Viroloji

458 soru

Soru 301Soru

3232 yaşında HIV1HIV-1 pozitif bir erkek hastada antiretroviral tedavi rejimine eklenmesi planlanan bir ilaç, viral zarf proteini ile konak hücre koreseptörü arasındaki etkileşimi bozarak viral girişi (entryentry) engellemektedir. Bu ilacın etkili olabilmesi için virüsün yalnızca CCR5CCR5 koreseptörünü kullanıyor olması (R5R5 tropizmi) gerekmektedir.

Bu etki mekanizmasına sahip olan ve tedavi öncesi "tropizm testi" yapılması gereken antiviral ilaç aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Maravirok

Cevap

Maravirok, konak hücre yüzeyindeki CCR5CCR5 koreseptörüne bağlanarak HIVHIV'in bağlanmasını ve girişini engelleyen antiviral ilaçtır.
Maravirok, konak hücresindeki kemokin reseptörü CCR5CCR5'i bloke ederek HIVHIV gp120gp120 proteininin bu reseptöre bağlanmasını engeller. Bu durum virüsün hücreye girişini (entryentry) durdurur. İlacın etkili olabilmesi için hastadaki baskın virüs popülasyonunun CCR5CCR5 kullanıyor olması şarttır, bu nedenle tedavi öncesi tropizm testi yapılır.

Adım Adım Çözüm

1
Hastanın klinik tablosunu ve hedeflenen basamağı analiz edin.
HIV1HIV-1 girişi (entryentry) engellenmek istenmekte ve CCR5CCR5 etkileşimi vurgulanmaktadır.
Antiviral ilaçlar virüs replikasyon döngüsünün farklı basamaklarına etki eder; giriş inhibitörleri reseptör bağlamayı hedefler.
2
Belirtilen spesifik koreseptör ve test gerekliliğini değerlendirin.
CCR5CCR5 tropizminin belirlenmesi (tropizm testi) yalnızca Maravirok kullanımı için bir ön koşuldur.
Bazı HIVHIV suşları CXCR4CXCR4 reseptörünü (X4X4 tropizmi) veya her ikisini (dualdual tropizm) kullanabilir; Maravirok sadece R5R5 suşlarına karşı etkilidir.

Anahtar Kavram

Maravirok, CCR5CCR5 antagonistidir ve kullanımı öncesinde viral tropizm testi yapılması zorunludur.
Tahmini Süre:1m 15s
Soru 302Soru

İnsanlarda enfeksiyon oluşturan DNA virüsleri genellikle çift iplikli (dsDNAdsDNA) genom yapısına sahiptir. Aşağıdaki virüs ailelerinden hangisi, genomunun tek iplikli DNA (ssDNAssDNA) yapısında olmasıyla bu genellemenin dışındadır?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Parvoviridae

Cevap

Parvoviridae ailesi, insan patojeni olan DNA virüsleri arasında genomu tek iplikli (ssDNAssDNA) olan tek gruptur.
İnsan patojeni olan DNA virüs aileleri içerisinde Parvoviridae (örneğin Parvovirüs B19), genomu tek iplikli (ssDNAssDNA) olan tek ailedir. Diğer tüm seçeneklerdeki aileler çift iplikli (dsDNAdsDNA) genom yapısına sahiptir.

Adım Adım Çözüm

1
DNA virüslerinin genel genomik yapısını hatırla.
İnsanları enfekte eden DNA virüs ailelerinin (Herpes, Pox, Adeno, Papilloma, Polyoma, Hepadna) neredeyse tamamı çift iplikli (dsDNAdsDNA) genoma sahiptir.
Virolojide temel sınıflandırma kurallarından biridir.
2
Bu kuralın tek istisnası olan aileyi belirle.
Parvoviridae ailesi (Parvovirüs B19), tek iplikli DNA (ssDNAssDNA) genomu taşır.
Parvovirüslerin en karakteristik ve ayırt edici özelliğidir.

Anahtar Kavram

DNA virüsleri arasında Parvoviridae ailesinin tek iplikli (ssDNAssDNA) genom yapısı ile ayrılması.
Soru 303Soru

Özgeçmişinde 'invajinasyon' (barsak düğümlenmesi) öyküsü bulunan 22 aylık bir bebeğe uygulanması kontrendike olan viral aşı ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Antijenleri, konak hücresinde replike olduktan sonra endojen yolla işlenerek MHC Sınıf I molekülleri aracılığıyla CD8+ T hücrelerine sunulabilir.

Cevap

Antijenleri, konak hücresinde replike olduktan sonra endojen yolla işlenerek MHC Sınıf I molekülleri aracılığıyla CD8+ T hücrelerine sunulabilir.
Soruda tanımlanan 'invajinasyon' kontrendikasyonu doğrudan Rotavirüs aşısına işaret etmektedir. Rotavirüs aşısı canlı atenüe bir aşıdır. Canlı aşıların en temel özelliği, konak hücresinde replike olabilmeleridir. Bu sayede üretilen viral antijenler 'endojen' antijen sınıfına girer ve proteazomal yıkım sonrası MHC Sınıf I molekülleri ile CD8+ sitotoksik T lenfositlerine sunulur. Bu durum, inaktive aşılardan farklı olarak güçlü bir hücresel bağışıklık sağlar.

Adım Adım Çözüm

1
Kontrendikasyonun tanımlanması
İnvajinasyon öyküsü, Rotavirüs aşısı için spesifik bir kontrendikasyondur.
Rotavirüs aşılarının nadir de olsa invajinasyon riskini artırabileceği klinik çalışmalarla gösterilmiştir.
2
Aşı tipinin belirlenmesi
Rotavirüs aşısı (Rotarix veya Rotateq), oral yolla uygulanan canlı atenüe bir aşıdır.
Gastrointestinal mukozada replike olarak hem S-IgA hem de sistemik bağışıklık oluşturması hedeflenir.
3
İmmünolojik mekanizmanın analizi
Canlı aşılar hücre içinde replike oldukları için antijenleri endojen yolakla MHC-I üzerinden CD8+ T hücrelerine sunulur.
Hücre içinde sentezlenen viral proteinler proteazomlarda yıkılarak ER'ye taşınır ve MHC-I ile birleşerek hücre yüzeyine sunulur.
4
Viral genomun değerlendirilmesi
Rotavirüs, Reoviridae ailesinde yer alan, segmentli ve çift iplikli RNA (dsRNA) genomuna sahip, zarfsız bir virüstür.
Virolojik özellikler aşının biyolojisini ve immün sistemle etkileşimini doğrudan etkiler.

Anahtar Kavram

Canlı atenüe aşıların (örn. Rotavirüs) immün sistem tarafından işlenme yolları ve spesifik kontrendikasyonları.

Alternatif Yöntem

Soruda verilen 'invajinasyon' ipucundan yola çıkarak önce aşının Rotavirüs aşısı olduğunu, ardından Rotavirüsün bir RNA virüsü ve aşının canlı tipte olduğunu hatırlayarak seçenekleri eleyebilirsiniz.
Tahmini Süre:2m 0s
Soru 304Soru

2424 yaşında bir tıp fakültesi öğrencisine, hastane stajı öncesinde yapılan serolojik tarama testlerinde sadece AntiHBsAnti-HBs antikor sonucu pozitif, HBsAgHBsAg ve AntiHBcAnti-HBc IgGIgG sonuçları ise negatif bulunmuştur. Bu serolojik tablo aşağıdakilerden hangisi ile en uyumludur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Hepatit B aşısı ile kazanılmış bağışıklık

Cevap

Hepatit B aşısı ile kazanılmış bağışıklık
Hepatit B aşısı (rekombinant aşı), virüsün sadece saflaştırılmış HBsAgHBsAg kısmını içerir. Bu nedenle, aşılanan bir kişide sadece bu antijene karşı antikor (AntiHBsAnti-HBs) gelişir. Virüsün kendisiyle (core bölgesiyle) temas olmadığı için AntiHBcAnti-HBc antikorları negatif kalır.

Adım Adım Çözüm

1
Serolojik göstergeleri analiz et
Sadece AntiHBsAnti-HBs pozitif, HBsAgHBsAg ve AntiHBcAnti-HBc negatif.
Hastanın bağışıklık durumunu belirlemek için mevcut antikor ve antijen paternini değerlendirmek gerekir.
2
Doğal enfeksiyon ve aşı bağışıklığını karşılaştır
Doğal enfeksiyonda hem yüzey (S) hem çekirdek (core) antikorları oluşurken, aşıda sadece yüzey (S) antikoru oluşur.
Hepatit B aşısı sadece rekombinant HBsAgHBsAg içerdiği için vücutta sadece buna karşı antikor gelişir.

Anahtar Kavram

Hepatit B aşısı sonrası serolojik profil

Daha Fazla Pratik

Anti-HBc IgM pozitifliğinin klinik önemini ve pencere dönemindeki tanısal değerini inceleyebilirsiniz.
Tahmini Süre:45s
Soru 305Soru

Poxviridae ailesi üyelerinin (örneğin Variola virüsü) konak hücedeki replikasyon döngüsü sırasında İntrasellüler Matür Virüs (IMV) ve Ekstrasellüler Zarflı Virüs (EEV) olarak adlandırılan iki farklı enfektif form oluşmaktadır. Bu morfolojik yapılar ve biyolojik özellikleri göz önüne alındığında, EEV formu ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Sahip olduğu ek membran sayesinde konak içinde antikorlardan korunarak hücreden hücreye (internal) yayılımı sağlar.

Cevap

Ekstrasellüler Zarflı Virüs (EEV) formu, sahip olduğu ek membran sayesinde konak içinde antikorlardan korunarak hücreden hücreye yayılımı sağlar.
Poxvirüs enfeksiyonu sırasında oluşan EEV formu, trans-Golgi ağından köken alan ek bir lipit membran ile çevrilidir. Bu membran, virüsün nötralizan antikorlar tarafından tanınmasını zorlaştırır ve virüsün konak içinde bir hücreden diğerine (internal dissemination) hızlıca yayılmasını sağlar. Bu özellik, sistemik enfeksiyonun progresyonunda kritik rol oynar.

Adım Adım Çözüm

1
Poxviridae replikasyon döngüsünü analiz et.
Poxvirüsler sitoplazmada replike olur ve önce tek zarflı IMV formunu oluşturur.
Virüsün ilk enfektif formu 'viral fabrikalarda' olgunlaşan IMV'dir.
2
IMV ve EEV formlarının oluşum farklarını belirle.
IMV, Golgi membranları ile sarılarak IEV (Intracellular Enveloped Virus) olur, bu da plazma membranından atılarak EEV olur.
EEV formu, IMV'nin üzerine ek bir lipit tabakası eklenmiş halidir.
3
İki formun biyolojik görevlerini karşılaştır.
IMV dış ortamda stabildir ve kişiden kişiye bulaşır; EEV ise kırılgandır ve konak içinde yayılımı (internal spread) yönetir.
EEV'nin dış membranı konak hücrenin kompleman kontrol proteinlerini içererek bağışıklık sisteminden kaçışı kolaylaştırır.

Anahtar Kavram

Poxvirüslerde IMV (bulaşma formu) ve EEV (yayılım/immün kaçış formu) ayrımı.

Daha Fazla Pratik

Variola ve Vaccinia virüsleri arasındaki antijenik benzerlikleri ve aşı üretim stratejilerini gözden geçirebilirsiniz.
Tahmini Süre:2m 0s
Soru 306Soru

3838 yaşında bir hemşire, HCVHCV pozitif olduğu bilinen bir hastanın kanlı iğnesiyle yaralanmıştır. Olaydan 44 hafta sonra yapılan rutin kontrollerinde ALTALT seviyesi 180180 U/LU/L (normal: <40<40 U/LU/L) olarak saptanmış, ancak yapılan AntiHCVAnti-HCV testi negatif sonuçlanmıştır. Bu klinik tabloda tanıyı kesinleştirmek için istenmesi gereken en uygun tetkik aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: HCVRNAHCV-RNA saptanması

Cevap

HCV-RNA saptanması en uygun tetkiktir çünkü akut enfeksiyonun erken döneminde antikorlar henüz oluşmamışken viral genom saptanabilir.
Akut Hepatit C enfeksiyonunda ALTALT yüksekliği başladıktan sonra antikorların oluşması haftalar sürebilir. HCVRNAHCV-RNA, kanda maruziyetten sonraki ilk 131-3 hafta içinde saptanabilir hale gelerek pencere döneminde tanıyı kesinleştiren en duyarlı yöntemdir.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik verilerin analizi
HCVHCV maruziyeti sonrası 44. haftada ALTALT yüksekliği (akut karaciğer hasarı) mevcuttur.
Hastada akut bir viral hepatit tablosu geliştiğini doğrulamak için.
2
Serolojik durumun değerlendirilmesi
AntiHCVAnti-HCV negatifliği, enfeksiyonun 'pencere döneminde' (window period) olduğunu gösterir.
Antikorların oluşması için gereken sürenin (8128-12 hafta) henüz geçmediğini anlamak için.
3
Tanısal yöntemin seçilmesi
En erken saptanabilen gösterge olan HCVRNAHCV-RNA testi tercih edilir.
Viral replikasyonun direkt göstergesi olan RNARNA, maruziyetten 131-3 hafta sonra pozitifleşir.

Anahtar Kavram

Hepatit C enfeksiyonunda serolojik pencere dönemi ve moleküler tanı.

Alternatif Yöntem

HCVHCV core antijeni saptanması da antikorlardan önce pozitifleşen bir yöntemdir ancak pratikte HCVRNAHCV-RNA altın standarttır.
Tahmini Süre:1m 15s
Soru 307Soru

2222 yaşında bir erkek üniversite öğrencisi, annesinin kronik HBVHBV taşıyıcısı olduğunu öğrenmesi üzerine kontrol amaçlı polikliniğe başvuruyor. Yapılan fizik muayenesi normal saptanan hastanın laboratuvar sonuçları şu şekildedir:

- HBsAgHBsAg: Pozitif
- HBeAgHBeAg: Pozitif
- AntiHBeAnti-HBe: Negatif
- ALTALT: 2828 U/LU/L (Referans: <40<40 U/LU/L)
- ASTAST: 2424 U/LU/L (Referans: <40<40 U/LU/L)
- HBVDNAHBV-DNA: 2.4×1082.4 \times 10^8 IU/mLIU/mL

Bu tablo, kronik Hepatit B enfeksiyonunun doğal seyri içerisindeki hangi evre ile en uyumludur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: İmmün tolerans evresi

Cevap

HBeAg pozitifliği ve çok yüksek viral yüke rağmen normal karaciğer enzimleri ile karakterize olan 'İmmün tolerans evresi' bu tabloyu en iyi açıklar.
Verilen laboratuvar profilinde HBsAgHBsAg ve HBeAgHBeAg pozitifliği ile birlikte HBVDNAHBV-DNA düzeyinin çok yüksek olması aktif bir replikasyonu; ancak ALTALT ve ASTAST düzeylerinin normal olması karaciğer hasarının henüz başlamadığını gösterir. Bu tablo, özellikle anneden bebeğe geçiş sonrası görülen ve bağışıklık sisteminin virüsü tolere ettiği 'İmmün tolerans' (yeni adıyla HBeAg pozitif kronik enfeksiyon) evresiyle tam uyumludur.

Adım Adım Çözüm

1
Serolojik markerların değerlendirilmesi
HBsAgHBsAg (+) ve HBeAgHBeAg (+) olması, hastanın enfekte olduğunu ve yüksek viral replikasyonun sürdüğünü gösterir.
Replikasyonun en önemli serolojik göstergesi HBeAgHBeAg pozitifliğidir.
2
Biyokimyasal verilerin viral yük ile karşılaştırılması
HBVDNAHBV-DNA düzeyinin çok yüksek (2.4×1082.4 \times 10^8 IU/mLIU/mL) olmasına rağmen ALTALT ve ASTAST düzeylerinin normal bulunması.
HBVHBV sitopatik bir virüs değildir; karaciğer hasarı immün sistemin sitotoksik TT hücre yanıtıyla oluşur. Bu hastada henüz bu yanıt oluşmamıştır.
3
Klinik evrenin belirlenmesi
Genç yaşta, dikey bulaş öyküsü düşündüren ve yüksek viral yük-normal ALTALT birlikteliği gösteren hastanın immün tolerans evresinde olduğu saptanır.
Bu evre genellikle perinatal bulaş sonrası ilk 2020-3030 yıl sürebilen bir dönemdir.

Anahtar Kavram

Kronik Hepatit B enfeksiyonunun evreleri (İmmün tolerans vs. İmmün reaktif)
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 308Soru

Arenavirüslerin (LassaLassa virüsü, Lenfositik koryomenenjit virüsü) genomik yapısı ve replikasyon stratejisi incelendiğinde; SS segmentinin 'ambisens' (çift anlamlı) kodlama özelliğine sahip olduğu görülür.

Bu replikasyon stratejisiyle ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Nükleokapsid (NN) proteini, genomik RNARNA'nın 33' yarısından sentezlenen bir mRNAmRNA aracılığıyla; glikoprotein (GPGP) ise replikasyon sırasında oluşan antijenomun 33' yarısından sentezlenen bir mRNAmRNA aracılığıyla eksprese edilir.

Cevap

Arenavirüslerin ambisens S segmentinde; N proteini genomik RNA'dan, GP proteini ise replikasyon ara formu olan antijenomdan sentezlenen mRNA'lar aracılığıyla eksprese edilir.
Arenavirüslerin SS segmenti ambisens yapıdadır. Nükleokapsid (NN) geni genomik RNARNA'nın 33' yarısında negatif polaritede yer alır ve doğrudan mRNAmRNA'ya transkribe edilir. Glikoprotein (GPGP) geni ise genomik RNARNA'nın 55' yarısında pozitif polaritede yer almasına rağmen, konak ribozomları tarafından doğrudan tanınmaz. GPGP'nin ekspresyonu için önce tam boy bir antijenom (pozitif kopyası) sentezlenmeli, ardından bu antijenomun 33' ucundan (genomun 55' ucuna denk gelen yer) GPGP mRNAmRNA'sı transkribe edilmelidir. Bu çift yönlü transkripsiyon stratejisi ambisens genomların temel özelliğidir.

Adım Adım Çözüm

1
Genom yapısını analiz etme
Arenavirüs SS segmentinin ambisens olduğu, 33' ucunda negatif polariteli NN geninin, 55' ucunda ise pozitif polariteli GPGP geninin bulunduğu saptanır.
Ambisens stratejisinin temelini anlamak için genlerin yerleşimini bilmek gerekir.
2
Transkripsiyon basamaklarını değerlendirme
Viral RNARNA polimerazın 33' uçtan başlayarak NN mRNAmRNA'sını sentezlediği, ancak interjenik bölgedeki saç tokası (hairpin) yapısı nedeniyle GPGP genine geçemediği belirlenir.
Primer transkripsiyonun neden sadece bir geni kapsadığını açıklamak için.
3
Replikasyon ve ikincil transkripsiyonu inceleme
Tam boy antijenom sentezlendikten sonra, polimerazın antijenomun 33' ucundan (genomun 55' ucuna karşılık gelen bölge) başlayarak GPGP mRNAmRNA'sını sentezlediği görülür.
Pozitif polaritedeki GPGP geninin neden doğrudan değil de antijenom üzerinden eksprese edildiğini belirlemek için.

Anahtar Kavram

Ambisens RNA replikasyon stratejisi
Tahmini Süre:2m 0s
Soru 309Soru

İmmün sistemi baskılanmış (AIDS, hematolojik maligniteler veya transplantasyon gibi) bir hastada görülen, santral sinir sisteminde yaygın demiyelinizasyon odakları ile karakterize progresif multifokal lökoensefalopati (PML) tablosuna neden olan DNA virüsü, öncelikle aşağıdaki hücrelerden hangisini enfekte ederek yıkıma uğratır?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Oligodendrositler

Cevap

PML tablosunda JC virüsünün birincil hedefi olan ve yıkımı sonucunda demiyelinizasyona yol açan hücreler oligodendrositlerdir.
Progresif multifokal lökoensefalopati (PML), Polyomaviridae ailesinden bir DNA virüsü olan JC virüsünün neden olduğu bir hastalıktır. JC virüsü, santral sinir sisteminde miyelin kılıfını oluşturan oligodendrositleri enfekte ederek litik enfeksiyona yol açar. Bu hücrelerin ölümü, aksonların miyelin kılıfını kaybetmesine ve dolayısıyla yaygın nörolojik defisitlerle giden demiyelinizasyon odaklarının oluşmasına neden olur.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik tabloyu ve etkeni tanımlayın.
Progresif multifokal lökoensefalopati (PML) tablosunun etkeni Polyomaviridae ailesinden JC virüsüdür.
Klinik ipuçları (immün yetmezlik, demiyelinizasyon) spesifik bir virüsü işaret etmektedir.
2
Hücresel tropizmi analiz edin.
JC virüsü, MSS'de miyelin kılıfını sentezleyen oligodendrositleri hedef alır.
Virüsün replikasyonu ve yayılımı, bu hücrelerdeki spesifik transkripsiyon faktörlerine ve reseptörlere bağlıdır.
3
Hücresel yıkımın klinik sonucunu belirleyin.
Oligodendrositlerin lize olması, aksonlar üzerindeki miyelin kılıfının kaybına (demiyelinizasyon) yol açar.
Oligodendrositler miyelin üretiminden sorumlu temel hücre grubudur.

Anahtar Kavram

JC Virüsü ve Oligodendrosit Tropizmi
Soru 310Soru

Konak hücrenin nükleusuna ihtiyaç duymadan, kendi kodladığı DNADNA'ya bağımlı RNARNA polimeraz enzimi sayesinde replikasyon döngüsünü tamamen sitoplazmada tamamlayan DNADNA virüs ailesi aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Poxviridae

Cevap

Poxviridae ailesi, replikasyonunu sitoplazmada gerçekleştiren tek önemli insan patojeni DNA virüs grubudur.
Doğru cevap olan seçenek, virion içerisinde kendi DNADNA'ya bağımlı RNARNA polimeraz enzimini taşıyan Poxviridae ailesidir. Bu sayede virüs, konak hücrenin nükleusundaki transkripsiyon mekanizmalarına ihtiyaç duymadan sitoplazmada mRNAmRNA sentezleyebilir ve tüm replikasyon döngüsünü burada tamamlayabilir.

Adım Adım Çözüm

1
DNA virüslerinin genel replikasyon yerini hatırla.
Çoğu DNA virüsü nükleusta replike olur.
Konak hücrenin DNA polimeraz ve RNA polimeraz enzimlerini kullanmak için nükleusa ihtiyaç duyarlar.
2
Bu kuralın istisnasını belirle.
Poxviridae ailesi sitoplazmada replike olur.
Poxvirüsler çok büyüktür ve replikasyon için gerekli olan DNA'ya bağımlı RNA polimeraz gibi enzimleri kendileri kodlayıp virion içinde taşırlar.

Anahtar Kavram

DNA virüsleri içerisinde sitoplazmik replikasyon yapan tek aile Poxviridae'dir.

Alternatif Yöntem

Poxvirüslerin 'en büyük ve en karmaşık' virüsler olduğunu hatırlamak, nükleusa sığmayacak kadar büyük olduklarını ve kendi fabrikalarını sitoplazmada kurduklarını kodlamanıza yardımcı olabilir.
Tahmini Süre:30s
Soru 311Soru

15 aylık bir erkek çocuk; üç gündür devam eden ateş, kusma ve ardından başlayan bol sulu diyare şikayetiyle acil servise getirilmiştir. Hastanın fizik muayenesinde dehidratasyon bulguları saptanmış, dışkı mikroskopisinde lökosit veya eritrosit görülmemiştir. Dışkı örneğinin elektron mikroskobik incelemesinde, "tekerlek benzeri" (rota) morfolojiye sahip, 11 segmentli çift iplikli RNA (dsRNAdsRNA) genomu içeren virüs partikülleri saptanmıştır. Bu virüsün biyolojik ve replikasyon özellikleri ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Viral mRNA sentezi (transkripsiyon), subviral partikül içerisinde yer alan virionla ilişkili RNA bağımlı RNA polimeraz tarafından gerçekleştirilir.

Cevap

Viral mRNA sentezi, subviral partikül içerisinde yer alan viral RNA bağımlı RNA polimeraz aracılığıyla gerçekleştirilir.
Doğru yanıt, viral mRNA sentezinin subviral partikül içindeki RNA bağımlı RNA polimeraz tarafından yapıldığını belirten ifadedir. Rotavirüsler, genomik dsRNAdsRNA'yı sitoplazmadaki konak savunma reseptörlerinden gizlemek amacıyla transkripsiyonu partikül içinde gerçekleştirir ve oluşan pozitif iplikli mRNA'ları sitoplazmaya salar.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik ve morfolojik verileri değerlendirme
Çocukta sulu diyare ve elektron mikroskobunda 'tekerlek' (rota) görünümü, etkenin Reoviridae ailesinden Rotavirüs olduğunu gösterir.
Rotavirüs, çocukluk çağı gastroenteritlerinin en önemli viral etkenidir ve kendine has bir morfolojiye sahiptir.
2
Genomik yapıyı belirleme
Rotavirüs genomu 11 segmentli çift iplikli RNA (dsRNAdsRNA) yapısındadır.
Segmentli yapı genetik varyasyona (reassortment) olanak tanırken, dsRNAdsRNA yapısı özel bir replikasyon stratejisi gerektirir.
3
Replikasyon mekanizmasını analiz etme
Hücreye giren virüs 'uncoating' sonrası subviral partiküle (DLP) dönüşür; transkripsiyon bu partikül içinde viral RdRp ile yapılır.
Hücre sitoplazmasında serbest kalan dsRNAdsRNA, konak hücrenin antiviral savunma mekanizmalarını (interferon yanıtı) tetikleyeceği için virüs transkripsiyonu partikül içinde saklı tutar.
4
Patogenez özelliklerini hatırlama
NSP4 proteini bir enterotoksin gibi davranarak diyareye katkıda bulunur.
Viral proteinlerin fonksiyonlarını bilmek, etkenin patogenezini anlamak için kritiktir.

Anahtar Kavram

Rotavirüs replikasyonu tamamen sitoplazmada gerçekleşir ve viral dsRNAdsRNA genomunun hücre içi sensörler tarafından tanınmasını engellemek için transkripsiyon subviral partikül içinde tutulur.

Daha Fazla Pratik

Rotavirüs aşılarının (Rotarix ve RotaTeq) canlı aşılar olduğunu ve uygulama zamanlamasını gözden geçirebilirsiniz.
Tahmini Süre:1m 40s
Soru 312Soru

Gebelikte geçirildiğinde ağır konjenital malformasyonlara yol açabilen, zarflı ve ikozahedral simetrili bir RNA virüsü laboratuvar ortamında incelenmektedir. Bu virüsün moleküler replikasyon analizi sonucunda; 55' ucu 'cap' yapısı içeren pozitif polariteli genomunun doğrudan transle edilerek yapısal olmayan proteinleri (replikaz kompleksi) oluşturduğu, ancak kapsit ve zarf glikoproteinlerini kodlayan yapısal genlerin yalnızca replikasyonun ilerleyen safhalarında sentezlenen bir subgenomik mRNA (26S26S) üzerinden transle edildiği saptanmıştır. Bu replikasyon stratejisi ve klinik özellikleri dikkate alındığında, bahsi geçen virüs aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Rubella virüsü

Cevap

Rubella virüsü
Rubella virüsü, Togaviridae ailesinin bir üyesidir. Bu ailedeki virüsler pozitif polariteli RNA genomuna sahip olup, genomun bir kısmı doğrudan transle edilerek yapısal olmayan proteinleri oluştururken; kapsit ve zarf proteinleri (yapısal proteinler) için replikasyon sırasında sentezlenen negatif polariteli kalıptan üretilen ayrı bir subgenomik mRNA (26S26S) kullanılır. Ayrıca Rubella, konjenital malformasyonların (katarakt, sağırlık, kalp defektleri) önemli bir nedenidir.

Adım Adım Çözüm

1
Virüsün yapısal özelliklerini değerlendir.
Zarflı, ikozahedral simetrili ve pozitif polariteli tek iplikli RNA genomuna sahip olduğu saptanır.
Bu özellikler hem Togaviridae hem de Flaviviridae aileleri için ortaktır.
2
Klinik ipucunu analiz et.
Gebelikte konjenital malformasyon (TORCH) potansiyeli, etkenin Rubella virüsü olma olasılığını güçlendirir.
Rubella, Togaviridae ailesinin en önemli tıbbi temsilcisidir.
3
Moleküler replikasyon mekanizmasını ayırt et.
Yapısal proteinlerin subgenomik mRNA (26S26S) üzerinden sentezlendiğinin saptanması, virüsü Flaviviridae ailesinden ayırarak Togaviridae ailesine dahil eder.
Togavirüsler, non-yapısal proteinleri tam boy genomdan (49S49S), yapısal proteinleri ise subgenomik mRNA'dan (26S26S) sentezleme stratejisine sahiptir.

Anahtar Kavram

Togaviridae ailesinde yapısal protein sentezi için subgenomik mRNA (26S26S) kullanımı.
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 313Soru

3232 yaşında HBsAg (+) ve HBeAg (+) anneden doğan bir bebeğe, doğum sonrası ilk 1212 saat içinde Hepatit B immünglobulini (HBIG) ve ilk doz Hepatit B aşısı uygulanmış; ardından aşı şeması 0,10, 1 ve 6.6. aylarda olacak şekilde takvime uygun tamamlanmıştır. Bebek 1212 aylıkken yapılan rutin kontrolde saptanan serolojik bulgular şu şekildedir:

- HBsAg: Pozitif
- HBeAg: Pozitif
- Anti-HBs: 120120 IU/L
- Anti-HBc IgM: Pozitif

Bu klinik tabloya neden olan en olası mekanizma aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: HBV SS geni 'aa determinantı' bölgesinde mutasyon

Cevap

HBV enfeksiyonunda yüzey antijeni (HBsAg) üzerindeki 'aa determinantı' bölgesinde meydana gelen mutasyonlar, aşının sağladığı koruyucu antikorlardan kaçışa (immune escape) neden olur.
Vakada tam doz aşılanmış ve yeterli düzeyde Anti-HBs antikoruna sahip olan bir bebekte aktif HBV enfeksiyonu (HBsAg ve HBeAg pozitifliği) görülmektedir. Bu durum, virüsün yüzey antijenindeki (HBsAg) 'aa determinantı' bölgesinde meydana gelen yapısal bir mutasyonla açıklanır. Bu mutasyon sonucu oluşan 'aşıdan kaçış' (vaccine escape) mutantları, aşıyla oluşan antikorlar tarafından nötralize edilemez.

Adım Adım Çözüm

1
Serolojik profilin analiz edilmesi
HBsAg (+) ve Anti-HBs (+) birlikteliği saptanmıştır.
Normal şartlarda bu iki markerın aynı anda pozitif olması beklenmez; çünkü Anti-HBs antikorları HBsAg'yi nötralize eder.
2
Profilaksi geçmişi ile sonuçların karşılaştırılması
Bebek tam doz aşılanmış ve koruyucu düzeyde (>10>10 IU/L) antikor üretmiştir.
Antikor varlığına rağmen HBsAg pozitifliği, antikorun mevcut virüsü tanıyamadığını gösterir.
3
Mutasyonel mekanizmanın belirlenmesi
SS geni 'aa determinantı' mutasyonu (örn. G145R).
HBsAg üzerindeki bu bölge nötralizan antikorların ana bağlanma bölgesidir; buradaki yapısal değişiklik 'aşıdan kaçış' (vaccine escape) mutantlarına yol açar.

Anahtar Kavram

HBV S-geni 'a determinantı' mutasyonları, nötralizan antikorların antijene bağlanmasını engelleyerek immün kaçışa neden olur.

Daha Fazla Pratik

HBV pre-core mutantları ve bunların HBeAg negatif kronik hepatit tablosundaki rolünü inceleyiniz.
Tahmini Süre:2m 0s
Soru 314Soru

Picornaviridae ailesindeki virüslerin (Poliovirus, Rhinovirus vb.) replikasyon döngüsünde, konak hücrenin 'cap' yapısına bağımlı translasyonu hızla inhibe edilirken viral protein sentezinin öncelikli olarak devam etmesini sağlayan temel moleküler mekanizma aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Viral proteazların (2A veya 3C) ökaryotik başlatma faktörü 4G'yi (eIF-4G) spesifik olarak parçalaması

Cevap

Picornavirüslerin translasyonel 'shut-off' mekanizması, viral proteazların konak hücre translasyon başlatma faktörü eIF-4G'yi parçalaması temeline dayanır.
Picornavirüsler (Poliovirus, Rhinovirus, Coxsackievirus vb.), konak hücre translasyonunu kendi lehlerine çevirmek için 'shut-off' (kapatma) mekanizmasını kullanırlar. Bu virüslerin genomunda bir 5' 'cap' yapısı bulunmaz; bunun yerine ribozomun doğrudan bağlandığı 'Internal Ribosome Entry Site' (IRES) dizisi mevcuttur. Replikasyon sırasında üretilen viral proteazlar (2A veya 3C), ökaryotik translasyon başlatma faktörü 4G'yi (eIF-4G) spesifik olarak parçalar. eIF-4G, 'cap' yapısına bağlanan eIF-4E ile ribozomun 40S alt birimini bir araya getiren köprü proteindir. Bu proteinin parçalanması konak hücrenin normal translasyonunu imkansız hale getirirken, viral RNA IRES dizisi üzerinden doğrudan eIF-4G'nin kalan parçasına ve ribozoma bağlanarak protein sentezini sürdürür.

Adım Adım Çözüm

1
Picornavirüslerin genomik yapısını ve translasyon stratejisini analiz et.
Bu virüsler pozitif polariteli RNA'ya sahiptir ve 5' uçlarında 'cap' yapısı yerine VPg proteini ile IRES (Internal Ribosome Entry Site) dizisi bulundururlar.
Bu yapısal fark, virüsün hücresel translasyon mekanizmasını 'cap' yapısına ihtiyaç duymadan kullanmasını sağlar.
2
Viral replikasyonun erken evresindeki proteaz aktivitesini değerlendir.
Viral genomdan sentezlenen poliprotein, viral 2A veya 3C proteazları tarafından parçalanır.
Bu proteazlar sadece viral poliproteini değil, belirli konak hücre proteinlerini de hedef alır.
3
Konak hücre translasyonunun nasıl durdurulduğunu belirle.
Viral proteazlar, eIF-4F kompleksinin iskelet proteini olan eIF-4G'yi parçalar.
eIF-4G parçalandığında, 'cap' yapısına bağlanan eIF-4E ile ribozom arasındaki köprü kopar ve hücresel (cap-bağımlı) translasyon durur.

Anahtar Kavram

Picornavirüslerin IRES (Internal Ribosome Entry Site) kullanımı ve eIF-4G proteolizi aracılı konak translasyon inhibisyonu.
Tahmini Süre:2m 0s
Soru 315Soru

Kronik Hepatit C tanısıyla takip edilen 5252 yaşındaki erkek hastanın tedavi protokolüne, nükleotid analoğu olan Sofosbuvir eklenmiştir. Bu ilacın etki mekanizması aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Viral NS5B RNA-bağımlı RNA polimeraz enziminin inhibisyonu

Cevap

Sofosbuvir'in mekanizması, viral NS5B RNA-bağımlı RNA polimeraz enziminin inhibe edilmesidir.
Doğru seçenek olan mekanizma, Sofosbuvir'in temel etki yolunu açıklar. Sofosbuvir bir uridine nükleotid analoğu ön ilacıdır (prodrug). Hücre içinde aktif trifosfat formuna dönüşür ve HCV NS5B RNA-bağımlı RNA polimerazı tarafından substrat olarak kullanılır. RNA zincirine dahil olduğunda zincir sonlanmasına yol açarak viral replikasyonu durdurur.

Adım Adım Çözüm

1
İlacın sınıflandırılması
Sofosbuvir, Hepatit C (HCV) tedavisinde kullanılan bir doğrudan etkili antiviral (DAA) ajandır.
Tedavi protokolündeki ilacın hangi virüse ve hangi sınıfa ait olduğunu belirlemek doğru hedefi bulmak için gereklidir.
2
Moleküler hedefin belirlenmesi
Sofosbuvir bir nükleotid analoğudur ve NS5B RNA-bağımlı RNA polimerazı hedef alır.
HCV replikasyonunda RNA sentezinden sorumlu ana enzim NS5B'dir.
3
Etki şeklinin açıklanması
Aktif formuna dönüştükten sonra RNA zincirine katılarak zincir sonlanmasına (chain termination) neden olur.
Nükleotid analoglarının temel çalışma prensibi budur.

Anahtar Kavram

HCV DAAs (Doğrudan Etkili Antiviraller) sınıfları ve hedefleri: NS3/4A (Proteaz), NS5A (Replikasyon kompleksi), NS5B (Polimeraz).
Tahmini Süre:50s
Soru 316Soru

Viral aşıların immünojenisite özelliklerini belirleyen en temel faktörlerden biri, antijenin antijen sunan hücrelerde (APCAPC) işlenme ve sunulma biçimidir. Bir aşının, hücre içerisinde replike olma yeteneği sayesinde endojen antijen sunum yolağını kullanması, endoplazmik retikulumda MHC Sınıf I molekülleri ile birleşerek CD8+CD8^+ T lenfositlerini aktive etmesi ve güçlü bir hücresel bağışıklık oluşturması beklenir. Buna göre, aşağıdaki seçeneklerde verilen aşılardan hangisi, tarif edilen bu immünolojik mekanizma ile etki gösteren canlı atenüe bir RNA virüs aşısıdır?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Sabin (Oral Polio) aşısı

Cevap

Sabin (Oral Polio) aşısı, canlı atenüe bir RNA virüs aşısı olarak hücre içinde replike olur ve MHC Sınıf I aracılı hücresel immün yanıtı güçlü bir şekilde uyarır.
Sabin (Oral Polio) aşısı canlı atenüe bir aşıdır. Bu aşılar konak hücreye girdikten sonra replike olurlar. Viral proteinlerin hücre içinde sentezlenmesi (endojen üretim), bu proteinlerin proteozomlarda yıkılarak TAP kanalları aracılığıyla endoplazmik retikuluma (ERER) taşınmasını sağlar. ERER içerisinde MHC Sınıf I molekülleri ile birleşen antijenler, hücre yüzeyine çıkarak CD8+CD8^+ sitotoksik T hücrelerini uyarır. Bu durum, inaktive aşılara göre çok daha güçlü bir hücresel bağışıklık sağlar. Ayrıca Poliovirüs bir RNA virüsüdür.

Adım Adım Çözüm

1
Aşının replikasyon yeteneğini belirle
Sabin, KKK ve Varisella gibi canlı aşılar konak hücrede çoğalabilir.
MHC Sınıf I sunumu için antijenin hücre içinde (endojen) sentezlenmesi gerekir.
2
Antijen sunum yolağını analiz et
Endojen antijenler proteozomlarda parçalanır, TAP proteinleri ile ER'ye taşınır ve MHC I ile birleşir.
Canlı aşılar bu yolu kullanarak sitotoksik T hücre (CD8+CD8^+) yanıtını indükler.
3
Virüsün nükleik asit tipini doğrula
Poliovirüs (Picornaviridae) bir RNA virüsüdür.
Soru kökü hem immünolojik mekanizmayı hem de nükleik asit tipini sormaktadır.

Anahtar Kavram

Canlı atenüe viral aşıların (örn. Sabin), inaktive aşılardan (örn. Salk) farkı, hücre içinde replike olarak endojen antijen sunum yolağını (MHC I) kullanmaları ve güçlü bir hücresel (CTLCTL) yanıt oluşturmalarıdır.

Daha Fazla Pratik

Canlı aşıların (Sabin, KKK, BCG) gebelik ve immün yetmezlik durumlarındaki kontrendikasyonlarını gözden geçirebilirsiniz.
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 317Soru

Viral replikasyon dinamikleri üzerine yapılan bir çalışmada, bir hücre kültüründe yüksek enfeksiyon çokluğu (MOIMOI) ile inokülasyon yapıldığında, birkaç pasaj sonra üretilen enfektif virüs partikülü sayısının (plak oluşturan birimler) dramatik şekilde düştüğü, ancak toplam fiziksel partikül sayısının yüksek seyrettiği gözlenmiştir. Yapılan genomik analizlerde, yeni oluşan partiküllerin büyük bir kısmının viral genomda geniş delesyonlara sahip olduğu ve bu 'defektif interferan' (DIDI) partiküllerinin ancak sağlam bir yardımcı virüs varlığında çoğalabildiği belirlenmiştir.

Bu durum ve 'Von Magnus fenomeni' ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Bu partiküller, hücre içinde yardımcı virüsün replikasyon kaynakları (polimerazlar, yapısal proteinler vb.) için rekabete girerek onun çoğalmasını engeller.

Cevap

Defektif interferan partiküllerinin, yardımcı virüsün replikasyon kaynakları için rekabete girerek onun çoğalmasını engellemesi doğru ifadedir.
Von Magnus fenomeni, yüksek MOIMOI değerlerinde defektif genomların (genellikle delesyon taşıyan) sağlam genomlar tarafından sentezlenen polimeraz ve kapsid proteinlerini kullanarak hızla çoğalmasıdır. Bu süreçte DIDI partikülleri, hücre içi kaynaklar için yardımcı virüsle rekabete girer ve onun replikasyonunu baskılayarak ortamdaki enfektif virüs (PFU) oranının düşmesine neden olur.

Adım Adım Çözüm

1
Von Magnus fenomenini tanımla.
Yüksek enfeksiyon çokluğunda (MOIMOI) enfektif olmayan partiküllerin birikmesi durumudur.
Yüksek dozda virüs verildiğinde, aynı hücreye birden fazla virion girme ihtimali artar ve bu da defektif genomların 'helper' virüslerden faydalanmasına zemin hazırlar.
2
DIDI partiküllerinin doğasını analiz et.
Genomlarında eksiklik olan ancak viral proteinlerle paketlenmiş partiküller.
Kendi başlarına replike olamazlar (defektif) ve yardımcı virüsün polimerazlarını/proteinlerini 'çalarlar' (interferan).
3
Interferans (engelleme) mekanizmasını açıkla.
Yardımcı virüsün replikasyon verimliliğinin düşmesi.
Hücre içi kaynaklar kısıtlıdır; DIDI partikülleri bu kaynakları daha hızlı kullanarak sağlam virüs üretimini baskılar.

Anahtar Kavram

Von Magnus Fenomeni ve Defektif İnterferan (DI) Partikülleri
Soru 318Soru

Gebelikte bağışıklama stratejileri belirlenirken aşının içeriği ve potansiyel riskleri dikkate alınır. Canlı atenüe viral aşıların maternal uygulama sonrası plasentayı geçerek fetüste subklinik enfeksiyon veya konjenital anomalilere yol açma riski bulunduğu kabul edilir. Bu nedenle, gebelik planlayan kadınlarda bu aşıların uygulamadan belirli bir süre sonrasına kadar gebeliğin ertelenmesi önerilir. Buna göre, aşağıdaki viral aşılardan hangisinin gebelik döneminde uygulanması kontrendikedir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Kızamıkçık aşısı

Cevap

Kızamıkçık aşısı, canlı atenüe bir aşı olduğu için gebelikte kontrendikedir.
Kızamıkçık aşısı canlı atenüe bir viral aşıdır. Canlı aşılar (Kızamık, Kızamıkçık, Kabakulak, Suçiçeği, Sarı Humma gibi), virüsün fetüse geçme ve enfeksiyon oluşturma riski nedeniyle gebelik sırasında kesinlikle uygulanmaz. Gebelikten en az 1 ay önce uygulanması veya doğum sonrasına ertelenmesi gerekir.

Adım Adım Çözüm

1
Seçeneklerdeki aşıların biyolojik yapısını (canlı veya inaktif) belirle.
Kızamıkçık canlı; Hepatit B, Hepatit A, Kuduz ve Salk-Polio inaktif/rekombinanttır.
Gebelikte kontrendikasyon kuralı aşı türüne bağlıdır.
2
Canlı aşıların gebelikteki riskini değerlendir.
Canlı aşıların plasentayı geçerek fetüsü enfekte etme riski mevcuttur.
Fetüsün bağışıklık sistemi zayıf olduğu için canlı virüsler zarar verebilir.
3
Gebelikte uygulanmaması gereken doğru seçeneği işaretle.
Kızamıkçık aşısı seçilmelidir.
Kızamıkçık, MMR (Kızamık-Kızamıkçık-Kabakulak) kombinasyonunun bir parçası olan bir canlı aşıdır.

Anahtar Kavram

Canlı viral aşıların gebelikte kontrendike olması
Tahmini Süre:45s
Soru 319Soru

HIV1HIV-1 replikasyon döngüsünde gen ekspresyonu zamansal bir düzenleme gösterir. Enfeksiyonun erken döneminde sentezlenen 9 kb9 \ kb uzunluğundaki primer viral transkriptler, konak hücrenin splicingsplicing mekanizması ile tamamen eklenmiş (fully splicedfully \ spliced) yaklaşık 2 kb2 \ kb'lık mRNAmRNA'lara (örn. tat, rev, neftat, \ rev, \ nef) dönüştürülür ve nükleustan sitoplazmaya ihraç edilir. Ancak geç dönemde ihtiyaç duyulan eklenmemiş (unsplicedunspliced) veya tek uçlu eklenmiş (singly splicedsingly \ spliced) daha uzun transkriptlerin (gag, pol, env, vif, vpr, vpugag, \ pol, \ env, \ vif, \ vpr, \ vpu) nükleustan çıkışı, konak hücrenin "intron içeren RNARNA'ları nükleusta tutma" engeline takılır.

HIV1HIV-1 replikasyonundaki bu kritik kısıtlamayı aşmak için kullanılan moleküler mekanizma aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Rev proteininin, yapısal genleri kodlayan mRNAmRNA'lar üzerindeki ikincil yapıya sahip RRERRE (Rev Response ElementRev \ Response \ Element) dizisine bağlanarak, bu RNARNA'ların nükleer eksport reseptörü CRM1CRM1 aracılığıyla sitoplazmaya taşınması

Cevap

Rev proteininin RRE dizisine bağlanarak CRM1 reseptörü üzerinden mRNA eksportunu sağlaması
Doğru yanıt olan seçenek, HIV1HIV-1 replikasyonundaki kritik "erken-geç" geçişini açıklar. Rev proteini, yapısal genleri (gag, pol, envgag, \ pol, \ env) içeren mRNA'lardaki özgül bir nükleotid dizisi olan RRERRE'ye bağlanır. Bu bağlanma, konak hücrenin nükleer eksport reseptörü olan CRM1CRM1'in komplekse katılmasını sağlar ve böylece normalde nükleusta tutulması gereken intron içeren viral RNA'lar sitoplazmaya taşınabilir.

Adım Adım Çözüm

1
HIV1HIV-1 genomik organizasyonunu ve transkripsiyon ürünlerini analiz etme
9 kb9 \ kb (genomik/Gag-Pol), 4 kb4 \ kb (Env/Vif/Vpr/Vpu) ve 2 kb2 \ kb (Tat/Rev/Nef) mRNA türleri belirlenir.
Hangi RNA'ların nükleusta takıldığını anlamak için boyut ve eklenme (splicingsplicing) durumları kritiktir.
2
Konak hücre nükleer eksport kurallarını değerlendirme
Hücre, normalde intron içeren (eklenmemiş) mRNA'ların sitoplazmaya çıkışına izin vermez.
Bu, hatalı protein sentezini önleyen bir hücresel savunma mekanizmasıdır.
3
Rev proteininin işlevini tanımlama
Rev, sitoplazmada sentezlendikten sonra nükleusa döner ve yapısal genlerin üzerinde bulunan RRERRE (Rev Response ElementRev \ Response \ Element) bölgesine bağlanır.
Rev-RRE etkileşimi, RNA'nın nükleer taşıma sinyali kazanmasını sağlar.
4
Eksport kompleksinin oluşumunu belirleme
Rev-RNA kompleksi, konak hücrenin CRM1CRM1 (exportin-1) ve RanGTPRan-GTP proteinlerini kullanarak nükleer pordan çıkar.
Bu mekanizma, viral yaşam döngüsünün erken fazından (regülatör proteinler) geç fazına (yapısal proteinler ve genomik RNA) geçişi sağlar.

Anahtar Kavram

HIV-1 Rev-RRE Eksport Mekanizması
Soru 320Soru

Bir kış tatil beldesindeki otelde konaklayan çok sayıda tatilcide ani başlayan şiddetli bulantı, kusma ve sulu diyare şikayetleri gelişmiştir. Yapılan laboratuvar incelemeleri sonucunda etkenin Caliciviridae ailesinden, zarfsız ve tek iplikli RNA genomuna sahip bir virüs (Norovirüs) olduğu saptanmıştır. Bu virüsün genomik özellikleri ve replikasyon stratejisi ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Viral genom pozitif polariteli olduğu için hücreye girdikten sonra doğrudan mRNA gibi davranarak konak hücre ribozomlarında translasyona uğrayabilir.

Cevap

Viral genomun pozitif polariteli olması sayesinde doğrudan bir mRNA gibi davranarak konak hücre ribozomlarında translasyona uğrayabilmesi doğrudur.
Pozitif polariteli RNA virüslerinin (Picornaviridae, Caliciviridae, Flaviviridae, Togaviridae, Coronaviridae vb.) genomu, konak hücresinin mRNA'sı ile aynı polaritededir. Bu sayede virüs hücreye girdikten sonra genomu doğrudan ribozomlara tutunur ve viral proteinlerin (ve RdRp enziminin) sentezi için kalıp görevi görür.

Adım Adım Çözüm

1
Etkeni ve temel sınıflandırmasını tanımla.
Etken Norovirüs'tür (Caliciviridae ailesi); pozitif polariteli, tek iplikli, zarfsız bir RNA virüsüdür.
Soru kökündeki klinik tablo ve verilen bilgiler bu sınıflandırmaya işaret eder.
2
Pozitif polariteli RNA virüslerinin replikasyon mekanizmasını analiz et.
Pozitif polariteli (+)ssRNA genomu, 5' ucunda şapka (cap) veya Vpg proteini taşır ve konak hücresinin mRNA'sı ile aynı yöndedir.
Bu yapı, genomun bir ara basamağa ihtiyaç duymadan doğrudan ribozomlara bağlanmasını sağlar.
3
Enzim ihtiyacını değerlendir.
Virion içinde RNA-bağımlı RNA polimeraz (RdRp) taşımasına gerek yoktur çünkü bu enzim virüs hücreye girdikten sonra ilk sentezlenen proteinler arasındadır.
Genom mRNA gibi çalıştığı için polimeraz sentezi translasyonla hemen gerçekleşebilir.

Anahtar Kavram

RNA Virüslerinde Polarite ve Replikasyon Stratejisi

İpuçları

1
Virüsün genomunun mRNA ile aynı yönde (polaritede) olup olmadığını düşünün.
Tahmini Süre:1m 15s
ÖncekiSayfa 16 / 23Sonraki
Viroloji — TUS - Tıpta Uzmanlık Sınavı — Sayfa 16 | Examkin