negatif polariteli olduğu için genomik RNA üzerinden doğrudan mRNA olarak transkribe edilir. Glikoprotein (G) geni ise segmentin 5' yarısında yer alır ve pozitif polaritelidir; bu nedenle ancak replikasyonun ilerleyen aşamalarında sentezlenen antijenomik RNA (pozitif) üzerinden zıt polaritede bir kalıp kullanılarak transkribe edilebilir. Bu özellik Arenavirüslerin en karakteristik ve 'hard' düzeydeki virolojik bilgisidir.

Adım Adım Çözüm

1
Virüs ailesini ve genomik yapısını tanımlama
Soruda tanımlanan 'kumlu' görünüm ve iki segmentli RNA yapısı Arenaviridae ailesine (örn. Lassa, LCMV) aittir.
Karakteristik morfoloji ve genom yapısı ayırıcı tanıda temeldir.
2
Ambisens kodlama mekanizmasını analiz etme
Ambisens segmentlerde 3' ucu negatif polaritedir (N geni), 5' ucu ise pozitif polaritedir (G geni).
Ambisens terimi, bir RNA segmentinin her iki yönünde de (farklı polaritelerde) gen taşımasını ifade eder.
3
Transkripsiyon süreçlerini değerlendirme
3' yarısındaki N geni, genomik RNA üzerinden doğrudan transkribe edilir. Ancak 5' yarısındaki G geni, genomik RNA ile aynı polaritede olduğundan transkribe edilemez; önce tam boy antijenomik RNA sentezlenmeli ve G geni bu antijenomik kalıbın 3' ucundan transkribe edilmelidir.
mRNA sentezi (transkripsiyon) için her zaman zıt polaritede bir kalıp RNA gereklidir.
4
Sonucu doğrulama
N protein mRNA'sı genomik RNA'dan, G protein mRNA'sı ise antijenomik RNA'dan sentezlenir.
Bu strateji, viral protein sentezinin zamanlamasını ve miktarını kontrol etmek için kullanılan karmaşık bir mekanizmadır.

Anahtar Kavram

Arenavirüslerde S segmentinin ambisens transkripsiyon stratejisi
Tahmini Süre:2m 0s
ÖncekiSayfa 15 / 23Sonraki
Viroloji — TUS - Tıpta Uzmanlık Sınavı — Sayfa 15 | Examkin