Viroloji

458 soru

Soru 321Soru

Prionların biyokimyasal özellikleri ve patogenez mekanizmaları dikkate alındığında, bu ajanları konvansiyonel virüslerden ayıran en temel fark aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Nükleik asit içermemeleri ve protein yapısındaki β\beta-tabaka (beta-sheet) artışına bağlı olarak proteazlara ve dezenfektanlara yüksek direnç göstermeleri

Cevap

Prionlar nükleik asit içermezler ve yapısal olarak β\beta-tabaka hakimiyeti sayesinde dış etkenlere karşı son derece dirençlidirler.
Prionlar, bilinen tüm diğer enfeksiyöz ajanlardan farklı olarak nükleik asit (DNA veya RNA) içermezler. Patojenik prion proteini (PrPscPrP^{sc}), normal proteinin (PrPcPrP^c) tersiyer yapısının değişerek β\beta-tabaka (beta-sheet) oranının artmasıyla oluşur. Bu yapısal değişim, ajanı proteaz enzimlerine, UV radyasyonuna, ısıya ve klasik dezenfektanlara karşı olağanüstü dirençli kılar.

Adım Adım Çözüm

1
Prionların moleküler yapısının analiz edilmesi
Prionların sadece proteinden (PrPscPrP^{sc}) oluştuğu, nükleik asit (DNA/RNA) içermediği belirlenir.
Konvansiyonel virüslerin aksine, prionların genetik materyali yoktur.
2
Yapısal konformasyon değişikliğinin incelenmesi
Normal hücresel proteinin (PrPcPrP^c) alfa-sarmal yapısının, patojenik formda (PrPscPrP^{sc}) beta-tabaka yapısına dönüştüğü görülür.
Bu yapısal değişim, proteinin kümeleşmesine ve proteazlara karşı direnç kazanmasına neden olur.
3
Direnç ve inflamasyon özelliklerinin değerlendirilmesi
Ajanın standart sterilizasyon yöntemlerine dirençli olduğu ve konakta inflamatuar yanıt tetiklemediği saptanır.
Prionlar, vücudun kendi proteini oldukları için immün sistem tarafından yabancı olarak algılanmazlar.

Anahtar Kavram

Prionlar, nükleik asit içermeyen, β\beta-tabaka (beta-sheet) zenginliği nedeniyle proteazlara ve standart sterilizasyona dirençli, inflamasyon oluşturmayan protein patojenlerdir.
Soru 322Soru

Hepatit D virüsü (HDVHDV), replikasyon döngüsünü tamamlayabilmek ve yeni viral partiküller oluşturabilmek için bir yardımcı virüse ihtiyaç duyan defektif bir RNARNA virüsüdür. Buna göre, HDVHDV'nin enfektivite kazanması ve karaciğer hücrelerine tutunabilmesi için dış kılıfında mutlaka bulunması gereken HBVHBV bileşeni aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Hepatit B yüzey antijeni (HBsAgHBsAg)

Cevap

Hepatit B yüzey antijeni (HBsAgHBsAg)
Hepatit D virüsü (HDVHDV), biyolojik olarak defektif bir virüstür. Kendi genomu yalnızca Delta antijenini kodlar, ancak virüsün dış kılıfını oluşturacak proteinleri sentezleyemez. Bu nedenle HDVHDV, yeni viral partiküllerin paketlenmesi ve hepatositlere (karaciğer hücrelerine) tutunabilmesi için ortamda bulunan Hepatit B yüzey antijenini (HBsAgHBsAg) 'ödünç alarak' kendi kılıfı olarak kullanır. Bu durum, HDVHDV enfeksiyonunun sadece HBVHBV varlığında (ko-enfeksiyon veya süperenfeksiyon) görülmesinin temel nedenidir.

Adım Adım Çözüm

1
Hepatit D virüsünün (Delta ajanı) temel biyolojik özelliğini tanımlayın.
HDVHDV, tek başına enfeksiyon döngüsünü tamamlayamayan defektif bir RNARNA virüsüdür.
Soruyu çözmek için HDVHDV'nin neden 'defektif' olarak adlandırıldığını anlamak gerekir.
2
HDVHDV'nin replikasyonu için gereken dış yardımı belirleyin.
HDVHDV'nin hücreden salınabilmesi ve yeni hücrelere girebilmesi için bir dış kılıfa (envelope) ihtiyacı vardır.
Virüslerin enfektivite kazanması genellikle kılıf veya kapsid yapılarıyla ilgilidir.
3
Bu kılıfın hangi spesifik molekülden oluştuğunu seçin.
HDVHDV, kılıfını oluşturmak için HBVHBV tarafından üretilen HBsAgHBsAg'yi kullanır.
Hepatit B yüzey antijeni, HDVHDV genomunun paketlenmesi ve hücrelere tutunması için şarttır.

Anahtar Kavram

Hepatit D virüsü (Delta ajanı), defektif bir virüs olup replikasyon ve enfektivite için mutlak suretle Hepatit B yüzey antijenine (HBsAgHBsAg) ihtiyaç duyar.
Soru 323Soru

Elektron mikroskobunda tanecikli (kum serpilmiş gibi) bir görünüme sahip olan, yapısında konak hücreye ait ribozomları bulunduran ve iki segmentli dairesel RNA genomuna sahip olan Arenaviridae ailesi üyelerinin genomik yapıları ve replikasyon stratejileri ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Genomun bazı bölgeleri negatif, bazı bölgeleri ise pozitif polariteli genler içeren 'ambisense' özellik gösterir.

Cevap

Arenavirüslerin genomu, bazı genlerin negatif bazı genlerin ise pozitif polaritede kodlandığı 'ambisense' bir yapıya sahiptir.
Doğru yanıt olan 'ambisense' özellik, Arenavirüslerin en belirgin moleküler özelliğidir. S segmenti incelendiğinde, 33' ucu negatif polaritede nükleokapsid (N) proteinini kodlarken, 55' ucu pozitif polaritede glikoprotein (GPC) öncülünü kodlar. Bu iki bölge arasında replikasyonu sonlandıran bir 'hairpin' (saç tokası) yapısı bulunur.

Adım Adım Çözüm

1
Morfolojik özellikleri tanımla
Kum taneciği görünümü ve ribozom varlığı Arenaviridae ailesine (Lassa, LCMV vb.) işaret eder.
Arenavirüsler, tomurcuklanma sırasında konak ribozomlarını yapılarına aldıkları için bu karakteristik görünüme sahiptirler.
2
Genom yapısını analiz et
Bu virüslerin genomu L (Large) ve S (Small) olmak üzere iki segmentli RNA'dan oluşur.
Segment sayısı virüs ailelerinin ayırt edilmesinde kritik bir taksonomik özelliktir.
3
Replikasyon stratejisini belirle
S segmentinin bir ucu negatif polaritede nükleokapsid proteinini, diğer ucu ise pozitif polaritede glikoprotein öncülünü kodlar (Ambisense).
Ambisense stratejisi, virüsün sınırlı genetik materyalden maksimum verim almasını sağlar.

Anahtar Kavram

Arenavirüslerin karakteristik 'ambisense' genom yapısı ve konak ribozomlarını içermesi.

Daha Fazla Pratik

Arenavirüslerin kumlu görünümüne neden olan ribozomların replikasyonda bir rolü olup olmadığını araştırınız (Genellikle replikasyon için fonksiyonel olmadıkları düşünülür).
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 324Soru

Allojenik hematopoetik kök hücre nakli sonrası gelişen sitomegalovirüs (CMVCMV) enfeksiyonu nedeniyle gansiklovir tedavisi başlanan bir hastada, klinik yanıt alınamaması üzerine yapılan genetik incelemede viral UL97UL97 fosfotransferaz geninde mutasyon saptanmıştır. Bu hastada gansiklovir direncini aşmak amacıyla kullanılabilecek, etki mekanizması için viral bir kinaz tarafından fosforilasyona ihtiyaç duymayan pirofosfat analoğu aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Foskarnet

Cevap

Foskarnet; çünkü pirofosfat analoğu olup viral fosfotransferaz (UL97UL97) aktivitesine ihtiyaç duymadan doğrudan viral DNADNA polimerazı inhibe eder.
Foskarnet, viral DNADNA polimerazın pirofosfat bağlama bölgesine doğrudan bağlanarak reversibl non-kompetitif inhibisyon yapan bir pirofosfat analoğudur. Diğer birçok antivirallerin (asiklovir, gansiklovir vb.) aksine, hücre içinde aktif hale gelmesi için viral kinazlar (örneğin CMVCMV için UL97UL97 fosfotransferaz veya HSVHSV için timidin kinaz) tarafından fosforillenmesine gerek yoktur. Bu özelliği sayesinde viral kinaz mutasyonlarına bağlı gelişen direnç vakalarında (gansiklovire dirençli CMVCMV gibi) etkinliğini korur.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik tabloyu ve direnç mekanizmasını analiz et.
CMVCMV tedavisinde gansiklovir direncinin en yaygın sebebi UL97UL97 gen mutasyonudur.
Gansiklovirin aktifleşmesi (monofosforilasyon) için viral UL97UL97 fosfotransferaz enzimi şarttır.
2
İlaç sınıflarını ve aktivasyon gereksinimlerini karşılaştır.
Foskarnet bir pirofosfat analoğudur; gansiklovir ve sidofovir ise nükleozid/nükleotid analoglarıdır.
Pirofosfat analogları yapısal olarak aktif olduklarından viral kinazlara bağımlı değildirler.
3
Soru kökündeki spesifik tanıma uyan ilacı seç.
Hem pirofosfat analoğu olan hem de UL97UL97 bağımsız etki gösteren ilaç foskarnettir.
Sidofovir de UL97UL97 bağımsızdır ancak nükleotid analoğudur, pirofosfat analoğu değildir.

Anahtar Kavram

Antiviral ilaçların aktivasyon basamakları ve direnç mekanizmaları arasındaki farklar.
Soru 325Soru

İnsan immün yetmezlik virüsü tip 1 (HIV1HIV-1) replikasyon döngüsü sırasında, yeni sentezlenen gp120gp120 zarf glikoproteininin endoplazmik retikulum (ERER) içerisinde konak hücreye ait CD4CD4 reseptörleri ile kompleks oluşturup hapsolmasını (sequestration) önleyen; CD4CD4 moleküllerini ERER bağımlı protein yıkımı (ERADERAD) yoluyla sitozolik proteazomlara yönlendirerek ortadan kaldıran viral aksesuar protein aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Vpu

Cevap

Vpu proteini, HIV1HIV-1 replikasyonunda ERER düzeyinde CD4CD4 moleküllerinin yıkımını sağlayarak gp120gp120 ile erken etkileşimi önler.
Vpu proteini, HIV1HIV-1 enfeksiyonunda CD4CD4 reseptörlerinin endoplazmik retikulumda (ERER) hapsolmasını önlemek için ERADERAD (ER-associated degradation) mekanizmasını kullanarak CD4CD4 moleküllerini parçalatır. Bu sayede gp120gp120 glikoproteini serbest kalır ve hücre yüzeyine taşınabilir.

Adım Adım Çözüm

1
Viral replikasyon sırasında ERER düzeyindeki protein etkileşimlerini değerlendir.
HIV1HIV-1 hem gp120gp120 (zarf proteini) hem de CD4CD4 (reseptör) sentezini tetikler; bu ikisi ERER içerisinde karşılaştığında birbirine bağlanarak virüsün olgunlaşmasını engelleyebilir.
Virüsün enfektif partiküller oluşturabilmesi için gp120gp120'nin serbest kalması gerekir.
2
Aksesuar proteinlerin CD4CD4 üzerindeki spesifik etki mekanizmalarını ayırt et.
Nef proteini yüzeydeki CD4CD4'ü endozomal yolla yok ederken, Vpu proteini ERER aşamasındaki CD4CD4'ü hedef alır.
Vpu, CD4CD4'ün sitoplazmik kuyruğuna bağlanarak onu ubiquitin ligaz kompleksine (SCFVpu/TrCPSCF^{Vpu/TrCP}) bağlar.
3
ERADERAD mekanizmasıyla ilişkiyi kur.
Vpu aracılı ubiquitination, CD4CD4'ün ERER'den sitozole geri translokasyonuna ve proteazomlarda yıkılmasına (ERADERAD) neden olur.
Bu süreç, gp120gp120'nin ERER'den Golgi'ye ve hücre yüzeyine sorunsuz taşınmasını sağlar.

Anahtar Kavram

HIV1HIV-1 Vpu proteini, 'CD4 downregulation' yaparak viral gp120gp120 ile ERER içinde hapsolmayı önler ve tetherin antagonizması ile viral salınımı artırır.

Daha Fazla Pratik

Vpu'nun diğer görevi olan 'tetherin (BST-2) antagonizması' ve bunun viral tomurcuklanma üzerindeki etkisini inceleyebilirsiniz.
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 326Soru

Retrovirüslerin, özellikle de HIV1HIV-1'in replikasyon döngüsünde ve gen ekspresyonunda merkezi rol oynayan LTR (Long Terminal Repeat) bölgelerinin yapısal ve fonksiyonel organizasyonu ile ilgili aşağıdakilerden hangisi yanlıştır?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Viral genomun kapsid içerisine paketlenmesini sağlayan "Psi" (ψ\psi) sinyali, 55' LTR içerisindeki U5U5 bölgesinin nükleotit dizileri tarafından oluşturulur.

Cevap

Viral genomun paketlenmesini sağlayan Psi (ψ\psi) sinyali, LTR bölgesinin içinde değil, 55' LTR'den sonra gelen lider dizide yer almaktadır.
Retrovirüslerde (özellikle HIV1HIV-1) paketleme sinyali olan "Psi" (ψ\psi), viral RNA'nın kapsid içine seçici olarak alınmasını sağlar. Bu sinyal, 55' LTR'nin hemen aşağısında (downstream), lider dizi (5' UTR) içinde, genellikle U5U5 ile gaggag geni başlangıç kodonu arasında bulunur. Dolayısıyla bu sinyalin LTR'nin (U5U5 bölgesi) içinde yer aldığı ifadesi yanlıştır.

Adım Adım Çözüm

1
LTR yapısını analiz et
Retroviral LTR; U3U3 (Unique 3'), RR (Repeat) ve U5U5 (Unique 5') olmak üzere üç alt birimden oluşur.
LTR'nin fonksiyonel haritasını çıkarmak için alt birimlerin yerini bilmek gerekir.
2
Transkripsiyon kontrol noktalarını belirle
Transkripsiyon 55' LTR'deki U3/RU3/R sınırında başlar ve mRNA'nın başına RR dizisi gelir. Enhancer ve promotör dizileri U3U3 içerisindedir.
Viral RNA sentezinin nasıl başladığını anlamak seçenekleri değerlendirmeyi sağlar.
3
Paketleme sinyalinin (Psi) konumunu doğrula
Psi (ψ\psi) sinyali, 55' LTR'nin bitiminden (U5U5'in sonu) hemen sonra, gaggag geni başlamadan önceki nükleotit dizilerindedir.
Lider dizinin (leader sequence) LTR'den ayrı bir fonksiyonel birim olduğunu saptamak hatalı seçeneği buldurur.

Anahtar Kavram

Retroviral LTR Organizasyonu ve Fonksiyonel Segmentleri
Tahmini Süre:2m 0s
Soru 327Soru

Retrovirüslerin konak hücre savunma mekanizmalarından kaçış stratejileri kapsamında; makrofaj ve dendritik hücreler gibi miyeloid seri hücrelerde bulunan, hücresel deoksinükleozid trifosfat (dNTPdNTP) havuzunu hidroliz ederek viral DNADNA sentezini baskılayan SAMHD1 restriksiyon faktörünü proteazomal yıkıma uğratan aksesuar protein hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: VpxVpx

Cevap

Retroviral protein VpxVpx, miyeloid hücrelerdeki SAMHD1SAMHD1 restriksiyon faktörünü yıkarak viral DNADNA sentezi için gerekli dNTPdNTP düzeyini korur.
Doğru seçenek olan protein, HIV2HIV-2 ve bazı SIVSIV suşlarında bulunan, miyeloid hücrelerdeki (makrofaj ve dendritik hücreler) nükleotid havuzunu kısıtlayarak enfeksiyonu engelleyen SAMHD1SAMHD1 restriksiyon faktörünü proteazomal yıkıma uğratan VpxVpx’tir. Bu sayede virüs, bölünmeyen hücrelerde bile ters transkripsiyonu gerçekleştirebilir.

Adım Adım Çözüm

1
Konak hücre restriksiyon faktörünün (SAMHD1) işlevini belirle.
SAMHD1SAMHD1, dNTPdNTP’leri parçalayarak havuzu kurutur ve viral ters transkripsiyonu durdurur.
Miyeloid hücreler (makrofaj/DC) bu mekanizmayla retroviral enfeksiyona karşı direnç gösterir.
2
Hangi virüsün bu engeli aştığını ve hangi proteini kullandığını hatırla.
HIV2HIV-2 (ve SIVSIV), VpxVpx proteini aracılığıyla bu engeli aşar.
HIV1HIV-1 bu proteine sahip olmadığı için dendritik hücreleri enfekte etmede daha az verimlidir.
3
Protein ve mekanizma eşleşmesini doğrula.
VpxVpx \rightarrow SAMHD1SAMHD1 degradasyonu.
VpxVpx, CRL4DCAF1CRL4-DCAF1 E3E3 ubiquitin ligaz kompleksi üzerinden SAMHD1SAMHD1’i proteazoma yönlendirir.

Anahtar Kavram

VpxVpx proteininin SAMHD1SAMHD1 restriksiyon faktörünü antagonize etmesi (HIV1HIV-1 ve HIV2HIV-2 arasındaki temel farklardan biri).
Soru 328Soru

Retrovirüslerin replikasyon döngüsünde, virion içerisinde hazır olarak bulunan ve tek iplikli viral RNARNA genomunu kalıp kullanarak çift iplikli proviral DNADNA sentezini katalizleyen temel enzim aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Revers transkriptaz

Cevap

Revers transkriptaz
Revers transkriptaz (ters transkriptaz), retrovirüslerin (örneğin HIVHIV, HTLVHTLV) replikasyon döngüsünde viral RNARNA'yı kalıp olarak kullanarak sitoplazmada çift iplikli DNADNA (provirusprovirus) sentezini gerçekleştiren temel enzimdir. Bu enzim virion içerisinde paketlenmiş olarak bulunur.

Adım Adım Çözüm

1
Viral genom tipinin belirlenmesi
Retrovirüsler tek iplikli (+) polariteli RNARNA genomuna sahiptir.
Replikasyon stratejisini anlamak için başlangıç nükleik asit tipi bilinmelidir.
2
Replikasyonun ilk aşamasındaki enzimatik aktivitenin tespiti
Viral RNARNA kalıbı üzerinden bir RNARNA-DNADNA hibridi ve ardından çift iplikli DNADNA sentezlenir.
Retrovirüslerin yaşam döngüsünde 'provirus' oluşumu için RNARNA'nın DNADNA'ya dönüştürülmesi şarttır.
3
Sentezi gerçekleştiren enzimin isimlendirilmesi
Bu süreci yöneten enzim 'revers transkriptaz' (ters transkriptaz) enzimidir.
Santral dogma kurallarının aksine RNARNA'dan DNADNA sentezlediği için bu isimle anılır.

Anahtar Kavram

Retrovirüslerde proviral DNADNA sentezi, virion içindeki revers transkriptaz enzimi aracılığıyla gerçekleşir.

Alternatif Yöntem

Retrovirüs kelimesindeki 'retro' ön ekinin, genetik bilginin geleneksel akışının (DNARNADNA \rightarrow RNA) tersine (RNADNARNA \rightarrow DNA) işlemesini temsil ettiğini hatırlamak, ters transkriptaz enzimini bulmayı kolaylaştırır.
Tahmini Süre:45s
Soru 329Soru

Beş yaşında bir çocuk, gövdesinde ve kollarında inci benzeri, ortası göbekli (umbilike), ağrısız papüllerle getirilmiştir. Lezyonların histopatolojik incelemesinde sitoplazmik inklüzyon cisimcikleri (Henderson-Paterson cisimcikleri) saptanmıştır.

Bu klinik tabloya neden olan virüs ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Replikasyon döngüsünü tamamen konak hücre sitoplazmasında gerçekleştirir.

Cevap

Molluscum contagiosum virüsü, Poxviridae ailesinin bir üyesi olarak replikasyonunu konak hücrenin sitoplazmasında gerçekleştirir.
Molluscum contagiosum virüsü, Poxviridae ailesine aittir. Bu ailedeki virüsler, viral genomun transkripsiyonu için gerekli olan DNADNA bağımlı RNARNA polimeraz enzimini virion içinde taşıdıkları için, replikasyon döngülerinin tamamını konak hücrenin sitoplazmasında gerçekleştirebilirler. Bu özellik, diğer çoğu DNADNA virüsünün replikasyon için çekirdeğe ihtiyaç duyması nedeniyle önemli bir ayırıcı tanı kriteridir.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik bulguları analiz etme
İnci benzeri, göbekli papüller ve Henderson-Paterson cisimcikleri Molluscum contagiosum tanısını koydurur.
Molluscum contagiosum, Poxviridae ailesine ait bir virüstür ve bu bulgular patognomoniktir.
2
Etken virüsün taksonomik özelliklerini belirleme
Poxviridae ailesi; çift iplikli DNADNA genomuna sahip, kompleks simetrili, zarflı ve sitoplazmada replike olan virüslerdir.
Poxvirüsler, kendi transkripsiyon enzimlerini (DNA bağımlı RNA polimeraz) taşıdıkları için çekirdeğe ihtiyaç duymadan sitoplazmada çoğalabilirler.

Anahtar Kavram

Poxvirüslerin (MolluscumMolluscum contagiosumcontagiosum) ayırıcı özellikleri ve sitoplazmik replikasyonu

Daha Fazla Pratik

Poxviridae ailesindeki diğer üyelerin (örneğin Variola veya Vaccinia) replikasyon döngülerini ve Guarnieri cisimciklerini inceleyebilirsiniz.
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 330Soru

Nörodejeneratif süreçlerin araştırıldığı bir çalışmada, enfeksiyöz bir ajanın nükleazlarla (DNAseDNAse ve RNAseRNAse) muamele edildikten sonra enfektivitesini koruduğu, ancak proteazlarla uzun süreli muamele sonrası enfektivitesinin azaldığı gözlenmiştir. Bu ajanın patogenezinde rol oynayan yapısal dönüşüm ve direnç özelliklerine ilişkin aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Enfeksiyöz form (PrPscPrP^{sc}), normal hücresel formun (PrPcPrP^{c}) post-translasyonel konformasyonel değişikliği sonucu yüksek β\beta-tabaka içeriği kazanmasıyla oluşur.

Cevap

Enfeksiyöz prion formunun (PrPscPrP^{sc}), normal hücresel proteinin (PrPcPrP^{c}) post-translasyonel düzeyde konformasyonel değişime uğrayarak β\beta-tabaka açısından zenginleşmesiyle oluşmasıdır.
Prion hastalıklarında patogenez, normalde sinir hücrelerinde bulunan ve baskın olarak α\alpha-heliks yapısında olan PrPcPrP^{c} proteininin, bilinmeyen bir tetikleyici veya enfeksiyöz bir temas sonucu β\beta-tabaka içeriği yüksek olan PrPscPrP^{sc} formuna dönüşmesidir. Bu post-translasyonel değişim proteinin çözünürlüğünü azaltır, proteazlara direncini artırır ve hücre içinde birikerek nörodejenerasyona yol açar.

Adım Adım Çözüm

1
Etkenin nükleaz direnci ve proteaz hassasiyetini değerlendir.
Etkenin nükleik asit içermeyen, sadece protein yapısında bir ajan (prion) olduğu anlaşılır.
Prionlar nükleik asit içermedikleri için DNAse ve RNAse'den etkilenmezler ancak protein oldukları için proteazlardan (kısmen de olsa) etkilenirler.
2
Normal ve patojenik form arasındaki biyokimyasal farkı analiz et.
PrPcPrP^{c} (alfa-heliks zengin) ile PrPscPrP^{sc} (beta-tabaka zengin) arasındaki yapısal dönüşüm belirlenir.
Prion patogenezinin temeli, normal proteinin üç boyutlu yapısının değişerek erimeyen ve proteaza dirençli beta-tabaka formuna dönüşmesidir.
3
Ajanın direnç ve inflamasyon özelliklerini kontrol et.
UV direnci, inflamasyon yokluğu ve standart dezenfektanlara direnç özellikleri doğrulanır.
Prionlar konak tarafından kodlanan proteinler oldukları için bağışıklık sistemi tarafından 'yabancı' olarak algılanmazlar ve inflamasyon oluşturmazlar.

Anahtar Kavram

Prion proteinlerinin (PrPcPrPscPrP^{c} \to PrP^{sc}) konformasyonel dönüşümü ve buna bağlı gelişen fizikokimyasal direnç.

Daha Fazla Pratik

Prionların inaktivasyonu için gereken spesifik fiziksel ve kimyasal parametreleri (sıcaklık, molarite) gözden geçirin.
Tahmini Süre:2m 0s
Soru 331Soru

Kronik Hepatit BB (HBVHBV) tanısıyla pegile-interferon-alfa (PEGIFNαPEG-IFN-\alpha) tedavisi başlanan bir hastada, bu ilaç konak hücrede bir dizi antiviral proteinin sentezini indükleyerek etki gösterir. Bu proteinler arasında yer alan ve çift sarmallı RNA (dsRNAdsRNA) tarafından aktiflenen **protein kinaz R (PKRPKR)**, viral replikasyonu engellemek amacıyla aşağıdaki faktörlerden hangisini fosforilleyerek viral protein sentezini (translasyonu) durdurur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Ökaryotik başlangıç faktörü 2 (eIF2eIF-2)

Cevap

İnterferon-alfa tarafından indüklenen protein kinaz R (PKR), ökaryotik başlangıç faktörü 2'yi (eIF-2) fosforilleyerek translasyonu inhibe eder.
İnterferon-alfa tedavisi sırasında konak hücrede indüklenen protein kinaz R (PKR), viral replikasyonun bir yan ürünü olan çift sarmallı RNA (dsRNA) ile karşılaştığında aktifleşir. Aktifleşen PKR, ökaryotik başlangıç faktörü 2'nin (eIF-2) alfa alt birimini fosforilleyerek inaktive eder. Bu durum, protein sentezinin başlama kompleksinin oluşumunu engelleyerek viral protein üretimini durdurur.

Adım Adım Çözüm

1
İlacın (PEG-IFN-alfa) temel etki mekanizmasını tanımla.
İnterferonlar, konak hücrede antiviral bir durum (antiviral state) oluşturmak için PKR ve 2',5'-oligoadenilat sentetaz gibi proteinlerin sentezini indükler.
İnterferonlar doğrudan antiviral etki göstermek yerine, hücreyi virüs replikasyonuna karşı dirençli hale getiren genleri aktive ederler.
2
PKR'nin (Protein Kinaz R) aktivasyon ve etki yolunu analiz et.
PKR, viral replikasyon sırasında oluşan çift sarmallı RNA (dsRNA) varlığında aktifleşir.
dsRNA, virüs enfeksiyonunun bir göstergesidir ve PKR'nin konformasyonel değişikliğe uğrayarak aktifleşmesini sağlar.
3
Aktifleşen PKR'nin spesifik hücresel hedefini belirle.
Aktif PKR, ökaryotik başlangıç faktörü 2'nin (eIF-2) alfa alt birimini fosforiller.
Bu fosforilasyon, eIF-2'nin geri dönüşümünü engelleyerek translasyonun başlama aşamasında durmasına neden olur.

Anahtar Kavram

İnterferonlar, PKR aracılığıyla eIF-2'yi fosforilleyerek translasyonu, 2',5'-oligoadenilat sentetaz ve RNase L aracılığıyla ise mRNA degradasyonunu sağlayarak viral replikasyonu inhibe ederler.
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 332Soru

Deneysel bir çalışmada, bir nörodejeneratif hastalık etkeninin biyofiziksel özellikleri incelenmektedir. İncelenen ajanın nükleazlara (DNAse/RNAse) dirençli olduğu, ancak 1M1\,M NaOHNaOH (sodyum hidroksit) ve 134C134^\circ C'de otoklavlama kombinasyonu ile inaktive edilebildiği saptanmıştır. Bu ajanın patogenezi ve yapısı ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Patojenin enfektif gücü, ikincil yapısındaki α\alpha-heliks oranının β\beta-tabaka (beta-sheet) formuna dönüşmesiyle kazanılır.

Cevap

Patojenin enfektif gücü, ikincil yapısındaki α\alpha-heliks oranının β\beta-tabaka formuna dönüşmesiyle kazanılır.
Doğru ifade, patojenin enfektif gücünün ikincil yapısındaki α\alpha-heliks oranının β\beta-tabaka formuna dönüşmesiyle kazanılmasıdır. PrP^C formunda yaklaşık %40 α\alpha-heliks ve çok az β\beta-tabaka bulunurken, enfektif PrP^{Sc} formunda β\beta-tabaka oranı %45'in üzerine çıkar. Bu yapısal değişim, ajanın fizikokimyasal direncini sağlayan temel unsurdur.

Adım Adım Çözüm

1
Ajanın özelliklerini tanımlama
Nükleaz direnci ve ekstrem sterilizasyon koşullarına (NaOH + yüksek ısı) ihtiyaç duyulması, etkenin bir 'prion' olduğunu gösterir.
Konvansiyonel virüsler nükleazlara duyarlıdır ve standart otoklavlama ile inaktive olurlar; prionlar ise nükleik asit içermez ve çok dirençlidir.
2
Moleküler yapıyı analiz etme
Prion patogenezinde PrP^C'nin α\alpha-heliks yapısının azalıp β\beta-tabaka yapısının arttığı belirlenir.
Bu yapısal değişim (misfolding), proteinin çözünmez hale gelmesine, agregat oluşturmasına ve proteazlara direnç kazanmasına neden olur.
3
Konak ilişkisini değerlendirme
Prionun konak genomundaki PRNP geni tarafından kodlandığı ve inflamatuar yanıt oluşturmadığı teyit edilir.
Endojen bir protein olduğu için immün sistem tarafından yabancı olarak tanınmaz.

Anahtar Kavram

Prion proteinlerinin konformasyonel değişimi ve biyofiziksel direnç mekanizmaları.
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 333Soru

ABD'nin batı bölgelerinde (Rocky Mountains) kamp yapan 2929 yaşındaki bir erkek hasta, tatilden döndükten 55 gün sonra ani başlayan ateş, titreme ve şiddetli miyalji şikayetleriyle başvuruyor. Ateşi 22 gün sürdükten sonra düşen hastada, 4848 saatlik bir iyilik halini takiben semptomların daha şiddetli şekilde tekrarladığı (bifazik seyir) görülüyor. Laboratuvar bulgularında belirgin lökopeni (2.400/mm32.400/mm^3) saptanıyor. Hastadan izole edilen etkenin; çift iplikli ve 1212 segmentli bir RNA genomuna sahip olduğu, nükleokapsidinin ikozahedral simetride olduğu ve zarfsız bir yapı sergilediği saptanıyor. Bu virüsün biyolojik özellikleri ve replikasyon stratejisi düşünüldüğünde, aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Segmentli genom yapısı, hücrede eş zamanlı enfeksiyon (koinfeksiyon) durumunda genetik yeniden düzenlenime (reassortment) olanak sağlar.

Cevap

Segmentli genom yapısı, hücrede eş zamanlı enfeksiyon (koinfeksiyon) durumunda genetik yeniden düzenlenime (reassortment) olanak sağlar.
Doğru yanıt olan seçenek, segmentli genom yapısının temel biyolojik sonucunu ifade etmektedir. Reoviridae ailesi, Influenza (Orthomyxoviridae), Bunyaviridae ve Arenaviridae gibi segmentli genom taşır. Bu yapı, aynı hücrede iki farklı suş bulunduğunda segmentlerin karışarak yeni suşlar oluşturmasına (reassortment/genetik yeniden düzenlenim) imkan tanır. Coltivirus, 1212 segmentli yapısıyla bu grubun tipik bir örneğidir.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik ipuçlarını değerlendir (Rocky Mountains, bifazik ateş, lökopeni).
Etkenin Reoviridae ailesinden Colorado Kene Ateşi Virüsü (Coltivirus) olduğu saptanır.
Bifazik ateş ve coğrafi bölge kene ile bulaşan bu virüs için karakteristiktir.
2
Verilen mikrobiyolojik özellikleri analiz et (1212 segmentli dsRNA, zarfsız).
Genomun 1212 segmentli çift iplikli RNA olduğu teyit edilir.
Reoviridae ailesinde Rotavirus 1111, Orbivirus 1010, Coltivirus ise 1212 segmente sahiptir.
3
Segmentli genomun genetik sonuçlarını hatırla.
Segmentli yapı genetik yeniden düzenlenime (reassortment) izin verir.
Segmentli genomlar, koinfeksiyon sırasında parçaların yer değiştirmesiyle antijenik değişimlere yol açabilir.

Anahtar Kavram

Segmentli RNA virüslerinde genetik yeniden düzenlenim (reassortment) mekanizması.
Soru 334Soru

64 yaşında bir erkek hasta, son üç ayda hızla ilerleyen demans, ataksi ve miyoklonik sıçramalar şikayetiyle nöroloji polikliniğine başvuruyor. Hastanın beyin biyopsisinde nöronal kayıp ve nöropilde karakteristik vakuolizasyon (spongiform değişim) izlenirken, herhangi bir inflamatuar hücre infiltrasyonu saptanmıyor. Bu klinik ve patolojik tabloya neden olan etkenle ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Yapısal olarak normal hücresel proteinden daha fazla β\beta-tabakalı konformasyon içerir.

Cevap

Yapısal olarak normal hücresel proteinden daha fazla beta-tabakalı konformasyon içerir.
Doğru seçenekte belirtilen ifade prionların temel patolojik mekanizmasını açıklar. Normalde hücre yüzeyinde bulunan PrPCPrP^C proteini çoğunlukla α\alpha-heliks yapısındayken, hastalık durumunda bu yapı değişerek yüksek oranda β\beta-tabakalı yapı içeren PrPScPrP^{Sc} formuna dönüşür. Bu yapısal değişim, ajanın dokularda birikmesine ve bilinen fiziksel/kimyasal etkenlere karşı aşırı direnç kazanmasına neden olur.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik verilerin analizi
Hızlı ilerleyen demans, miyoklonus ve biyopsinde inflamasyonsuz spongiform değişim prion hastalıklarını (örn. Creutzfeldt-Jakob Hastalığı) işaret eder.
Bu bulgular prionların karakteristik nöropatolojik özellikleridir.
2
Etkenin biyokimyasal özelliklerinin değerlendirilmesi
Prion patogenezinde temel olay PrPCPrP^C (alfa-heliks ağırlıklı) proteininin PrPScPrP^{Sc} (beta-tabaka ağırlıklı) formuna dönüşmesidir.
Beta-tabakalı yapı, proteinin agregasyonuna ve enzim/sterilizasyon direncine neden olur.

Anahtar Kavram

Prionlar nükleik asit içermeyen, konak kökenli proteinlerin yapısal değişikliği (α\alpha-heliks \rightarrow β\beta-tabaka) ile oluşan, immün yanıt oluşturmayan enfeksiyöz ajanlardır.

Daha Fazla Pratik

Prionların inaktivasyonu için gereken spesifik sodyum hidroksit (NaOH) konsantrasyonlarını ve sürelerini gözden geçirebilirsiniz.
Tahmini Süre:1m 15s
Soru 335Soru

19 yaşındaki bir üniversite öğrencisi; bir haftadır devam eden yüksek ateş, şiddetli boğaz ağrısı ve halsizlik şikayetleri ile başvurmuştur. Fizik muayenede eksüdatif tonsillit, generalize lenfadenopati ve splenomegali saptanmıştır. Laboratuvar incelemelerinde periferik yaymada sitoplazması eritrositlerin çevresini saran 'atypik lenfositler' (Downey hücreleri) görülmüş ve heterofil antikor testi pozitif sonuçlanmıştır. Bu klinik tabloya neden olan virüsün yapısal özellikleri ile ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Zarflı bir yapıya sahiptir ve ikozahedral kapsid simetrisi gösterir.

Cevap

Doğru seçenek; virüsün zarflı bir yapıya sahip olduğunu ve ikozahedral kapsid simetrisi gösterdiğini belirten ifadedir.
Klinik tabloda tarif edilen etken Epstein-Barr virüsüdür (EBV). EBV, bir Herpesviridae ailesi üyesidir. Tüm herpesvirüsler gibi EBV de ikozahedral kapsid simetrisi gösteren, nükleus membranından tomurcuklanarak kazandığı bir zarfa sahip olan ve doğrusal çift iplikli DNA genomu içeren bir virüstür.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik bulguları analiz et
Genç erişkin hasta, ateş, farenjit, lenfadenopati ve splenomegali triadı ile birlikte atypik lenfositler ve pozitif heterofil antikor testi (Monospot) Enfeksiyöz Mononükleoz (Öpücük Hastalığı) tablosunu işaret eder.
Bu bulgular Epstein-Barr virüsü (EBV) enfeksiyonu için patognomoniktir.
2
Etken virüsü sınıflandır
EBV, Herpesviridae ailesinin Gamma-herpesvirinae alt grubuna ait bir virüstür.
Herpesvirüslerin genel yapısal özellikleri doğru seçeneği belirlemek için gereklidir.
3
Herpesvirüslerin yapısal özelliklerini hatırla
Herpesvirüsler; doğrusal çift iplikli DNA (dsDNAdsDNA) genomuna sahip, ikozahedral kapsid simetrili ve zarflı virüslerdir.
Seçenekler arasından bu yapısal özelliklerle eşleşen ifade doğru cevaptır.

Anahtar Kavram

Herpesviridae ailesinin (EBV dahil) yapısal özellikleri: Zarflı, ikozahedral simetrili ve doğrusal dsDNA genomuna sahip olmaları.

Daha Fazla Pratik

Diğer Herpesvirüslerin (HSV, CMV, VZV) benzerliklerini ve klinik ayrım özelliklerini inceleyebilirsiniz.
Tahmini Süre:1m 15s
Soru 336Soru

Allojenik hematopoetik kök hücre nakli yapılmış bir hastada, nakil sonrası 4. ayda gansiklovire dirençli (viral DNADNA polimeraz enziminde mutasyon içermeyen) CMVCMV reaktivasyonu saptanmıştır. Bu hastanın tedavisinde kullanılan, viral UL97UL97 protein kinaz enzimini doğrudan inhibe ederek viral nükleer çıkışı (nuclearnuclear egressegress) bozan, ancak gansiklovirin aktivasyonu için gerekli olan ilk fosforilasyon basamağını engellediği için gansiklovir ile kombine edilmesi önerilmeyen ilaç aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Maribavir

Cevap

Maribavir, UL97UL97 protein kinaz enzimini doğrudan inhibe ederek gansiklovirin aktivasyonunu engellediği için gansiklovir ile birlikte kullanılmamalıdır.
Maribavir, CMVCMV'nin UL97UL97 protein kinaz enzimini doğrudan hedef alan yeni sınıf bir antiviraldir. Gansiklovir ise aktifleşmek için mutlaka bu viral UL97UL97 enzimine ihtiyaç duyar. Maribavir'in bu enzimi inhibe etmesi, eş zamanlı kullanılan gansiklovirin aktif formuna dönüşmesini engeller ve bu iki ilaç arasında belirgin bir antagonizmaya neden olur. Bu nedenle klinik pratikte kombine edilmeleri önerilmez.

Adım Adım Çözüm

1
Klinik senaryoyu ve direnç paternini değerlendirin.
Gansiklovire dirençli CMVCMV enfeksiyonunda UL97UL97 kinaz veya UL54UL54 DNADNA polimeraz mutasyonu olabilir. Soruda DNADNA polimerazda mutasyon olmadığı belirtilmiştir.
Bu durum direncin UL97UL97 kinaz mutasyonuna bağlı olduğunu düşündürür.
2
Gansiklovirin aktivasyon mekanizmasını hatırlayın.
Gansiklovir, viral UL97UL97 kinaz enzimi tarafından ilk fosforilasyon basamağından geçirilerek aktifleştirilir.
İlacın antivirallik kazanması için bu viral enzime bağımlılığı vardır.
3
Maribavirin etki mekanizmasını analiz edin.
Maribavir, viral UL97UL97 protein kinaz enzimini doğrudan ve kompetitif olmayan bir şekilde inhibe eder.
Bu etki nükleer çıkışı bozarak viral replikasyonu engeller.
4
İki ilacın kombine kullanımının sonucunu sentezleyin.
Maribavir UL97UL97 kinazını inhibe ettiği için, aynı ortamda bulunan gansiklovirin ilk fosforilasyon basamağı gerçekleşemez.
Bu durum farmakolojik bir antagonizmaya yol açar ve gansikloviri etkisiz kılar.

Anahtar Kavram

Antiviral ilaçlar arasındaki farmakodinamik antagonizma (UL97UL97 kinaz seviyesinde).
Tahmini Süre:2m 0s
Soru 337Soru

Viral yapısal bileşenler ve replikasyon stratejileri arasındaki genel kurallar dikkate alındığında; helikal (sarmal) kapsid simetrisine sahip olan negatif polariteli tek iplikçikli RNA (ssRNA()ssRNA(-)) virüsleri için aşağıdakilerden hangisi her zaman doğrudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Zarflı bir yapıya sahip olmaları ve virion içerisinde RNA'ya bağımlı RNA polimeraz (RdRpRdRp) enzimi bulundurmaları

Cevap

Helikal simetrili negatif polariteli RNA virüsleri zarflı yapıdadır ve yapısal olarak RNA'ya bağımlı RNA polimeraz enzimi içerirler.
Viroloji kurallarına göre, helikal (sarmal) nükleokapsid yapısına sahip olan tüm hayvan virüsleri zarflıdır. Ayrıca, negatif polariteli tek iplikçikli RNA (ssRNA()ssRNA(-)) genomu, konak hücrenin translasyon mekanizması (ribozomlar) tarafından doğrudan tanımaz. Bu virüslerin enfeksiyonu başlatabilmesi için genomlarını mRNAmRNA'ya çevirmeleri gerekir ve insan hücresinde bu işlemi yapacak bir enzim bulunmadığı için, virüs RNA'ya bağımlı RNA polimeraz (RdRpRdRp) enzimini virion içerisinde hazır olarak taşımak zorundadır.

Adım Adım Çözüm

1
Virüsün genom polaritesini analiz et.
Negatif polariteli RNA (ssRNA()ssRNA(-)), doğrudan ribozomlara bağlanamaz.
Genomun mRNAmRNA olarak işlev görebilmesi için önce pozitif ipliğe kopyalanması gerekir.
2
Gereken enzimatik ihtiyacı belirle.
Virion yapısında hazır RNA'ya bağımlı RNA polimeraz (RdRpRdRp) bulunmalıdır.
Konak hücrede RNA'yı kalıp olarak kullanan bir RNA polimeraz enzimi yoktur.
3
Kapsid simetrisi ve zarf ilişkisini değerlendir.
Helikal simetrili hayvan virüslerinin tamamı zarflıdır.
Virolojinin temel yapısal sınıflandırma kurallarına göre sarmal nükleokapsid yapısı daima bir zarf ile korunur.

Anahtar Kavram

Negatif polariteli RNA virüslerinin yapısal ve replikatif zorunlulukları

Alternatif Yöntem

Zarfsız-zarflı ayrımını yaparken 'helikal ise mutlaka zarflıdır' kuralını hatırlamak ve enzim gereksinimini 'negatif ise polimeraz şarttır' mantığıyla birleştirmek çözümü hızlandırır.
Tahmini Süre:1m 15s
Soru 338Soru

24 yaşında kadın hasta, dudak kenarında ağrılı ve veziküler karakterde lezyonlar şikayetiyle başvuruyor. Yapılan fizik muayene ve laboratuvar tetkikleri sonucunda Herpes simplex virüs (HSV1HSV-1) enfeksiyonu tanısı konulan hastaya asiklovir tedavisi planlanıyor. Bu ilacın antiviral etkinliğini gösterebilmesi için enfekte konak hücresinde gerçekleşmesi gereken ilk kritik aktivasyon basamağı aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Viral timidin kinaz enzimi aracılığıyla monofosfat formuna dönüştürülmesi

Cevap

Asiklovir'in antiviral etkinlik kazanması için gereken ilk basamak, viral timidin kinaz enzimi tarafından monofosfat formuna dönüştürülmesidir.
Asiklovir, herpes virüsleri tarafından kodlanan timidin kinaz enzimi için yüksek afiniteye sahiptir. Bu enzim, asikloviri asiklovir-monofosfata dönüştürür. Daha sonra konak hücreye ait kinazlar bu molekülü aktif trifosfat formuna taşır. Bu mekanizma ilacın sadece virüsle enfekte hücrelerde yoğunlaşmasını sağlar.

Adım Adım Çözüm

1
İlacın aktivasyon gereksinimini belirle
Asiklovir bir ön ilaçtır (prodrug) ve aktifleşmesi için fosforillenmelidir.
Asiklovir doğal haliyle DNA polimerazı inhibe edemez.
2
İlk fosforilasyon basamağını sorgula
İlk fosforilasyon (monofosfat oluşumu) sadece virüsle enfekte hücrelerde bulunan viral timidin kinaz (TK) ile gerçekleşir.
İlacın seçici toksisitesinin ve sadece enfekte hücrelerde çalışmasının temel nedeni budur.
3
Sonraki basamakları ve nihai etkiyi analiz et
Monofosfat formu, konak hücre kinazları tarafından di- ve trifosfat formuna dönüştürülür ve viral DNA polimerazı inhibe eder.
Trifosfat formu dGTP ile yarışarak DNA zincirine girer ve zincir uzamasını (chain termination) durdurur.

Anahtar Kavram

Asiklovir seçiciliği, ilk aktivasyon basamağının viral timidin kinaz enzimine bağımlı olmasından kaynaklanır.
Tahmini Süre:1m 15s
Soru 339Soru

Konak hücre kısıtlayıcı faktörlerine (restriction factors) karşı geliştirilen viral stratejiler kapsamında; HIV1HIV-1 suşlarında "tetherin" (BST2BST-2) molekülünü antagonize ederek viral partiküllerin hücre yüzeyinden salınımını sağlayan ve aynı zamanda yeni sentezlenen CD4CD4 reseptörlerini endoplazmik retikulumda yıkıma uğratan aksesuar protein aşağıdakilerden hangisidir?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Vpu

Cevap

Vpu proteini, hem CD4'ün ER'de yıkımını sağlar hem de tetherin (BST-2) proteinini inhibe ederek virüsün salınımını kolaylaştırır.
Doğru seçenek olan protein (VpuVpu), HIV1HIV-1 replikasyonunda iki kritik görevi üstlenir: Birincisi, konak hücrenin interferon ile indüklenen ve virionları hücre yüzeyinde tutan "tetherin" (BST2BST-2) proteinini antagonize ederek viral yayılımı sağlar. İkincisi, konak hüre yüzeyine çıkmaya çalışan yeni sentezlenmiş CD4CD4 reseptörlerini endoplazmik retikulum düzeyinde proteazomal sistemle (ERADERAD) yıkarak virüsün kendi reseptörüne takılmasını önler.

Adım Adım Çözüm

1
Konak hücre kısıtlayıcı faktörü ve viral antagonist eşleşmesini belirle.
Tetherin (BST2BST-2), virionların hücre yüzeyine hapsedilmesini sağlar; HIV1HIV-1 buna karşı VpuVpu proteinini kullanır.
VpuVpu proteininin temel fonksiyonlarından biri viral salınımı (release) artırmaktır.
2
CD4CD4 reseptör modülasyon mekanizmasını analiz et.
NefNef yüzeydeki CD4CD4'ü, VpuVpu ise endoplazmik retikulumdaki (yeni sentezlenen) CD4CD4'ü hedef alır.
Soruda belirtilen "endoplazmik retikulumda yıkım" ifadesi spesifik olarak VpuVpu işlevini işaret eder.

Anahtar Kavram

HIV-1 Vpu proteininin dual fonksiyonu: Tetherin (BST-2) inhibisyonu ve ER düzeyinde CD4 yıkımı.
Tahmini Süre:1m 30s
Soru 340Soru

Prionlar; klasik virolojik ve bakteriyolojik prensiplerle açıklanamayan, nükleik asit içermeyen enfeksiyöz ajanlardır. Bu ajanların biyokimyasal stabilitesi ve patogenezi incelendiğinde, aşağıdakilerden hangisi prionlar için karakteristik bir bulgudur?

Cevabı ve açıklamayı göster

Cevap: Normal hücresel proteinin konformasyonel değişimiyle oluşan yüksek oranda β\beta-tabakalı yapı içermeleri

Cevap

Prionlar için karakteristik olan bulgu, normal hücresel proteinin konformasyonel değişimi sonucunda yüksek oranda β\beta-tabakalı yapı içeren patojenik formun oluşmasıdır.
Prion hastalıklarının temelinde, normal bir hücre yüzeyi proteini olan PrPcPrP^c'nin, konformasyonel bir değişim geçirerek proteazlara dirençli, çözünmeyen ve agregasyon eğilimi yüksek olan PrPscPrP^{sc} formuna dönüşmesi yatar. Bu değişim sırasında proteinin ikincil yapısındaki α\alpha-heliksler azalırken β\beta-tabakalı yapıların oranı belirgin şekilde artar.

Adım Adım Çözüm

1
Prionların temel biyokimyasal bileşimini hatırla.
Prionların nükleik asit içermeyen, sadece proteinden oluşan ajanlar olduğu belirlendi.
Bu özellik, ajanların nükleazlara ve radyasyona olan direncini açıklar.
2
Normal ve patojenik prion proteinleri arasındaki yapısal farkı analiz et.
Normal PrPcPrP^c proteininde α\alpha-heliks yapısının baskın olduğu, patojenik PrPscPrP^{sc} formunda ise β\beta-tabakalı yapıların arttığı saptandı.
Patogenez, proteinin yanlış katlanması (misfolding) sürecine dayanır.
3
Konak-patojen etkileşimini ve direnç profilini değerlendir.
Prionların inflamasyon oluşturmadığı ve standart sterilizasyon yöntemlerine dirençli olduğu sonucuna varıldı.
Ajanın konak proteini kökenli olması bağışık yanıtın yokluğunu, β\beta-tabakalı yapı ise fiziksel dayanıklılığı açıklar.

Anahtar Kavram

Prion patogenezi ve yapısal konformasyon değişimi
Tahmini Süre:1m 15s
ÖncekiSayfa 17 / 23Sonraki
Viroloji — TUS - Tıpta Uzmanlık Sınavı — Sayfa 17 | Examkin